infection

尽管有1-5%的儿童为前体B细胞淋巴细胞白血病（pB-ALL）遗传易感性，但不到1%的风险基因携带者最终发展为pB-ALL。来自Blood上发表的一项最新研究，发现在pB-ALL小鼠模型中，抗生素处理导致的肠道菌群失调可在无感染性刺激源的情况下，诱导白血病的发生。该研究结果提示，共生菌群紊乱（而非特定细菌感染）促进了遗传易感性个体的白血病发生。

白血病 Preleukemic cells infection leukemia prevention acute

抗感染免疫

Cell子刊：肠道菌群帮助铸就血管内的免疫“防火墙”

感染期间，机体需要有效的清除血液中的病原体，从而阻止感染扩散和败血症的发生。在这个过程中，位于肝血窦腔内的肝巨噬细胞（又称枯否细胞）能捕获并清除血液中的病原体，构成了一道血管内的免疫“防火墙”。Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究，使用小鼠模型和体内成像等方法发现，肠道菌群及其代谢产物D-乳酸可促进肝巨噬细胞对血液中的病原菌的清除，从而使得防止感染经血流扩散的免疫“防火墙”更加坚固。

抗感染免疫 infection microbiota Kupffer cell SEPSIS

去泛素化酶

武汉大学团队：去泛素化酶USP25在肠道炎症/感染/癌症中的关键作用

肠道致病菌的感染和定植，可能促进了一些炎症性肠病和结直肠癌的发生。《Nature Cancer》最新发表了武汉大学钟波团队主导的研究，揭示了去泛素化酶USP25在结肠炎、肠道细菌感染和结直肠癌发生中的关键作用。该研究表明，USP25会抑制结肠免疫反应，从而促进结肠细菌感染和炎症；还能通过下调SOCS3促进STAT3激活、促进增加肠上皮细胞干性的Wnt信号通路，来推动结肠癌的发生。通过药物抑制USP25，或是胃肠道感染和相关癌症的潜在防治方法。

去泛素化酶 Acute inflammation colorectal cancer infection 结肠炎

1型糖尿病

Nature子刊：特定肠道寄生虫产物，或能防治1型糖尿病

1型糖尿病（T1D）是一种自身免疫病，在动物模型中，无症状的肠道寄生虫感染可抑制T1D发病，但这种保护性作用的机制尚不清楚。《Nature Communications》发表的最新研究中，报道了由寄生虫Heligmosomoides polygyrus产生的海藻糖，能在小鼠中改变肠道微生物组，诱导调节性CD8+T细胞，对T1D起预防和治疗作用。

1型糖尿病寄生虫产物 infection Parasite host response 肠道菌群

宿主-致病菌互作

PNAS：艰难梭菌感染诱导肠道干细胞损伤的机制

艰难梭菌感染是医院获得性腹泻的最常见原因，导致了超过一半的医院肠道感染和超过90%的由这些感染导致的死亡。胃肠道感染通常会导致上皮损伤，而肠道干细胞的再生过程对损伤的修复至关重要。但它们如何受到肠道感染的影响仍未明确。发表在PNAS上的一篇文章发现，艰难梭菌通过一种称为TcdB的毒素损害结肠干细胞，进而损害肠道组织修复和疾病恢复。这种新的损伤和修复机制，对于寻找防止损伤发生的方法或者开发新的治疗方法有重要帮助。

宿主-致病菌互作 Clostridium difficile toxins stem cell damage

菌群-免疫互作

Cell子刊：共生菌群如何帮助宿主对抗病原体感染（综述）

Molecular Cell上发表的来自Eran Elinav团队的综述文章，详细介绍了在病原体感染过程中，共生菌群如何通过多种直接或间接的方式诱导宿主的定殖抗性，以对抗病原体感染，重点总结了菌群对免疫系统的调控以抑制病原体入侵的机制。最后讨论了通过菌群移植、益生菌/益生元、饮食干预、噬菌体疗法等方式干预菌群对抗感染性疾病的潜在可能。

菌群-免疫互作 mucosal immunity microbiota infection colonization resistance

慢性脑炎

Cell子刊：细菌肽聚糖诱导慢性脑炎（综述）

肽聚糖（PGN）是革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的细胞壁成分，其信号片段通过常驻组织细胞和循环白细胞表达的模式识别受体（PPR）产生促炎作用。最新发表在Trends in Molecular Medicine的综述总结了PGN在脑炎中的决定性作用，尤其是在多发性硬化（MS）和其实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型中。作为肠-脑轴的中心元素，PGN可用于开发新型生物标志物用于疾病监测和治疗，以及开发涉及免疫疗法、饮食干预和生物制剂的新型干预手段。

慢性脑炎 Neurodegeneration infection Microbiome microglia

粪菌移植

粪菌移植治疗艰难梭菌感染期间的免疫应答及菌群-免疫互作（综述）

粪菌移植是治疗复发性艰难梭菌感染（CDI）的有效方法。Trends in Molecular Medicine上发表的一篇综述文章，详细阐述了通过粪菌移植治疗CDI期间，各种类型的免疫应答在致病菌清除、组织修复及炎症损伤中的作用机制，并介绍了菌群-免疫的互作机制及其可能对治疗产生的影响，同时讨论了粪菌移植对共生菌群稳态及菌群-免疫互作的恢复作用。文章强调，为了帮助CDI患者恢复，监测粪菌移植治疗前后的免疫反应十分重要。

