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gut microbiome
文章数:171篇
母婴菌群
逆境会对幼儿期人类肠道微生物组和社会情感功能产生影响
产前和产后的逆境与精神病理学风险的增加有关,这种风险可能会代代相传。PNAS近期发表的研究,以生活在新加坡的450对母子对为样本,研究了两代人所经历的三种不同的逆境暴露(母亲的儿童虐待、母亲产前焦虑和第二代儿童所面临的生活压力事件)与第二代儿童2岁时肠道微生物组组成之间的关系。结果发现肠道微生物组的特征与每种逆境暴露都有明显的差异。特别地,一些与当前和未来儿童社会情感功能相关的微生物类群与受逆境影响的微生物类群具有重叠的假定功能,这表明逆境的代际传递可能会通过改变肠道微生物组功能对儿童的心理健康产生持久影响。本研究或为研究心理健康风险代际传递的内在机制,以及肠道微生物组作为靶标干预的潜力开辟了一条新途径。
母婴菌群
Intergenerational transmission
early life adversity
socioemotional functioning
gut microbiome
肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征
Cell子刊:多组学分析慢性疲劳综合征患者的菌群-宿主互作
肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征(ME/CFS)是一种研究不足的多系统疾病。Cell Host and Microbe发表的这项研究,对ME/CFS患者进行了整合多组学分析,并对患病时间较短和较长的患者进行了分组分析。结果表明,短期患者的特点是更为明显的肠道菌群失调,尤其是产丁酸菌的减少,而长期患者则有更为严重的临床表型和代谢异常。
肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征
ME/CFS
multi-‘omics
metagenomics
metabolomics
眼病
肠道菌群在眼部疾病中的作用(综述)
肠道微生物依靠人体的肠道生存,同时协助人体完成多种生理生化功能。目前已经证实肠-眼轴的存在,肠道菌群的改变与眼病的生理病理变化密切相关。发表在Progress in Retinal and Eye Research上的一篇文章对肠道微生物在常见眼部疾病发生发展中的分子机制、调控作用及其治疗前景进行了综述,表明进一步深入研究眼病相关的肠道微生物环境状态有助于揭示眼病新的发病机制以及提供新的治疗靶点。
眼病
gut microbiome
age-related macular degeneration
Retinal artery occlusion
uveitis
肠-肝轴
脂肪肝中的肠-肝轴:营养不良的视角(综述)
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)与肥胖及代谢综合征相关,营养不良及肠道菌群紊乱也可影响NAFLD的进展。Gastroenterology上发表的一篇综述文章,详细介绍了营养不良促进脂肪肝发生的机制,并概述了在营养过剩及营养不良的情况下的菌群-肠-肝轴及与NAFLD进展相关的关键通路。
肠-肝轴
gut microbiome
NAFLD
gut-liver axis
malnutrition
肠道菌群
徐书华+宁康:我国多民族间宿主—微生物基因多样性及微观共进化研究
中科院上海营养与健康研究所徐书华团队和华中科技大学宁康团队合作,在Journal of Genetics and Genomics发表文章,报道了我国新疆哈萨克族、汉族和维吾尔族等群体中宿主-肠道微生物遗传多样性与微观共进化机制,其有助于加深理解人类宿主基因组与肠道微生物组间的微观共进化,以及两者相互作用对人类表型多样性的联合作用机制,同时该研究对推动人类表型组计划和我国多民族“宿主-微生物”共进化研究有积极影响和示范效应。
肠道菌群
共进化
宿主遗传变异
表型多样性
Han Chinese
肠道菌群
陈峰+陈宁:基因型、饮食、年龄等对小鼠肠道菌群的塑造作用
北京大学口腔医院陈峰团队和北京大学人民医院陈宁团队合作,在Journal of Genetics and Genomics发表研究,以遗传性维生素A缺陷小鼠为模型,发现宿主基因型、饮食、年龄和饮食干预起始年龄等因素,在不同程度上影响了肠道菌群的组成。
肠道菌群
宿主基因型
饮食
gut microbiome
Host genotype
定植抵抗
Cell:感染“训练”宿主,“升级”菌群对病原体的抵抗力
What doesn't kill you makes you stronger.(不能摧毁你的,会让你变得更强大。)这一点在免疫功能方面体现得尤为明显。那么,在抵抗致病菌定植中发挥重要作用的肠道菌群,是否也有这样的特性呢?Cell最新发表的一项研究表明,肠道致病菌感染能增强菌群的定植抵抗作用。进一步的机制研究表明,感染能“训练”宿主改变其胆汁酸代谢,增加肠道内的牛磺酸,富集能利用牛磺酸的细菌。这些细菌将牛磺酸转化为硫化物,从而抑制致病菌的呼吸作用,抵抗致病菌定植。这是宿主与菌群共生双赢的又一体现。相关发现对于研究宿主-菌群互作以及肠道感染疾病等,具有重要参考价值。
定植抵抗
gut microbiome
colonization resistance
taurine
Bile acid
普雷沃氏菌
Cell子刊:未知肠道普氏菌种的发现与解密——多糖利用能力越高,竞争力越强?
