Hauke Smidt

肠道菌群儿童内化问题外化问题

人类肠道菌群中的微生物间互作受到饮食和宿主衍生聚糖（如黏蛋白上链接的聚糖）的影响。肠道菌群呈现的高度复杂性，是研究关键微生物的代谢互作和营养作用时面临的一大挑战，而简化的合成群落可为相关研究提供一种解决方案。ISME Journal发表的这项研究，设计合成了由16种人体肠菌构成的最小菌群，结合16S分析、代谢物测量和宏转录组学方法，研究了该群落在体外生物反应器中的动态变化、稳定性、物种间的代谢互作和营养网络。

合成菌群微生物生态学体外模型肠道菌群

儿童肠道菌群

儿童生命早期肠道菌群或与行为发展有关

本研究通过对儿童队列的长期随访，描绘了儿童肠道菌群的变化轨迹，并发现其中普氏菌的丰度与儿童外化行为之间的关联。

儿童肠道菌群研究论文双歧杆菌普氏菌属外化行为

扰动因素

概念升级！Gut解读肠道菌群的稳定性与恢复力（综述）

Gut发表综述，对肠道菌群稳定性和恢复力的概念进行了厘清和升级解读。文章提出了肠道菌群的病理稳态一说，也就是在外界因素的干扰下，如慢性炎症包括肥胖、IBD，肠道菌群的短时间紊乱可能最终变为新常态，失去恢复力使临床治疗变得更加困难。

扰动因素综述菌群稳定性菌群恢复力基础研究

微生物组

微生物组定义的重新审视:旧概念和新挑战

本文基于2019年3月6日在奥地利举行的研讨会框架中的讨论。其根据1988年Whipps等人提供的简短、清晰和全面的描述，提出了微生物组的定义，并根据最新的技术发展和研究成果，对其进行了一系列新颖的建议。明确区分了微生物组（microbiome）和微生物群（microbiota）的术语，并提供了一个全面的讨论，考虑微生物群的组成，微生物群的异质性和时间和空间动态，微生物网络的稳定性和弹性，核心微生物群的定义，以及功能相关的关键物种。

微生物组微生物群微生物网络核心微生物群关键物种

益生元

麦麸提取物对胃肠通过、肠道菌群及代谢健康的影响

Gut Microbes上发表的一项随机双盲安慰剂对照试验结果，在胃肠慢传输但无便秘症状的健康成年人中，发现每日补充麦麸提取物对肠道通过时间并无显著影响，但可改变菌群组成及多样性，并降低粪便硬度。基于菌群组成对受试者进行分类，可鉴定出对麦麸提取物应答（即肠道通过时间显著降低）的受试者。

益生元 gastrointestinal transit Gut microbiota prebiotic energy metabolism

饮食-菌群互作

富含麦麸的食物对肠道菌群及其代谢产物的影响

很多证据显示，全谷饮食可降低多种慢性疾病的风险，肠道菌群可能有一定介导作用。《Microbiome》发表的一项最新研究显示，富含麦麸的饮食可改变小鼠肠道菌群，促进菌群将饮食中富含的甘氨酸甜菜碱代谢为其它甜菜碱类化合物，可能是全谷饮食改善健康中的一环。

饮食-菌群互作 betaine bran colon model Diet-microbiota interaction

母乳寡糖

解读母乳低聚糖与婴儿菌群的互作关系

解读母乳中的低聚糖成分与婴儿菌群之间的关联有助于解读早期肠道菌群的形成。《Molecular Nutrition and Food Research》近期发表研究，发现母乳低聚糖成分显著影响一月龄婴儿的粪便菌群结构，富集的菌群可能参与特定低聚糖的分解。该结果对于解读母乳成分与婴儿肠道菌群的形成及互作具有参考价值。

母乳寡糖婴儿菌群发育 HMO Breastfeeding microbial clusters

婴儿肠道菌群

婴儿肠道菌群 HMO Breastfeeding microbial clusters Microbiome

衰老

Gut：衰老与胃肠道生理功能和菌群的变化（综述）

肠道菌群在衰老中的变化及其影响，是菌群领域的一个研究热点。Gut近期发表综述，讨论了衰老相关的胃肠道功能和菌群组成变化，以及老年人的菌群干预的研究进展，值得专业人士关注。

