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Arul Jayaraman
文章数:5篇
菠菜
多组学揭示菠菜抗癌机制
文章以10%的添加量干预结肠癌小鼠26周,小鼠的肠道菌群发生显著变化。并且,多组学分析结果显示,菠菜的干预影响了小鼠亚油酸和丁酸酯代谢,以及与癌症相关的L -谷氨酸和N -乙酰神经氨酸变化。
菠菜
肠道菌群重塑
肠癌
宏基因组学
研究肠道菌群组成和功能的新兴计算工具和模型(综述)
高通量测序、质谱和其他组学分析平台的进步提高了我们生成大量数据的能力,从而能够探索微生物群落组成和功能的时间变化。方法和工具是阐明机制必需的,其可以对时序数据中的依赖性进行严格建模。纵向数据通常是稀疏且采样不均匀的,在确定统计显著性,跨不同数据类型进行归一化以及模型验证方面仍然存在不小的挑战。本综述重点介绍了用于分析时间序列微生物组和代谢组数据以及整合这些数据的模型和软件工具的最新发展。
宏基因组学
时间序列
建模
多组学
纵向差分丰度
趋化性
吲哚对肠道细菌的双相趋化作用
菌群在肠道内的空间分布,受到细菌对肠内代谢物的趋化性的影响。PNAS近期发表的一项研究表明,大肠杆菌对肠道内的代谢物吲哚的趋化反应是双相的,可能影响了细菌在肠道内的空间分布。
趋化性
吲哚
adaptation
chemoreceptors
flagella
肠道菌群代谢产物
Cell子刊:肠道菌群的色氨酸代谢物可抑制肝脏炎症反应
肠道菌群失调参与了脂肪肝的疾病进展,Cell Reports[IF:8.282]发表的最新研究,鉴定出被高脂饮食抑制的小鼠肠道菌群代谢产物,色胺和吲哚-3-乙酸,可调节肝脏炎症和细胞因子介导的脂肪生成,或许是潜在的非酒精性脂肪肝药物靶点。
肠道菌群代谢产物
肠道菌群
代谢组学
非酒精性脂肪肝
吲哚-3-乙酸
吲哚
PLoS ONE:菌群代谢产物吲哚如何抑制沙门氏菌
PLoS ONE[IF:2.806]近期发表的研究表明,肠道菌群可代谢色氨酸产生吲哚,吲哚可通过降低沙门氏菌的毒力基因表达而抑制后者在宿主体内及细胞内的定殖与入侵。
吲哚
PhoPQ双组分系统
鼠伤寒沙门氏菌
Kohar AB Kissoyan
Katja Dierking