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蛋白质组学
文章数:8篇
活性氧自由基
新型放疗增敏法:抑制DDX3
① 35%乳腺癌样本高表达DDX3,侵袭性高,生存期缩短;② 采用定量蛋白质组学方法,鉴定出参与线粒体翻译和呼吸电子传递通路的蛋白质,RK-33处理或敲除DDX3后明显下调;③ DDX3位于线粒体,RK-33抑制DDX3后减少线粒体翻译,致氧耗率和细胞内ATP浓度下降、活性氧自由基(ROS)增加,RK-33拮抗氧耗量增加,抑制DNA修复;④ RK-33抑制DDX3通过抑制线粒体翻译,使乳腺癌对放疗敏感性增强,导致氧化磷酸化能力下降,增加ROS水平,最终生物能量耗竭。
活性氧自由基
线粒体呼吸电子传递通路
线粒体翻译
乳腺癌
蛋白质组学
高度浆液性卵巢癌
卵巢癌凋亡与药物敏感性
① 非偏倚性系统方法,采用一组14个注释的高度浆液性卵巢癌(HGS-OvCa)的患者来源异种移植瘤(PDX)模型;② 蛋白质组学分析揭示HGS-OvCa PDX模型内抑制PI3K/mTOR诱导促凋亡和抗凋亡信号传导应答,限制细胞杀伤,但启动细胞抑制抗凋亡蛋白质;③ 对BCL-2家族蛋白质等进行深度定量分析,结合计算机模型和选择性抗凋亡蛋白质抑制剂,揭示凋亡调控的新机制,预测药物敏感性和耐药性;④ 靶向凋亡调控因子可改善PI3K/mTOR通路抑制剂的疗效。
高度浆液性卵巢癌
患者来源异种移植瘤
PI3K/mTOR通路
靶向治疗
凋亡
滑膜肉瘤
滑膜肉瘤新靶点:ALK和MET基因变异
① 采用质谱基础上的磷酸化蛋白质组学分析肉瘤细胞株,ALK是Aska-SS细胞株的驱动因子,14%SS患者标本中检出ALK免疫阳性,1例ALK重排;② SS细胞株的特征包括PDGFRα高度磷酸化,Yamato-SS细胞中伴随MET活化增强;③ 尽管在体外Yamato-SS细胞对克唑替尼敏感、对帕唑替尼耐药,联合用药有协同作用,两药体内分别有效;④ 分别有58%和84%SS患者检出MET或 PDGFRα表达,共表达者为56%,ALK和 MET可能是SS的潜在治疗靶点。
滑膜肉瘤
酪氨酸激酶
驱动基因
抗血管新生
蛋白质组学
胰腺导管腺癌(PDAC)
胰腺癌与谷氨酰胺代谢
① 胰腺导管腺癌的代谢需要发生改变,高度依赖于某些适应性改变,如非典型谷氨酰胺(Gln)代谢通路,抑制下游Gln代谢组分导致肿瘤生长抑制;② 谷氨酰胺酶(GLS)介导Gln代谢的早期步骤,新研发的GLS抑制剂,抑制GLS导致体外增殖抑制,但胰腺癌细胞有适应性代谢网络,对体内小鼠模型无效;③ 采用整合的代谢组学和蛋白质组学平台,鉴定出补偿性通路;④ 胰腺癌细胞代谢是自适应性的,靶向Gln代谢联合抑制其他适应性应答,可望产生临床疗效。
胰腺导管腺癌(PDAC)
谷氨酰胺(Gln)
谷氨酰胺酶
代谢组学
蛋白质组学
Hox基因
急性髓系白血病的分子调控:Hoxa9/Meis1-miR-146a
① 转录因子Meis1在Hox基因过表达的前提下,驱动髓系白血病的发生;② 泛(磷酸化)蛋白质组学分析提示:Meis1促进Syk的蛋白表达与活性,Meis1依赖性反馈环上调Syk,剖析此环,Syk成为miR-146a的直接靶点,通过转录因子PU.1,Meis1间接调控其表达;③ Hoxa9过表达前提下,Syk信号诱导Meis1,概括了Hoxa9/Meis1驱动的白血病的几个白血病形成特征;④ 抑制Syk则破坏该调控环,延长Hoxa9/Meis1驱动的白血病小鼠的生存期。
Hox基因
转录因子Meis1
小miR-146a
蛋白质组学
转录因子PU.1
新抗原
套细胞淋巴瘤:neoantigen主要来自Ig可变区基因突变
① 肿瘤体细胞突变可产生新抗原,每位患者的新抗原的鉴定和验证是目前的难点;② 采用整合基因组和蛋白质组方法,分析组织相容性复合体(MHC)I和II分子提呈的肿瘤抗原肽,可发现新抗原;③ 在套细胞淋巴瘤中,新抗原主要来自于免疫球蛋白(Ig)可变区的体细胞突变,被MHC II特异性地提呈;④ 新抗原特异性循环CD4(+)T细胞,可介导对淋巴瘤细胞的杀伤;⑤ Ig可变区体细胞突变产生的新抗原,可作为淋巴瘤免疫治疗的新靶点。
新抗原
肿瘤基因组
蛋白质组学
组织相容性复合体(MHC)
淋巴瘤
蛋白质组学
乳腺癌中如何靠谱地选定治疗的靶点:多组学综合分析
① 文章应用基因组学和蛋白质组学的工具,比对和验证了24例乳腺癌移植瘤模型可能的抗癌靶点;② 多数情况下,基因组学和蛋白质组学预测结果类似: 比如受体酪氨酸激酶(RTK)的活性;③ 但是也有一些不一致: 比如AKT高表达和 ARAF, BRAF, HSP90AB1 磷酸化位点;④ 所以需要同时结合基因组学和蛋白质组学的结果,综合分析,才能选定靠谱的靶点;⑤ 在移植瘤模型中应用综合分析,对HER2扩增以及PI3K信号通路活化的肿瘤进行治疗,获得了成功。
蛋白质组学
基因组学
异种移植瘤模型
乳腺癌治疗
蛋白质组学
血液蛋白质组学:寻找最合适的肿瘤标志物
① 肿瘤早期诊断的概念,助推了精准诊断,肿瘤的早期诊断可让患者获益更多;② 亲和蛋白质组学可准确测量血清中的诊断信息,这些可操作的信息可用以指导肿瘤的精准和循证医学治疗(预测性标志物)以及精准预测预后(预后性标志物);③ 从单一标志物的应用转变为多个含可评估信息的标志物的联合应用,称之为识别特征,可大幅提高诊断的准确率;④ 本文综述了血液蛋白质组学(液体活检),阐述了蛋白质生物标志物识别特征的临床应用。
蛋白质组学
识别特征
液体活检
精准诊断
生物信息