普雷沃特氏菌(Prevotella)具有菌种多样性,是人类肠道中的优势菌属,特别是在饮食富含蔬菜的人群中。Cell Host & Microbe发表文章揭示了小鼠肠道菌群中尚未定义的Prevotella菌种,并阐述了它们是如何‘干掉’同属其它菌株,最大化竞争优势。其中至少三个关键菌株被成功分离、复活,基因测序纳入数据库,为后续研究提供更多可能性。
普雷沃氏菌
多糖利用位点
Prevotella spp
. diet
competition
环境温度
中科院动物所:肠道菌群和宿主体温调节对环境温度波动的适应性
中国科学院动物所王德华团队在mSystems发表文章,发现环境温度的波动导致肠道菌群和宿主的代谢发生动态性变化,肠道菌群及其宿主在反复驯化后具有更强的适应性,并且动态的肠道菌群及其代谢产物可赋予宿主对环境温度波动的代谢调节可塑性。这可能意味着在进化过程中,较低的环境温度是驱动哺乳动物及其肠道菌群共生的关键线索。
环境温度
肠道菌群
体温调节
food intake
gut microbiome
多发性硬化
宿主遗传与肠道菌群的互作,决定对多发性硬化的易感性
多发性硬化(MS)是一种中枢神经系统的自身免疫疾病,其发病风险由遗传和环境等因素共同决定,肠道菌群也被证明与MS有密切关系。PNAS近期发表的一项小鼠研究表明,宿主基因型和肠道菌群之间的复杂互作,决定了宿主对MS的易感性。该研究发现,在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型中,肠道菌群与宿主的遗传背景之间存在“适配”关系,当菌群与宿主遗传“不匹配”时,抗病个体的菌群或其中的特定肠菌(比如本研究中的罗伊氏乳杆菌),可能反而会增加易病个体的疾病风险。因此,干预肠道菌群治疗自身免疫疾病时,应考虑个体的遗传因素,设计量身定制的治疗方案。
多发性硬化
multiple sclerosis
gut microbiome
Genetics
实验性自身免疫性脑脊髓炎
粪杆菌属
Cell子刊:肠道粪杆菌属细菌的多样性
粪杆菌(Faecalibacterium)属细菌广泛存在于人体肠道中,在开发下一代益生菌(next-generation probiotics,NGPs)或生物治疗药物方面具有广阔前景。但对于其多样性的认识十分有限。发表在Current Biology上的一项研究通过宏基因组组装,系统分析了粪杆菌属细菌在人类肠道中的多样性以及与年龄、地理、疾病等的相关性,极大丰富了对该类细菌的认识。
粪杆菌属
Faecalibacterium prausnitzii
gut microbiome
strain diversity
Pangenome
移植物抗宿主病
浙大团队:补充酪氨酸可改善小鼠的急性移植物抗宿主病
肠道菌群及其代谢产物对于免疫稳态至关重要,可影响包括急性移植物抗宿主病(aGVHD)在内的多种免疫相关疾病。来自浙江大学的黄河团队与钱鹏旭团队在EBioMedicine上发表的一项最新研究,发现aGVHD小鼠模型的肠道酪氨酸水平显著降低,且与肠道菌群组成的变化相关。补充酪氨酸可在aGVHD早期阶段改变小鼠的肠道菌群及粪便代谢表型,并缓解症状以提高生存率。
移植物抗宿主病
aGVHD
Tyrosine
gut microbiome
metabolomics
肠道菌群
郑钜圣+陈裕明+王军:看似不同的疾病,却可能有相似的菌群特征
疾病与菌群之间的因果关系是菌群研究的一大焦点。Microbiome最新发表了西湖大学郑钜圣、中山大学陈裕明和中科院微生物所王军与团队的研究,在中国人群中分析了遗传对肠道菌群的影响,然后通过双向孟德尔随机化分析,研究了人肠道菌群与复杂疾病之间的因果关系,并根据菌群特征的共性和特性对不同疾病进行了聚类,发现一些看似不同的疾病,可能有着相似的菌群特征,提示这些疾病之间可能在病因机制上存在关联。
肠道菌群
遗传
疾病
gut microbiome
host genetics
肠道菌群
婴儿肠道菌群结构或影响特应性湿疹的发生
本研究利用多组学技术,试图揭开儿童肠道菌群与特应性湿疹之间的因果关联以及其中潜在的机制,为儿童湿疹的预防提供新的思路。
肠道菌群
early life
SCFA
allergen sensitization
atopic dermatitis
胆汁酸
傅静远等:遗传和菌群与肥胖者的胆汁酸的关系
人体内有很多种胆汁酸(BA)及其相关分子,其中一部分是由菌群代谢产生的。这些BA能发挥不同的生物学作用,并且与肥胖相关疾病(如脂肪肝和高血脂)有关。Cell Reports近期发表了来自荷兰格罗宁根大学傅静远团队与合作者的研究,在肥胖患者中鉴定出大量的BA-遗传和BA-菌群关联,揭示了BA与肝脏脂肪和脂质代谢物的关系。这些发现强调了菌群对人体BA库的潜在重要调控作用,并为靶向菌群以及BA代谢过程和信号通路治疗肥胖相关疾病提供了新思路。