粪菌移植 Gut microbiota Fecal microbiota transplantation Immunity infection

肠道感染

肠道感染改变果蝇的RNA剪接

RNA剪接是基因表达中重要的转录后调控机制。Genome Biology上发表的一项最新研究，利用果蝇作为模式动物，发现肠道感染可促进5'端的内含子保留，这些内含子具有类似外显子的特征。机制上，RNA结合蛋白——Lark介导了肠道感染诱导的5'端内含子保留。

肠道感染 infection Gut Splicing Intron retention

免疫代谢

身体如何调整代谢对抗感染？（综述）

宿主-微生物-病原体互作过程中发生的代谢反应，对宿主感染期间的生存有积极或消极的影响。定义三者的代谢需求、获取营养的机制、以及每个参与者在感染期间是否相互合作或竞争以满足自己的代谢需求，这些都有可能揭示治疗疾病的新方法。最新发表在Trends in Immunology的综述回顾了在机体代谢和感染方面的研究结果，并强调了四个研究新方向：宿主-微生物群的代谢伙伴关系如何预防感染；宿主和病原体如何竞争葡萄糖；感染性厌食症的意义；重新定义铁在感染中的作用。

免疫代谢 infection immunometabolism cooperative defenses host-microbiota-pathogen interactions

粪菌移植

评估供体粪便微生物组，提高FMT安全性（观点）

粪菌移植对越来越多的疾病显示临床疗效。但是最近的报道中，耐药性病原菌通过粪菌移植传递给粪菌受者，引起败血症的案例，强调了重新评估供体筛选方法和提高FMT安全性的必要。Trends in Microbiology最近发表的观点文章指出，肠道菌对感染风险有深远影响，但在供体粪便中不进行常规评估。对供体粪便的评估除筛查病原体外，还应考虑菌群组成和结构，以减少FMT受者的感染并发症，提高FMT安全性。

粪菌移植 Faecal microbiota transplantation Microbiome SEPSIS infection

粪菌移植

张发明团队：粪菌移植进入洗涤菌群移植时代

粪菌移植 Fecal microbiota transplantation washed microbiota transplantation Adverse event Safety

致病菌感染

Cell子刊：李斯特菌如何调控自身的肠道感染

Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究，报道了一种致病菌调控自身肠道感染的机制：Prevotella copri的存在可促进单核细胞增多性李斯特菌的感染，而李斯特菌可产生一种细菌素——Lmo2776，以减少肠道共生细菌——Prevotella copri的丰度，以抑制自身的感染，避免造成过度炎症反应，从而促进自身的长期感染及持留。

致病菌感染 bacteriocin Listeria monocytogenes Lmo2776 M-SHIME

结直肠癌

肠道菌群与结直肠癌风险的因果分析（综述）

之前的研究已经发现了肠道微生物组元素（包括特异性微生物、信号通路和微生物相关代谢物）与结直肠癌（CRC）风险之间的联系。但目前尚不清楚肠道菌群的改变与CRC发生的因果关系。肠道菌群的改变可以调节或改变环境因素对CRC风险的影响。影响CRC风险的因素也影响肠道菌群，包括超重和肥胖、体育活动、膳食纤维、全谷物、红肉和加工肉类的摄入量等。最近发表在Gastroenterology的综述回顾了微生物组、饮食和环境因素对CRC发生发展的影响的流行病学和实验室证据。基于这些数据，肠道菌群的特征可能被用于CRC的筛查、化学预防和治疗。

结直肠癌 Dysbiosis Colitis fecal microbiota transplant infection

菌群-免疫互作

细菌淀粉样蛋白在自身免疫中的作用（综述）

细菌感染可能触发自身免疫反应的发生，但具体机制尚未明确。Trends in Microbiology上发表的一篇综述文章，详细讨论了细菌产生的淀粉样蛋白及其携带的DNA触发自身免疫反应的可能机制。

菌群-免疫互作 amyloid curli biofilm autoimmune response

菌群-免疫互作

Cell子刊：菌群暴露影响小鼠的免疫应答

菌群-免疫互作 infection Listeria monocytogenes polymicrobial sepsis Toll-like receptors

维生素D

维生素D在胃肠道免疫中作用为何？（综述）

维生素D是重要的免疫调节因子，对于感染后下调免疫反应具有关键作用；《Trends in Endocrinology and Metabolism》近期发表综述，系统性回顾了维生素D在胃肠道免疫中的调控作用，指出维生素D的主要作用是在发生感染或炎症反应后维持免疫稳态、避免组织损伤，对于阐释维生素D在胃肠道免疫稳态维护中的作用具有重要参考价值。

