肿瘤基因组图谱

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肿瘤基因组图谱

文章数：2篇

三阴性乳腺癌(TNBC)

三阴性乳腺癌基因特征与免疫浸润：有什么样的癌基因，就有什么样的免疫构成

① 自2015年6月至2017年1月，利用肿瘤基因组图谱（TCGA）中1215例乳腺癌数据集的DNA和RNA测序数据及信使RNA表达结果；② 193例有生存期信息的TNBC样本，克隆异质性与免疫元基因表达负相关，免疫元基因表达与体细胞拷贝数改变负相关；③ 富含淋巴细胞的TNBCs的突变和新抗原负荷低于淋巴细胞缺乏者；④ 得到相同TCGA数据集不同的免疫元基因和独立的METABRIC数据集的确认；⑤ 富含免疫的TNBCs处于免疫监视中，持续清除多种免疫克隆，克隆异质性低。

三阴性乳腺癌(TNBC) 肿瘤基因组图谱免疫元基因体细胞拷贝数克隆异质性

肝细胞癌(HCC)

全基因组CRISPR技术筛选肝癌“抑癌基因”：Nf1、Plxnb1、Flrt2和B9d1

① 过表达MYC的P53缺失小鼠胚胎肝祖细胞，进行全基因组基于CRISPR/Cas9的基因敲除筛选，裸鼠皮下移植含670000个单导RNAs （sgRNAs）的mGeCKOa慢病毒库感染p53−/−、Myc、Cas9肝细胞；② 利用肿瘤基因组图谱和COSMIC收集肝细胞癌（HCC）的数据；③ 高通量测序显示sgRNAs增加8倍以上；④ 鉴定出4个候选抑癌基因Nf1、Plxnb1、Flrt2和B9d1；⑤ RAS信号通过MAPK参与小鼠肝癌形成，Nf1水平下降、下游蛋白HMGA2水平增高与HCC生存期相关。

肝细胞癌(HCC) 全基因组肿瘤基因组图谱抑癌基因有丝分裂原激活的蛋白激酶