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Yue Zhao
文章数:2篇
菌群分析
用于交互式菌群分析和可视化的R包:animalcules
本文介绍了animalcules,这是一个R包,用于通过R Shiny提供的交互式界面或各种命令行函数进行交互式菌群分析。它是第一个支持所有16S rRNA、基于DNA的鸟枪宏基因组学和基于RNA测序的宏转录组学数据集分析的菌群分析工具包。 animalcules可以从GitHub网站https://github.com/compbiomed/animalcules上免费下载,也可以通过Bioconductor网站https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/animalcules.html进行安装。
菌群分析
可视化
交互式工具包
生物标志物鉴定
肺癌
多组学数据助力肺癌研究
通过多组学研究手段研究菌群-宿主互作将成为疾病研究的有力手段。本文通过重点分析Tsay等人对于PI3K通路通路的研究,强调了多组学计算分析、体外及体内实验验证对于研究肺癌病发过程中的菌群-宿主互作的重要性,对指导癌症病发机制研究、开发基于菌群干预的新型治疗手段都具有参考价值,值得专业人士关注。
肺癌
菌群干预
多组学分析
全RNA测序
菌群-宿主相互作用