胆汁酸
bile acids
Genetics
gut microbiome
Liver
抗生素
抗生素扰动对人体肠道菌群的影响(综述)
Genome Medicine近期发表的综述文章,详细总结了抗生素对不同阶段人体肠道菌群的扰动作用,归纳了其中的关键影响因素,推荐专业人士参考。
抗生素
gut microbiome
Resistome
antibiotics
Perturbation
肥胖
国内团队:肠道菌群与内脏脂肪的密切关系
上海交通大学附属第六人民医院包玉倩、Haoyong Yu与团队,近期在Computational and Structural Biotechnology Journal发表研究,通过宏基因组关联研究,揭示了多种肥胖参数与肠道菌群组成和功能的关系,其中内脏脂肪与菌群的关联最强。
肥胖
gut microbiome
Obesity
Visceral fat
Laparoscopic sleeve gastrectomy
没食子酸
邓百川+印遇龙等:没食子酸如何影响肠道健康(综述)
没食子酸(GA)是一种天然存在于水果、蔬菜和草药中的多酚化合物,具有抗氧化、抗癌、抗炎症、抗菌等多种生物活性。华南农业大学的邓百川和印遇龙院士与团队在Frontiers in Immunology上发表的一篇综述文章,详细介绍了GA的物理化学特性、生物利用度、吸收及代谢,并总结了GA对胃肠道健康影响的相关研究结果,重点关注了GA对肠道菌群及免疫的调控作用。
没食子酸
Polyphenol
gallic acid
gut microbiome
immune response
噬菌体
Cell子刊:噬菌体的溶源性感染影响其细菌宿主的转录及功能
肠道相关噬菌体可改变其细菌宿主的丰度及活性,从而影响人体健康与疾病。温和噬菌体占据了肠道病毒组中的大部分,而噬菌体的溶源性感染的作用尚未完全明确。Cell Reports上发表的一项最新研究,鉴定出了一种属于Salyersviridae病毒科的拟杆菌属噬菌体BV01,并发现BV01对普通拟杆菌的溶源性感染可导致其整合至宿主TspO蛋白的启动子区域,以抑制胆盐水解酶的表达,从而改变普通拟杆菌的胆汁酸代谢活性。
噬菌体
Bacteroides
gut microbiome
Bacteriophage
temperate phage. bile acids. host-microbe interactions. phage-host interactions
益生元
什么影响益生元引起的肠道菌群产气?
益生元能促进有益细菌生长和产生有益代谢物,其中研究比较多的是短链脂肪酸,但细菌发酵益生元时也伴随气体生成。mBio近期发表研究,通过理论模型和体外实验,分析了益生元和菌群组成对人肠道菌群产气能力的不同影响。
益生元
functional heterogeneity
gut microbiome
intestinal gas
Prebiotics
粪菌移植
移植衰老菌群可诱导小鼠的认知障碍
衰老与认知衰退及肠道短链脂肪酸浓度降低相关。Gut Microbes上发表的一项最新研究,将衰老小鼠或年轻小鼠的菌群移植给年轻无菌小鼠后发现,移植衰老菌群可降低小鼠肠道中的短链脂肪酸浓度,并诱导抑郁样行为及记忆损伤。
粪菌移植
aging
gut microbiome
short-chain fatty acids
acetate
粪菌移植
菌群代谢产物在粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染中的作用
粪菌移植(FMT)是治疗复发性艰难梭菌感染(rCDI)的有效手段,但FMT的起效机制尚未明确。Gut Microbes上发表的一篇Addendum,讨论了粪菌移植对肠道菌群代谢产物(包括胆汁酸及短链脂肪酸(SCFA)等)的调节在治疗rCDI中的作用机制,以及粪菌移植对其它菌群代谢产物(包括三甲胺及氧化三甲胺等)潜在影响。
粪菌移植
gut microbiome
Metabonomics
fecal microbiota transplant
Clostridioides difficile infection
肿瘤免疫治疗
改善癌症免疫治疗,菌群调节从何入手?(综述)
肠道菌群与癌症患者对免疫检查点抑制剂(ICI)治疗的应答密切相关。European Journal of Cancer上发表的一篇综述文章,详细讨论了如何通过直接方式(粪菌移植、抗生素、益生菌、合生制剂、特定菌群组合、噬菌体)及间接方式(饮食干预、膳食纤维、发酵食品等)调控癌症患者的肠道菌群,以提高患者对ICI治疗的应答,同时对于开始ICI治疗前的患者及医生给出了一些广泛的建议。
