基础研究

类器官研究论文基础研究结直肠癌转移性结直肠癌

既往研究发现G蛋白偶联受体109A（GPR109A）在肠上皮细胞和天然免疫细胞表达，近期江南大学的孙嘉团队在Allergy: European Journal of Allergy and Clinical Immunology上发表的一项最新研究发现，在口服卵清蛋白（OVA）致敏诱导的小鼠食物过敏模型中，GPR109A缺乏会导致肠道屏障损害，并促进IL-33的产生和增强2型免疫反应，从而恶化食物过敏的症状。

食物过敏 Gpr109a 研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

儿童自闭症

国内团队：粪菌移植实验揭示儿童自闭症潜在病因机制

来自重庆医科大学附属儿童医院、国家儿童健康与疾病临床研究中心，儿童发育与疾病教育部重点实验室、陆军医科大学等团队合作开展的一项动物实验发现，肠道菌群可能是儿童自闭症发生过程中的重要病因。将自闭症儿童的肠道菌群移植到无菌小鼠中，不仅发现小鼠发生了自闭症样的行为，也发现血清代谢组以及相应蛋白表达的改变。

儿童自闭症研究论文基础研究菌群移植血清代谢组

菌群-免疫互作

Cell子刊：细菌毒素如何调节宿主免疫应答

细菌产生的基因毒素可造成真核细胞的DNA损伤，激活DNA损伤应答（DDR）。在IBD及结直肠癌患者中，可产生基因毒素的革兰氏阴性菌富集。Cell Reports上发表的一项最新研究，发现鼠伤寒沙门氏菌产生的伤寒毒素可在诱导DNA片段化及细胞衰老的同时，促进小鼠体内的抗炎应答，但在DSS诱导的结肠炎小鼠体内，伤寒毒素并未表现出相似的抗炎作用。

菌群-免疫互作研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）鼠伤寒沙门氏菌

大麦叶

国内团队：大麦叶通过菌群产物缓解结肠炎

大麦叶在中药中的应用历史悠久，对肠道功能具有潜在的促进作用。然而，其作用机制尚不清楚，中国农业大学陈芳团队的一项研究结果表明，大麦叶可促进肠道菌衍生物肌苷的产生，肌苷可通过PPARγ通路作用于结肠上皮细胞，进而对结肠起到保护作用，外源补充肌苷也可起到同样的效果，该研究发现一种新的可通过菌群衍生物肌苷治疗结肠炎的方案。

大麦叶肌苷 DSS结肠炎模型研究论文基础研究

AKK菌

Nature子刊：Akk菌诱导GLP-1分泌以改善小鼠的糖稳态

Nature Microbiology上发表的一项最新研究，发现Akk菌产生的一种蛋白——P9蛋白可通过与ICAM-2的直接作用，诱导GLP-1分泌及棕色脂肪组织的生热作用，从而改善小鼠的糖稳态及肥胖。

AKK菌研究论文基础研究啮齿动物（小鼠） GLP-1

菌群-免疫互作

1型自身免疫性多内分泌腺综合征患者的肠道菌群变化

1型自身免疫性多内分泌腺综合征（APS-1）是一种罕见的多器官自身免疫疾病，因AIRE基因突变导致免疫耐受丢失而导致，通常可表现出胃肠道症状。Journal of Allergy and Clinical Immunology上发表的一项最新研究，对比鉴定了APS-1患者的肠道菌群变化，并发现部分APS-1相关OTU与胃肠道症状及抗细胞因子自身抗体水平相关。经益生菌干预后，部分与胃肠道症状相关的OTU减少。

菌群-免疫互作自身免疫性多内分泌腺综合征研究论文基础研究队列研究

IBD治疗靶点

Science子刊：治疗IBD的新靶点

Science Advances上发表的一项最新研究，发现在对抗TNF及α4β7单抗治疗不应答的IBD患者的炎症结肠部位，ChemR23的表达显著上调，且与粘膜中性粒细胞的浸润相关。ChemR23激动性抗体可促进巨噬细胞的胞葬作用，并减少炎症部位的中性粒细胞浸润，从而缓解小鼠的急性结肠炎、慢性结肠炎及结肠炎相关结直肠癌。

