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基因水平转移
文章数:9篇
肠道细菌
Cell:工业化加速了人肠道菌群中的基因转移
工业化影响了人类肠道生态系统,改变了微生物的组成和多样性。细菌基因组是否也能适应宿主种群的工业化,目前尚不清楚。Cell最新发表的文章,通过对工业化和非工业化地区的15个人群的肠道细菌进行分析,发现基因的水平转移(HGT)在近几代宿主的肠道菌群中积累,发生频率很高,而且工业化的生活方式与较高的HGT比率有关。即肠道细菌在适应宿主生活方式的基础上不断获得新的功能,较高速率的HGT可能与人类历史中工业化发展有关。
肠道细菌
基因水平转移
工业化
human gut microbiome
Industrialization
基因水平转移
转导组学——研究基因转移的组学新技术
水平基因转移(HGT)在微生物进化中起着重要作用,但是目前尚缺乏观察微生物群落中正在进行的HGT的方法。Microbiome近期发表一种“转导组学”测序方法,通过检测病毒类颗粒中的细菌来源DNA,检测微生态样本中正在进行的基因水平转移事件。该方法可用于检测主要肠道细菌类型间的HGT事件,对研究微生态进化、耐药基因转移等均具有重要参考价值。
基因水平转移
基因组测序
研究论文
转导组
基础研究
长穗偃麦草
Science:山东农业大学团队在小麦赤霉病抗性遗传育种研究中取得重要进展
2020年4月9日,山东农业大学孔令让团队在《Science》以 “First Release”的形式发表研究长文(Research Article),成功克隆了来源于长穗偃麦草的抗赤霉病主效基因Fhb7, 揭示了其抗病分子机理和遗传机理,并成功应用于小麦育种,在小麦抗赤霉病育种中取得了重大突破。同期,《Science》也刊登了该工作的点评文章。据相关数据统计,这是我国小麦研究领域首篇Science文章,也是我国小麦重要功能基因研究首篇CNS文章。该研究团队经过20年的持续研究,首先发现小麦近缘植物长穗偃麦草7E染色体长臂末端携带抗赤霉病主效基因,并将其命名为Fhb7,随后成功将该抗病基因转移至栽培小麦品种,明确了其在小麦抗病育种中的稳定抗性和潜在的应用价值。
长穗偃麦草
基因水平转移
远缘杂交
分子标记
DON毒素
抗性基因
纳米颗粒降低菌群中抗性基因的多样性和丰度
纳米科技真神奇!华东师范大学Xie Bing发现,纳米颗粒不仅可以杀菌,还能特异性的降低菌群中抗性基因的多样性和丰度。
抗性基因
纳米颗粒
Antibiotic resistance genes
Bacterial proliferation
Ion dissolution
宏基因组分析方法
培养富集+测序可揭示肠道细菌核心及附属基因
《Microbiome》上发表的一项最新研究,报道了结合液体培养与鸟枪法测序,可研究肠道菌群中低丰度细菌的基因组,并通过此方法鉴定出了阴沟肠杆菌及大肠杆菌的耐药基因,并可推断基因水平转移可能性。该方法对于研究肠道细菌耐药性以及获得方式具有参考价值。
宏基因组分析方法
Microbiome
antibiotic resistance
Pangenome
Metagenomics assembly comparative genomics
生物信息学工具
分析菌群基因水平转移的信息学工具
《Microbiome》近期发表的研究介绍了一种新的生物信息学分析工具——MetaCHIP,可以在不依赖于参考基因组的情况下,用于宏基因组测序数据分析,探索群落水平上的水平基因转移事件。
生物信息学工具
基因水平转移
Bioinformatics
HGT identification
horizontal gene transfer
合成生物学
合成生物学方法研究不可培养细菌的两个实例
Nature Microbiology的一篇观点文章中,提及了两项通过合成生物学方法研究菌群中不可培养细菌的实例。
合成生物学
不可培养的微生物
基因水平转移
CRISPR基因编辑系统
固氮酶
耐药基因
污水处理厂或为细菌耐药性防控重点
污水处理厂是抗菌素耐受基因积累和传播的主要场所之一。本研究通过在12座瑞士污水处理厂采样,发现耐受基因丰度和种类受菌群结构、处理过程等多种因素影响,而且存在发生耐受基因大规模转移的可能,强调了需要在耐药基因检测中考虑基因转移以及宿主致病性,值得参考。
耐药基因
污水处理厂
基因水平转移
Guido Rindi
Guido Rindi
抗生素耐药性
结合进化生物学研究临床相关耐药质粒(综述)
耐药性质粒是临床致病菌获得抗生素耐药性的重要途径。研究耐药质粒在宿主细菌中的持留机制对预测耐药性变化、研究响应耐药性管控措施意义重大。本文作者从进化生物学角度提出了耐药质粒持留的潜在机制,并总结了一系列研究质粒-宿主细菌互作的实验方法和手段,值得专业人士关注。
抗生素耐药性
耐药质粒
临床菌株
基因水平转移
antibiotic resistance