肿瘤免疫治疗
immunotherapy
gut microbiome
microbiota
Nutrition
人类肠道病毒组
Cell子刊:研究人肠道病毒组的重要新资源
目前关于人肠道病毒组的研究至少发表了32项,但不同研究之间存在不一致的结果。Cell Host and Microbe发表的一项新研究中,美国俄亥俄州立大学的研究者对这32项研究的数据进行了整合,构建了一个系统性的人肠道病毒组数据库,用其评估了这些研究的偏倚性和不同研究方法对病毒数据的影响,并分析了人一生中的病毒组演变规律。该研究为今后的肠道病毒组研究提供了重要资源。
人类肠道病毒组
gut microbiome
Virome
database
Bacteriophage
肠道菌群
华中农大:肠道菌群或影响狂犬疫苗效果
华中农业大学赵凌团队近期发表在Clinical and Translational Medicine上的文章,利用抗生素破坏肠道菌群平衡,降低狂犬疫苗诱导的体液免疫,且肠道菌群中梭菌目和毛螺菌科细菌丰度和狂犬病毒中和抗体的滴度成正相关,揭示出肠道菌群对狂犬疫苗诱导的免疫反应的调控作用。
肠道菌群
clostridia
gut microbiome
humoral immunity
Lachnospiraceae
围产期因素
围产期因素与后代肠道菌群健康(综述)
围产期因素可通过调节母亲和婴儿的肠道菌群,影响后代的长期健康。FEMS Microbiology Reviews发表的综述文章,介绍了产前、分娩和产后的多种关键围产期因素、生命早期的肠道菌群发育特征和来源,以及这些因素对后代肠道菌群和健康的短期和长期影响。
围产期因素
婴儿肠道菌群
prenatal and postnatal factors
gut microbiome
Transmission
菌群-肠-脑轴
胡少华+宋学勤:菌群-肠-脑轴与双相情感障碍(综述)
Clinical and Translational Medicine近期发表了浙大一院胡少华、郑大一附院宋学勤与团队的综述文章,介绍了菌群-肠-脑轴的概念,总结了关于双相障碍患者肠道菌群特征的研究进展,讨论了目前研究的局限性,并对未来的研究框架和研究方向进行了展望,推荐专业人士关注。
菌群-肠-脑轴
gut microbiome
bipolar disorder
microbiome‐gut‐brain axis
双相障碍
体外共培养系统
体外研究微生物-肠道互作的新工具
在体外培养模型中研究肠道细菌(特别是对氧极为敏感的专性厌氧菌)调控宿主生理的机制,很具有挑战性。Med期刊近期发表来自美国MIT团队的研究,报道了一个可对专性厌氧菌和肠上皮进行体外长期共培养的新工具,并用其研究了有益菌普氏粪杆菌(F. prausnitzii)的抗炎作用机制。
体外共培养系统
gut microbiome
Faecalibacterium prausnitzii
oxygen-sensitive microbes
microphysiological system
神经性厌食症
厌食症患者的肠道菌群有多紊乱?
肠道菌群产生大量生物活性物质,可影响宿主脑部功能和行为,可能与神经性厌食症(AN)相关。Clinical Nutrition近期发表的一项临床研究发现,厌食症患者在发病期间(体重过轻)有严重的肠道菌群紊乱,特别体现在菌群-代谢物相关关系变化上。
神经性厌食症
Anorexia nervosa
gut microbiome
Fecal metabolome
eating disorders
菌群-肠-脑
如何在野生脊椎动物中鉴定菌群介导的行为(观点)
对实验动物的研究表明脊椎动物肠道菌群可对大脑和行为产生多样而强大的影响。然而,对于实验室外的菌群-肠-脑(MGB)轴的生态学相关性仍未被充分探索。理解自然种群中肠道菌群的行为和认知效应是行为生态学的一个重要目标,它可能揭示脊椎动物行为可塑性的机制和进化。发表在Trends in Ecology and Ecolution上的一篇观点文章,概述了一套可用于这项工作的方法,并认为除了从野生动物身上收集肠道菌群和行为的观察数据外,结合适当的操作方法将是在这一领域取得进展的下一个关键步骤。对野生动物MGB轴的研究有助于进一步探究生态学中进化、行为适应、复杂行为和行为特化形成的机制。
菌群-肠-脑
gut microbiome
Behaviour
cognition
behavioural plasticity