IBD治疗靶点中性粒细胞慢性炎症研究论文基础研究

肿瘤相关细菌

Cell子刊：细菌易位促进大肠癌肝转移

原发肿瘤产生的因子促进“转移前生态位”（premetastatic niche，PMN）的形成，后者可促进肿瘤的转移。Cancer Cell上发表的一项最新研究发现，结直肠癌（CRC）原发灶中的特定细菌（如大肠杆菌）可破坏肠道血管屏障（GVB），并散播至肝脏促进PMN的形成，以增强对转移癌细胞的招募。在结直肠癌患者中，癌组织与癌旁组织的PV-1（GVB损伤标志物）表达水平均显著升高，并与细菌的肝脏易位、结直肠癌的远端转移及更短的无进展生存期相关。该研究揭示了肠道屏障受损及肠道细菌易位在结直肠癌转移中发挥的重要作用。

肿瘤相关细菌结直肠癌肝转移研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

功能配方

农大王军军：功能配方改善小鼠肠道菌群以缓解结肠炎

中国农业大学的王军军团队在Gut Microbes上发表的一项最新研究，开发了一种含有乳脂肪球膜、低聚果糖、低聚半乳糖的功能配方——CMFG。小鼠补充CMFG后，可通过改善肠道菌群组成并增加短链脂肪酸产生，以减少结肠巨噬细胞浸润及炎症因子水平，并增加结肠粘蛋白分泌以增强肠道屏障功能，从而缓解DSS诱导的结肠炎。

功能配方菌群-免疫互作研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

饮食-菌群互作

青春期吃太多糖，成年后可能记性不好？

生命早期摄入过多的糖可能影响肠道菌群，并损伤神经认知。Translational Psychiatry上发表的一项最新研究，发现青春期摄入过多的含糖饮料，可通过改变肠道菌群组成（使特定副拟杆菌物种富集）及功能，从而损伤大鼠成年后的记忆功能。

饮食-菌群互作肠-脑轴研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

克罗恩病

Nature：靶向gp130或可用于抗TNF治疗无效的克罗恩病

活化的髓系细胞与基质细胞的互作在克罗恩病的发病机制中十分关键，单核细胞浸润的增加与患者对抗TNF治疗的不应答相关。NOD2的功能缺失突变是克罗恩病的风险基因位点，可增加肠道狭窄的风险。来自Nature上发表的一项最新研究，发现在克罗恩病患者、健康人及斑马鱼模型中，NOD2的功能缺失突变可导致活化成纤维细胞及炎症巨噬细胞的稳态失调，表现为由WT1及STAT3等上游转录因子上调引起的异常活化相关转录组的表达增加，而NOD2缺陷导致的gp130家族基因（IL-11、IL-6、OSM等）的表达上调可能使克罗恩病患者对抗TNF治疗不应答。在斑马鱼模型中，gp130抑制剂bazedoxifene可显著缓解DSS诱导的肠道炎症，且抗炎作用在NOD2缺失个体中更为明显。该研究结果揭示了NOD2功能缺失突变驱动克罗恩病纤维化的新机制，并提示gp130抑制剂或可用于对抗TNF治疗不应答的克罗恩病患者的治疗。

克罗恩病研究论文 gp130 Nod2 单核细胞

西方饮食模式

父亲西式饮食，肥胖影响也可跨代

发表在《eLife》中的这项动物实验表明，雄性动物在接受高脂饮食导致肥胖以后，其后代肥胖风险增加，这可能是通过精子中的非小编码RNA导致的。另外本研究内容十分丰富，适合相关领域的研究者仔细阅读。

西方饮食模式研究论文基础研究动物实验肥胖

生酮饮食

上海交大张晨虹：生酮饮食对糖脂代谢、肠道菌群及代谢产物的影响

生酮饮食能引起肠道菌群的改变，对癫痫和一些神经退行性疾病有治疗作用，然而其对糖脂代谢的影响还没有定论。上海交大的张晨虹团队在mBio上发表的一项最新研究，在小鼠中发现两种常用的生酮饮食配方——KDR与KDH分别可诱导小鼠的胰岛素抵抗、血糖稳态失调及脂质积累，并可改变肠道菌群组成及代谢产物。人体临床试验中的生酮饮食配方（含72%脂肪和8%碳水化合物）也会诱导小鼠胰岛素抵抗及脂肪积累。该研究结果提示，将生酮饮食用于减肥和其他疾病的治疗时，应考虑到潜在的糖脂代谢紊乱的风险，并且需要进一步评估饮食中脂肪的来源和比例。

