CRISPR Screen

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文章数：2篇

Cell子刊：CRISPR筛查鉴定大肠癌耐药驱动因子

利用CRISPR进行全基因组的正向遗传筛选是研究细胞环路和信号通路的有力工具，但将其应用于类器官的研究却受到技术限制的阻碍。发表在Cell Stem Cell的研究开发了一种利用全基因组CRISPR在人类肠道类器官中筛选肿瘤信号通路的方法。一些抑癌基因被确定为APC突变背景下TGF-β通路的负调控因子，包括SWI/SNF染色质重塑复合体的亚基。

结直肠癌 CRISPR Screen Organoids TGFB SWI/SNF

肝细胞癌(HCC)

全基因组CRISPR技术筛选肝癌“抑癌基因”：Nf1、Plxnb1、Flrt2和B9d1

① 过表达MYC的P53缺失小鼠胚胎肝祖细胞，进行全基因组基于CRISPR/Cas9的基因敲除筛选，裸鼠皮下移植含670000个单导RNAs （sgRNAs）的mGeCKOa慢病毒库感染p53−/−、Myc、Cas9肝细胞；② 利用肿瘤基因组图谱和COSMIC收集肝细胞癌（HCC）的数据；③ 高通量测序显示sgRNAs增加8倍以上；④ 鉴定出4个候选抑癌基因Nf1、Plxnb1、Flrt2和B9d1；⑤ RAS信号通过MAPK参与小鼠肝癌形成，Nf1水平下降、下游蛋白HMGA2水平增高与HCC生存期相关。

肝细胞癌(HCC) 全基因组肿瘤基因组图谱抑癌基因有丝分裂原激活的蛋白激酶