Søren M Karst

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文章数：3篇

Nature子刊：三代测序实现高精度的长读长扩增子测序

丹麦奥尔堡大学Mads Albertsen研究团队近日取得一项新成果，他们使用Nanopore或PacBio测序的独特分子标识技术完成了高精度长读长扩增子测序。相比于短读长测序技术，针对基因组长区域的高通量扩增子测序仍具有挑战性。在本研究中，研究人员开发了一种高通量扩增子测序方法，该方法结合了独特分子标识（UMIs）与牛津纳米孔技术（ONT）或Pacific Biosciences环形共有序列，可获得大基因组区域内高精度单分子共有序列。

分子标识牛津纳米孔技术长读长嵌合体单分子

微生物分类

Nature子刊：高通量&无偏差，分析微生物群落的新方法

小亚基核糖体RNA（SSU rRNA）基因，如细菌中的16S和真核生物的18S，是微生物的分子“身份证”，常用于微生物多样性和分类等研究。传统方法难以避免扩增引物偏倚性对结果的影响，而对SSU rRNA进行全长测序可以消除这种局限性，更准确的鉴定微生物。本期Nature Biotechnology[IF：41.667]发表的研究，通过巧妙的设计，用高通量方法获得高质量的SSU rRNA全长序列而无需特异引物。该方法或可在未来的菌群研究中得到广泛应用，强烈推荐。

微生物分类小亚基核糖体RNA 引物偏差高通量 Classification and taxonomy

厌氧分解池

FM：处理废弃活性污泥的厌氧分解池中的主要发酵细菌

这是一篇关注处理废弃活性污泥中的菌群的研究，特别推荐关注环境微生物的人士阅读。

厌氧分解池厌氧绳菌科废弃活性污泥 Robert E Beardmore Robert E Beardmore