维生素D 胃肠道免疫 Vitamin D infection gastrointestinal tract

短链脂肪酸

丁酸盐通过缺氧诱导因子缓解艰难梭菌感染

抗生素治疗引起小鼠肠道菌群多样性、短链脂肪酸下降与艰难梭菌感染相关。《Cell Reports》近期发表研究，发现丁酸盐通过激活转录因子HIF-1，保护肠道上皮细胞完整性、降低肠道屏障通透性、抑制肠道细菌易位，从而降低艰难梭菌感染中的炎症反应。该结果对于阐释短链脂肪酸的肠道稳态保护作用具有参考价值。

短链脂肪酸艰难梭菌感染 Short chain fatty acids microbiota Hypoxia

肠易激综合征

肠易激综合征的肠道菌群特征（综述）

有不少研究分析了肠易激综合征（IBS）患者的肠道菌群特征，《Gastroenterology》近期发表的文章，对24项病例对照研究进行系统综述，总结了与IBS相关的肠道细菌类别，这些细菌与IBS间的因果性关联有待进一步研究。

肠易激综合征 Inflammation Intestine Comparison infection

尿路菌群

间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征女性患者的尿路菌群特定

《Journal of Clinical Medicine》上发表的一项最新研究，对比了间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征女性患者与健康女性的尿路菌群差异，发现两者在菌群组成及绝大部分的菌种/菌属的丰度上均无显著差异。

尿路菌群 microbiota Microbiome infection interstitial cystitis

β2-整合素

Cell子刊：β2-整合素诱导ILC3产生IL-22，在感染诱导的结肠炎中起保护作用

β2-整合素可促进中性粒细胞向感染组织处的招募，对于宿主防御十分重要。Cell Reports上发表的一项最新研究，发现小鼠缺失β2-整合素后，鼠柠檬酸杆菌诱导的结肠炎恶化并可致死。但这一表型并非由于缺失β2-整合素引起的中性粒细胞招募缺陷而引起，而是通过抑制ILC3产生IL-22导致的。

β2-整合素 Citrobacter rodentium IL-22 Colitis infection

丙型肝炎病毒

丙肝病毒小知识

今年诺贝尔生理学或医学奖颁发给了发现丙型肝炎病毒（HCV）的三位科学家，这篇发表在Trends in Microbiology的图文小科普介绍了HCV的一些基础知识，有兴趣的读者不妨了解一下。

丙型肝炎病毒 HCV ANTIVIRAL THERAPY infection liver disease

饮食

高脂饮食增加李斯特菌感染风险

饮食 Diet Goblet cell Immunity infection

益生菌

鼠李糖乳杆菌GG株或可改善营养不良儿童的健康状态

《Beneficial Microbes》上发表的一项RCT结果，在近100名营养不良儿童中发现，鼠李糖乳杆菌GG株可改善营养不良儿童的健康状态，包括减少感染、降低住院率、增加BMI等。

益生菌 body mass index Children infection malnutrition

喘鸣

学龄前喘鸣患儿的下呼吸道菌群特征

Journal of Allergy and Clinical Immunology上发表的一项最新研究结果，对比了不同类型喘鸣患儿的下呼吸道菌群，发现支气管肺泡灌洗液（BAL）中莫拉克斯氏菌属的丰度与BAL中性粒细胞的水平相关。

喘鸣 Moraxella Catarrhalis wheeze Asthma Children

感染

特定人群需警惕益生菌的安全性

我们在去年曾经广泛而深入的探讨过益生菌的安全性与有效性，虽然益生菌的安全性似乎已被普遍认可，但实际上对不同个体和不同菌株的使用，仍然需要进一步加以验证，尤其临床使用，不可丧失警惕性。

感染 Fungemia infection Lactobacillus probiotics

主动脉手术

含有银和三氯生的血管移植物表现出可持续和有效的抗菌活性

主动脉手术 Aortic surgery infection Rifampicin Silver

婴儿肠道菌群

用系统生物学方法，挖掘促进婴儿免疫健康的益生菌/元和食物

怎样筛选能促进婴儿免疫发育的断奶辅食？Microbiome近期发表的一项研究，通过数据挖掘和生物信息学方法，建立了一种研究策略/流程，以找出益生菌-益生元-食物之间的关联，旨在用恰当的辅食来促进婴儿肠道内有益菌的生长，进而优化婴儿断奶期的免疫健康。很有意思的一项研究，有一定转化意义，值得专业人士关注。

婴儿肠道菌群 Infant gut microbiome prebiotic Probiotic Reverse ecology

真核微生物

异常妊娠结局与胎盘中的真核病原体无关

Microbiome上发表的一项研究，对比了异常妊娠结局及健康分娩者胎盘样本中3种真核病原体：恶性疟原虫、酿酒酵母及刚地弓形虫，发现所使用的方法无法检测到胎盘中的上述真核病原体。

真核微生物 18S rRNA gene Fetal growth restriction infection Placenta

副干酪乳杆菌MCC1849

可改善感冒抵抗力和情绪状态的灭活益生菌

Beneficial Microbes近期发表一项随机双盲对照试验，表明热灭活的副干酪乳杆菌MCC1849可改善易感个体对感冒的抗性，并对情绪状态有正面影响。

Lactobacillus paracasei common cold infection mood states 副干酪乳杆菌MCC1849