生酮饮食研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）葡萄糖耐受

肿瘤免疫治疗

中山大学：靶向DKK1或可增强PD-1单抗在结直肠癌中的疗效

Dickkopf 1（DKK1）与肿瘤进展相关。来自中山大学的丁培荣团队在Journal for ImmunoTherapy of Cancer上发表的一项最新研究，在错配修复缺陷（dMMR）结直肠癌患者中发现，肿瘤组织中的DKK1表达增加与复发及CD8+ T细胞的浸润减少相关，而血清DKK1表达增加与较差的PD-1单抗治疗效果相关。该研究结果提示，靶向DKK1或可恢复结直肠癌患者对PD-1单抗的应答。

肿瘤免疫治疗结直肠癌研究论文基础研究错配修复缺陷

具核梭杆菌

南方医院：具核梭杆菌分泌胞外囊泡以破坏肠道屏障

具核梭杆菌（Fn）分泌的胞外囊泡（FnEV）携带多种有害分子，影响肠道中的菌群-宿主互作，尤其是溃疡性结肠炎（UC）中的上皮稳态。南方医科大学南方医院的陈烨团队在Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现在细胞系及小鼠模型中，FnEV均可通过促进巨噬细胞的M1极化，并通过激活FADD-RIPK1-caspase 3信号通路以促进肠道上皮细胞的坏死性凋亡，从而破坏肠道上皮屏障。

具核梭杆菌 RIPK1 胞外囊泡肠道屏障 IBD

肠道免疫

发育早期的肠道CD8+ T细胞即大量活化，但功能较弱

Mucosal Immunology上发表的一项最新研究，发现在人体发育早期，肠道CD8+ T细胞的活化已被大量诱导，但其产生炎症因子及细胞毒性因子的能力较弱。该研究结果提示，生命早期CD8+ T细胞的功能缺失可能促进了在外界抗原暴露下的免疫耐受，但可能增加胃肠道病毒感染的风险。

肠道免疫免疫系统发育研究论文基础研究 CD8+ T细胞

菌群-免疫互作

克罗恩病相关共生致病菌降解丙酸盐，从而促进肠道炎症

克罗恩病患者的肠道粘膜中常见粘附侵袭性大肠杆菌（AIEC），且短链脂肪酸产生菌减少。Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现AIEC LF82菌株在体外及体内均可通过降解丙酸盐，从而抑制丙酸盐的抗炎作用。

菌群-免疫互作粘附侵袭性大肠杆菌克罗恩病研究论文基础研究

神经性厌食症

神经性厌食症患者的肠道菌群或不影响体重？

神经性厌食症患者的肠道菌群组成发生改变。Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现将神经性厌食症患者的粪菌移植给无菌小鼠后，相比于移植健康对照的粪菌，并未显著影响小鼠的体重、脂肪量及盲肠重量。

神经性厌食症基础研究研究论文啮齿动物（小鼠）

新冠病毒

Nature子刊：新冠病毒可能感染口腔细胞

尽管新冠病毒感染可导致味觉减退、口干及口腔黏膜损伤，但口腔是否参与新冠病毒的感染关联尚未明确。Nature Medicine上发表的一项最新研究，发现口腔粘膜及唾液中的上皮细胞可表达新冠病毒进入因子——如ACE2及TMPRSS，提示口腔是新冠病毒感染的重要部位，而唾液是新冠病毒传播的潜在途径。本结果对于新冠肺炎检测、感染机制研究都具有参考价值。

新冠病毒研究论文基础研究 ACE2 TMPRSS

IBD治疗药物

Nature子刊：基于结构设计具有抗炎活性的皮质抑素类似物

Nature Communications上发表的一项最新研究，基于NMR结构信息设计了皮质抑素类似物，可在体外表现出抗炎活性，并可缓解不同小鼠模型的结肠炎，同时相比于天然内皮抑素有着更好的血清稳定性及独特的受体结合特征，可能克服天然内皮抑素作为治疗药物的缺陷。

IBD治疗药物皮质抑素基础研究研究论文基于结构的药物设计

非酒精性脂肪性肝炎（NASH）

Nature：NASH发病新机制——CD8+ T细胞攻击自身细胞

在非酒精性脂肪型肝炎（NASH）中，代谢产物的积累导致肝脏的细胞应激及炎症，但造成肝脏损伤的机制尚未明确。来自Nature上发表的一项最新研究发现，在NASH小鼠模型及NASH患者中，均可观察到肝脏CXCR6+ CD8+ T细胞的增加，这群细胞由CD122+ T细胞在IL-15的诱导下产生，并可通过MHC-I非依赖性方式，对乙酸盐产生应答，并在胞外ATP的进一步刺激下杀伤自身细胞。该研究为NASH的发病机制提供了新的见解。