衰老 Ageing gastrointestinal physiology INTESTINAL BACTERIA 胃肠道生理

骨骼肌物质代谢

抗生素短时干预不影响肥胖人群骨骼肌代谢

骨骼肌代谢对胰岛素耐受、二型糖尿病具有重要影响。本研究利用抗生素干预肠道菌群，发现抗生素干短时预不影响肥胖人群用餐前后血液中和前臂骨骼肌中典型物质的含量，指示菌群干预可能无法改善肥胖人群的代谢状况，对研究菌群干预、肥胖控制等都具有参考价值。

antibiotics insulin resistance microbiota Obesity skeletal muscle

微生物耐受性

Science：利用细菌的耐受性进行环境治理

尽管细菌耐药性威胁全球公共安全，但类似的耐受机制也有可能被运用于生物除污。本文总结了原核生物耐受性机制的类型以及环境压力对耐受型的筛选机制，并以原油降解、生物湿法冶金、抗生素/非抗生素类杀菌剂的降解为例，回顾了一系列处于实验或初步实践阶段的生物去污成果，并对该领域的发展进行了客观的预期，值得专业人士参考。

微生物耐受性生物除污 Kathryn McCauley Susan V Lynch

鸡肠道菌群

FM：鸡的肠道菌群，宿主和环境都不可小觑（综述）

Frontiers in Microbiology[IF：4.076]近期发表的关于鸡肠道菌群研究的综述文章，罗列了一系列可能被忽略、但对菌群结构研究至关重要的宿主和环境因素。不仅仅对研究禽类肠道菌群、优化养殖模式具有重要参考价值，也对其他领域的菌群研究——尤其是基于大数据的荟萃分析——具有一定的指导作用，值得参考。

鸡肠道菌群宿主因素环境因素

性别差异

FI：免疫系统&肠道菌群均雌雄有别，若错配会出乱子

没有菌群存在的雌雄不一无菌小鼠，免疫系统就会有差别，而正常小鼠，雌雄不同会有不同肠道菌群，而这些肠道菌群会促进免疫系统的雌雄差异。很有意思的研究，特别推荐。

性别差异免疫系统

inulin-type fructans (ITF)

Gut：菊粉或改善血管内皮功能紊乱，但还需更精确证据

这是Gut针对之前发表的一项研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1079332652）的评论文章，认可相关研究的积极意义，也提出实验方法的局限性让机制研究还有待深入。很值得好好读读的小文章，特别推荐。

inulin-type fructans (ITF) 菊粉型果聚糖其他评论文章肠道菌群【有显著改善】

菊粉型果聚糖

Gut：菊粉或改善血管内皮功能紊乱，但还需更精确证据

这是Gut针对之前发表的一项研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1079332652）的评论文章，认可相关研究的积极意义，也提出实验方法的局限性让机制研究还有待深入。很值得好好读读的小文章，特别推荐。

菊粉型果聚糖血管内皮功能紊乱心血管疾病 16s测序 INTESTINAL MICROBIOLOGY

牛瘤胃

FM：牛瘤胃内气体、溶解代谢产物和菌群组成的昼夜动态

关于瘤胃菌群的研究，推荐阅读。

牛瘤胃昼夜动态菌群组成亚麻油 volatile fatty acids

FEMS MR：调节肠道菌群的最佳策略是什么？（必读综述）

调节肠道菌群的最佳策略是什么？益生菌？益生元？营养？粪菌移植？其实首先还是要加强深入研究。。。

FRCPI Eamonn M M Quigley

罗非鱼

SR：益生菌对罗非鱼幼鱼的肠道菌群有何影响？

渔业养殖业中的益生菌应用，一直都是产业中关注的热点，这篇文章推荐感兴趣的人阅读。

罗非鱼鱼类菌群益生菌 Andrea Vettiger Marek Basler

小鼠肠道细菌集合平台

Nature子刊：集合已知的小鼠肠道菌株，能对比分析出啥？

小鼠肠道细菌集合平台菌株水平 Luca Borrelli Alessandro Fioretti

抗生素

Cell子刊：肥胖成人短期用抗生素，影响没想象的大！

今天发表的Cell Metabolism上的一项随机双盲对照实验，发现给肥胖成人短期（7天）使用抗生素，万古霉素改变菌群，而阿莫西林不会，一些基因表达会发生变化，但两种抗生素都不会影响代谢和能量平衡相关指标。值得认真看看，强烈推荐！

抗生素阿莫西林随机对照实验厚壁菌胰岛素抵抗

Autoclave soybean meal

MNFR：断奶仔猪如何发酵不同果胶？

对果胶的研究最近不少，这也是其中之一，推荐关注益生元的人都看一看。

Autoclave soybean meal dietary fiber Digestibility Fermentation microbiota composition

膳食纤维

南京农业大学团队：膳食纤维对仔猪菌群影响

不同膳食纤维，对仔猪肠道菌群有什么影响，在猪的不同段又各有什么影响，推荐看一看。

膳食纤维哺乳仔猪大肠菌群 Christian Milani Marco Ventura

肠道细菌

Gut：新的临床前沿——肠道菌群与健康（综述）

去年Gut上一篇必读综述，强烈推荐再次阅读。

肠道细菌