High-throughput screening

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二代生理学

Nature Reviews：二代生理学方法-单细胞技术在微生态研究中显身手（综述）

生理学研究某一细胞在特定时间、生理化学条件下的功能，不能剥离环境单纯用基因组数据或代谢重建去描述。在微生物组的研究中，传统的生理学方法多取决于目标细菌是否能分离培养。Nature Reviews Microbiology发表综述，提出了二代生理学方法的概念并讨论了单细胞技术在微生物组研究中的应用以及与下游分析的结合。二代生理学方法具有采样非侵入性、观察非破坏性、以表型分析为基础、功能研究为目标的特点。作者提出如能大力推广二代生理学方法、进行广泛应用，则可使微生物组研究从相关性步入更为深入的因果、功能机理性研究。

二代生理学单细胞技术微生物组功能 Bacterial techniques and applications Cellular microbiology

感染性疾病诊断

Nature子刊：运用二代测序技术准确、快速诊断感染疾病

对血液中游离微生物DNA进行测序，有望作为非侵入性检测方法用于感染疾病检测。本研究分析并验证了二代测序技术运用于病原体检测的有效性，证明该技术在诊断感染性疾病方面准确、快速，适用于临床诊断。

感染性疾病诊断高通量基因测序 Genetic databases High-throughput screening Infectious-disease diagnostics

新引物扩展 18S rRNA 测序检测范围

作者针对单细胞真核生物和寄生虫等设计了新的 18S rRNA 扩增引物，大大提高了对这些物种的检测灵敏度，有助于更全面的认识微生物组。

扩增子 18s rRNA基因高通量测序 Eukaryotic pathogens Food and water safety

食品添加剂

【安全观察】毒理学项目中的食品化合物

① ToxCast是美国环保署的一项化合物毒性预测项目，是利用体外高通量筛选来识别潜在有毒化合物，并为基于大数据的计算预测奠定基础。② 本文比对来自毒理学项目和毒理学数据库的数据；由于有些化合物当下不再使用，因此通过人工处理精简信息，为毒性测试优先排序提供参考。③ 通过人工处理删除319种化合物，重新分类30%的化合物。④ 与食品相关的化合物包括直接食品添加剂、间接食品添加剂和农药残留；1154种在全球范围内认定与食品相关。

食品添加剂化学品/产品分类数据库高通量筛选 Food additive Indirect food additive