非酒精性脂肪性肝炎（NASH） CXCR6+ CD8+ T细胞自身反应性T细胞研究论文基础研究

手骨关节炎

湘雅医院：症状性手骨关节炎患者的肠道菌群变化

湘雅医院的雷光华团队与曾超团队在Arthritis and Rheumatology上发表的一项最新研究，对1388名受试者的肠道菌群进行分析，鉴定出了症状性手骨关节炎患者的肠道菌群组成及功能的变化。

手骨关节炎研究论文基础研究

菌群-免疫互作

清华大学：丁酸如何增强化疗抗癌疗效？

来自清华大学的郭晓欢团队在Cell Metabolism上发表的一项最新研究，发现肠道菌群代谢产生的丁酸盐可通过诱导ID2的表达，促进IL-12信号通路，从而直接增强小鼠CD8+ T细胞的抗肿瘤细胞毒性效应，以促进化疗药物奥沙利铂的抗癌疗效。在肿瘤患者中也可发现，对奥沙利铂应答的患者的血清丁酸盐含量显著升高。

菌群-免疫互作研究论文基础研究啮齿动物（小鼠） CD8+ T细胞

自身免疫性神经炎症

高盐饮食或能抑制自身免疫性神经炎症

自身免疫性神经炎症高盐饮食血脑屏障（BBB）皮质酮研究论文

念珠菌感染

Nature子刊：当阴道上皮细胞遇到阴道念珠菌会如何反应？

本研究通过先进的体外实验技术探讨阴道上皮细胞在念珠菌感染时的RNA水平的变化规律，发现上皮细胞出现的非致死性线粒体信号传导，该信号传导保护上皮细胞免受念珠菌诱导的损伤，并调节促炎I型干扰素的应答。该研究为进一步治疗和预防细菌性阴道炎提供了理论基础。

念珠菌感染研究论文基础研究阴道上皮细胞免疫应答

Helicobacter suis

猪螺杆菌可能导致胃部疾病

猪螺杆菌（Helicobacter suis）是一种天然定殖于猪体内的细菌，在某些胃部疾病（如胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤）状态下可定殖于人体胃部。来自PNAS上发表的一项最新研究，从3名胃病患者的胃部可分离并培养猪螺杆菌，根除后可显著改善患者的内镜及组织学检查结果，而该菌的定殖可诱导小鼠的胃粘膜化生。因此，猪螺杆菌的定殖可能与胃部疾病之间存在因果关联。另外，人体胃部分离出的猪螺杆菌与猪体内的分离株十分相似，提示这种细菌可能从猪向人传播。

Helicobacter suis 研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）以人为对象的临床试验

饮食-菌群互作

张晨虹团队：能量摄入、禁食和膳食结构，对代谢和菌群有何影响？

上海交通大学的张晨虹团队在BMC Biology上发表的一项最新研究，喂食正常饮食或高脂饮食的小鼠分别进行自由进食、卡路里限制（CR：每日减少30%进食量）、间歇性禁食（IF：2日禁食+5天自由取食）及IF控制进食（IFCtrl：2日禁食+5天控制进食量，与自由进食组的日均进食量一致）干预，发现能量摄入、饮食结构和禁食时间对代谢健康的影响有交互作用，而不同的饮食方案可通过影响肠道菌群促进宿主代谢健康。

饮食-菌群互作研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）卡路里限制

肠道菌群

肠道菌群决定小鼠社交行为

越来越多的证据证实肠道菌群可以通过肠脑轴对大脑功能进行调节，改变社交行为。然而具体什么样的菌群组成对应何种社交习惯和行为并不明确。近期一篇发表在NPJ Biofilms and Microbiomes的研究论文通过建立不同社交行为模型小鼠，结合宏基因组测序和菌群移植的方法，鉴定得到支配和顺从社交行为小鼠的肠道菌群组成结构，并且发现不同社交行为型小鼠，具有不同脂肪组织代谢方式，以及炎症模式。

肠道菌群社交行为 eWAT 炎症水平研究论文

乳糖不耐受

双歧杆菌可能介导了乳糖不耐受的症状？

来自Gut上发表的一篇letter，发现乳糖不耐受者的肠道菌群中的双歧杆菌属丰度显著升高，且双歧杆菌属的丰度与乳制品摄入及肠道不适（包括腹痛、腹部不适、腹胀）呈正相关，进一步分析显示，双歧杆菌属部分介导了乳制品摄入与肠道不适之间的关联。

乳糖不耐受研究论文基础研究饮食-菌群互作队列研究