Trine Nielsen

心血管代谢疾病肠道菌群代谢组

许多常用药物都会对我们的肠道菌群造成影响。Nature最新发表的一项研究提出了一个研究框架，能够分解药物和疾病对宿主和肠道菌群特征的影响，并将其应用于欧洲MetaCardis队列的2173名个体的多组学研究，量化分析了心脏代谢疾病中单个药物、药物组合、药物累加效应和药物剂量与宿主表型、代谢组和肠道菌群的关联，为药物-宿主-微生物组的相互作用提供了新的假设。

药物-菌群-宿主互作心脏代谢疾病

肠道病毒组

研究肠道病毒组的新资源+一种普遍存在的新噬菌体

mSystems近期发表一项来自丹麦的研究，报道了基于当地人群的肠道病毒组数据库，并从中发现了一种在全球人群中存在较为普遍的新的噬菌体。

肠道病毒组噬菌体

代谢健康

一种宿主+菌群的共代谢产物，或对代谢健康有关键影响

肠道菌群产物参与调控宿主代谢，马尿酸是一种菌群和宿主的共代谢产物，此前研究表明马尿酸与健康的代谢表型相关。Gut近期发表的一项研究，通过人体研究揭示了尿液马尿酸、肠道菌群、饮食和代谢健康之间的关联，并在动物实验中检验了马尿酸与糖稳态调节的因果关系，表明马尿酸不仅可作为代谢健康的标志物，还在宿主代谢健康中起到重要的介导作用。

代谢健康肠道菌群-宿主共代谢物马尿酸

前驱糖尿病

不同国家的前驱糖尿病人群的肠道菌群特征

来自Genome Medicine上发表的一项最新队列研究结果，纳入来自丹麦及印度的262名前驱糖尿病者及275名血糖正常者，鉴定出了与前驱糖尿病相关的跨种族肠道菌群组成变化，并在不同国家人群中鉴定出了不同的前驱糖尿病相关肠道菌群特征。

前驱糖尿病研究论文队列研究

糖尿病

Nature子刊：不健康饮食相关的一种菌群代谢产物，与糖尿病存在关联

丙酸咪唑（ImP）是新发现的肠道细菌代谢组氨酸的产物。小鼠的研究发现ImP可以通过MAPK通路破坏葡萄糖代谢。但ImP在患者中与疾病的相关性并没有研究。近期一篇发表在Nature Communications的多中心队列分析发现，血清中丙酸咪唑上升与前驱糖尿病和2型糖尿病显著相关，与肠道菌丰度下降，和拟杆菌2肠型显著相关，与系统性炎症显著相关。丙酸咪唑的上升与不良的饮食习惯相关，但与组氨酸摄入量无关。因此对于前驱糖尿病和2型糖尿病患者的治疗应当考虑个性化膳食以抑制细菌组氨酸代谢的途径。

糖尿病肠道菌群代谢产物丙酸咪唑肠道菌群前驱糖尿病

低谷蛋白饮食

Nature子刊：低麸质饮食怎样影响健康人的肠道菌群和代谢？

越来越多的人开始尝试低谷蛋白饮食，但其对健康人的影响尚未明确。Nature Communications上发表的一项最新研究，在60名健康中年人进行了一项随机对照交叉试验，发现低谷蛋白/麸质饮食可改变肠道菌群，减少氢气呼出量并改善腹胀，降低体重并减少炎症小体激活。

低谷蛋白饮食 Shahrad Taheri Hadeel Zaghloul Odette Chagoury

抗生素影响

Nature子刊：健康成人的肠道菌群对抗生素扰动有较强的恢复力

Nature Microbiology本周上线的一项重要研究表明，健康成年人的肠道菌群经短期广谱抗生素扰动后，整体上有较强的恢复能力，但也有少数潜在的有益菌种和菌株在半年后仍无法恢复，抗生素耐药基因的携带情况可影响细菌在恢复过程中的定植和生存。这些发现提示，健康成年人偶尔短期服用抗生素，应该不会对菌群造成明显的长期不良影响，但长期和经常性服用抗生素的后果，以及抗生素对儿童和老年人菌群的影响，仍需更多研究。

抗生素影响人体肠道菌群抗生素耐药基因

生物信息学工具

Nature子刊：带你玩转人微生物组和代谢组数据

本文介绍了一个曾被用于揭示肠道菌群在宿主胰岛素抵抗的背景下如何影响循环系统代谢物的数据挖掘方法。对应研究可参考此前日报中的报道：两种肠道细菌改变血清代谢组，增加糖尿病风险（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1095814020）。

生物信息学工具微生物组代谢组血液代谢组学 Ⅱ型糖尿病

妊娠期糖尿病

妊娠糖尿病患者在孕晚期和产后的肠道菌群特征

Microbiome近期上线的一项研究，用16S法分析了50例妊娠糖尿病（GDM）和161例对照孕妇的肠道菌群组成，鉴定出GDM相关的菌群特征，发现GDM患者在孕期和产后的肠道菌群均表现出异常，与2型糖尿病患者相似。

妊娠期糖尿病怀孕体质指数血糖特征妊娠期高血糖症

唾液菌群

素食者的唾液菌群有何不同？

长期饮食模式对唾液菌群有何影响？Scientific Reports[IF：4.259]近期发表的一项研究，对比了素食者和杂食者的唾液菌群，有些有趣的发现。

唾液菌群口腔菌群素食 Zhuye Jie Zhuye Jie

前驱糖尿病

Diabetologia：前驱糖尿病患者的肠道菌群如何变化

这是上周发表在Diabetologia[IF：6.08]的研究，分析了丹麦的前驱糖尿病患者的肠道菌群，发现存在一定程度的菌群失调，或许是低度炎症的信号，推荐专业人士参考。

前驱糖尿病 Akkermansia muciniphila Clostridium Faecal transfer Gut microbiota

血清代谢组学

Nature：两种肠道细菌改变血清代谢组，增加糖尿病风险

血清代谢组学胰岛素抵抗支链氨基酸转运蛋白葡萄糖不耐受

益生菌

Genome Medicine：益生菌并不改变健康人的菌群？

① 截至2015年8月17日，采用高通量测序，研究食用益生菌后粪便菌群结构改变的随机对照实验（RCT）只有7项，研究质量评估为中到高；② 没有任何一项研究证明食用益生菌组的粪菌α多样性、丰富度或者均一性与食用安慰剂组有差别；③ 只有一项研究发现食用益生菌显著改变了粪菌组成的整体结构，即β多样性改变；④ 益生菌对健康人粪菌组成的影响，还缺乏证据。

益生菌 16S rRNA 随机对照实验 α多样性 β多样性

二甲双胍

Nature：二甲双胍对糖尿病人的肠道菌群到底有何影响？

去年Nature上的重量级研究，证实二甲双胍通过微生物调节而产生的药效是通过产生短链脂肪酸，并增加埃希氏杆菌达成的。强烈推荐重温经典。

二甲双胍二型糖尿病短链脂肪酸埃希氏杆菌 Grace Hewon Shin

人肠道宏基因组

Nature：在人类肠道中鉴定出330万个微生物基因（2010）

经典回顾，这是MetaHIT抢在HMP团队之前在Nature上发出的第一个重量级阶段性研究成果，也是覃俊杰博士的成名之作，迄今被引用次数已近4000次。

人肠道宏基因组 Jacques Ravel Jacques Ravel