蛋白质组学

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蛋白质组学

文章数：8篇

活性氧自由基

新型放疗增敏法：抑制DDX3

① 35%乳腺癌样本高表达DDX3，侵袭性高，生存期缩短；② 采用定量蛋白质组学方法，鉴定出参与线粒体翻译和呼吸电子传递通路的蛋白质，RK-33处理或敲除DDX3后明显下调；③ DDX3位于线粒体，RK-33抑制DDX3后减少线粒体翻译，致氧耗率和细胞内ATP浓度下降、活性氧自由基（ROS）增加，RK-33拮抗氧耗量增加，抑制DNA修复；④ RK-33抑制DDX3通过抑制线粒体翻译，使乳腺癌对放疗敏感性增强，导致氧化磷酸化能力下降，增加ROS水平，最终生物能量耗竭。

活性氧自由基线粒体呼吸电子传递通路线粒体翻译乳腺癌蛋白质组学

高度浆液性卵巢癌

卵巢癌凋亡与药物敏感性

① 非偏倚性系统方法，采用一组14个注释的高度浆液性卵巢癌（HGS-OvCa）的患者来源异种移植瘤（PDX）模型；② 蛋白质组学分析揭示HGS-OvCa PDX模型内抑制PI3K/mTOR诱导促凋亡和抗凋亡信号传导应答，限制细胞杀伤，但启动细胞抑制抗凋亡蛋白质；③ 对BCL-2家族蛋白质等进行深度定量分析，结合计算机模型和选择性抗凋亡蛋白质抑制剂，揭示凋亡调控的新机制，预测药物敏感性和耐药性；④ 靶向凋亡调控因子可改善PI3K/mTOR通路抑制剂的疗效。

高度浆液性卵巢癌患者来源异种移植瘤 PI3K/mTOR通路靶向治疗凋亡

滑膜肉瘤新靶点：ALK和MET基因变异

① 采用质谱基础上的磷酸化蛋白质组学分析肉瘤细胞株，ALK是Aska-SS细胞株的驱动因子，14%SS患者标本中检出ALK免疫阳性，1例ALK重排；② SS细胞株的特征包括PDGFRα高度磷酸化，Yamato-SS细胞中伴随MET活化增强；③ 尽管在体外Yamato-SS细胞对克唑替尼敏感、对帕唑替尼耐药，联合用药有协同作用，两药体内分别有效；④ 分别有58%和84%SS患者检出MET或 PDGFRα表达，共表达者为56%，ALK和 MET可能是SS的潜在治疗靶点。

滑膜肉瘤酪氨酸激酶驱动基因抗血管新生蛋白质组学

胰腺导管腺癌(PDAC)

胰腺癌与谷氨酰胺代谢

① 胰腺导管腺癌的代谢需要发生改变，高度依赖于某些适应性改变，如非典型谷氨酰胺（Gln）代谢通路，抑制下游Gln代谢组分导致肿瘤生长抑制；② 谷氨酰胺酶（GLS）介导Gln代谢的早期步骤，新研发的GLS抑制剂，抑制GLS导致体外增殖抑制，但胰腺癌细胞有适应性代谢网络，对体内小鼠模型无效；③ 采用整合的代谢组学和蛋白质组学平台，鉴定出补偿性通路；④ 胰腺癌细胞代谢是自适应性的，靶向Gln代谢联合抑制其他适应性应答，可望产生临床疗效。

胰腺导管腺癌(PDAC) 谷氨酰胺（Gln）谷氨酰胺酶代谢组学蛋白质组学

急性髓系白血病的分子调控：Hoxa9/Meis1-miR-146a

① 转录因子Meis1在Hox基因过表达的前提下，驱动髓系白血病的发生；② 泛（磷酸化）蛋白质组学分析提示：Meis1促进Syk的蛋白表达与活性，Meis1依赖性反馈环上调Syk，剖析此环，Syk成为miR-146a的直接靶点，通过转录因子PU.1，Meis1间接调控其表达；③ Hoxa9过表达前提下，Syk信号诱导Meis1，概括了Hoxa9/Meis1驱动的白血病的几个白血病形成特征；④ 抑制Syk则破坏该调控环，延长Hoxa9/Meis1驱动的白血病小鼠的生存期。

Hox基因转录因子Meis1 小miR-146a 蛋白质组学转录因子PU.1

套细胞淋巴瘤：neoantigen主要来自Ig可变区基因突变

① 肿瘤体细胞突变可产生新抗原，每位患者的新抗原的鉴定和验证是目前的难点；② 采用整合基因组和蛋白质组方法，分析组织相容性复合体（MHC）I和II分子提呈的肿瘤抗原肽，可发现新抗原；③ 在套细胞淋巴瘤中，新抗原主要来自于免疫球蛋白（Ig）可变区的体细胞突变，被MHC II特异性地提呈；④ 新抗原特异性循环CD4（+）T细胞，可介导对淋巴瘤细胞的杀伤；⑤ Ig可变区体细胞突变产生的新抗原，可作为淋巴瘤免疫治疗的新靶点。

新抗原肿瘤基因组蛋白质组学组织相容性复合体(MHC) 淋巴瘤

蛋白质组学

乳腺癌中如何靠谱地选定治疗的靶点：多组学综合分析

① 文章应用基因组学和蛋白质组学的工具，比对和验证了24例乳腺癌移植瘤模型可能的抗癌靶点；② 多数情况下，基因组学和蛋白质组学预测结果类似: 比如受体酪氨酸激酶（RTK）的活性；③ 但是也有一些不一致: 比如AKT高表达和 ARAF, BRAF, HSP90AB1 磷酸化位点；④ 所以需要同时结合基因组学和蛋白质组学的结果，综合分析，才能选定靠谱的靶点；⑤ 在移植瘤模型中应用综合分析，对HER2扩增以及PI3K信号通路活化的肿瘤进行治疗，获得了成功。

蛋白质组学基因组学异种移植瘤模型乳腺癌治疗

蛋白质组学

血液蛋白质组学：寻找最合适的肿瘤标志物

① 肿瘤早期诊断的概念，助推了精准诊断，肿瘤的早期诊断可让患者获益更多；② 亲和蛋白质组学可准确测量血清中的诊断信息，这些可操作的信息可用以指导肿瘤的精准和循证医学治疗（预测性标志物）以及精准预测预后（预后性标志物）；③ 从单一标志物的应用转变为多个含可评估信息的标志物的联合应用，称之为识别特征，可大幅提高诊断的准确率；④ 本文综述了血液蛋白质组学（液体活检），阐述了蛋白质生物标志物识别特征的临床应用。

蛋白质组学识别特征液体活检精准诊断生物信息