Gary G Borisy

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Gary G Borisy

文章数：4篇

宏泛基因组

宏泛基因组学剖析口腔菌群

Genome Biology上发表文章，提出用宏泛基因组学对现下的微生物组大数据进行深度分析，具体以口腔微生物组副流感嗜血杆菌、罗斯氏菌属为例。其工作流程包括泛基因组建立（Pagenome）、宏基因组拼图最终将二者对比覆盖建立泛宏基因组学（Metapangenomics）。此种方法在菌群的生态学、进化学等领域研究中具有实际推进意义。

宏泛基因组口腔菌群生态研究论文基础研究大数据分析

口腔微生物组

Cell子刊：口腔中的微生物组成和分布（综述）

人类口腔是微生物生态学的天然实验室。Cell Host and Microbe最新发表的综述中，介绍了口腔内微生物的组成和分布及其影响因素。口腔中微生物群动态平衡取决于多种相反的因素，如唾液的流动和粘附，唾液的流动对附着于口腔基质有选择性的要求，细菌既可以保留在口腔内，也可以定位到一个有利的代谢环境；如生物膜的脱落和再生，不同口腔部位的独特群落的发展是通过微生物与不同口腔基质的不同结合、残留的微生物生物膜的再生实现的；如宿主和微生物的相互作用，宿主和微生物群落通过结合相互作用、免疫监测和营养物质和溶质的梯度相互影响。同时，文章还探讨了口腔微生物是如何受微米级尺度的短期和长期相互作用影响的，微尺度结构阐明了个别微生物类群的作用，并有利于深入了解其群落生态学和潜在致病性。推荐阅读！

口腔微生物组口腔菌群

Cell子刊：揭示舌背菌群的空间结构

《Cell Reports》近期发表的一项研究，通过成像和测序分析，研究了舌苔上不同细菌的空间分布结构特点，强调了在物种水平上的高分辨率成像对于研究菌群及其与宿主互作的重要性。

舌苔菌群 Oral microbiome fluorescence imaging microbial ecology spatial organization

PNAS：“看到”肠道细菌的空间分布

这是Jeffrey I Gordon等人在9月发表在PNAS的重要研究，通过将已知菌群移植到小鼠并利用原位杂交及光谱成像分析研究不同菌株的空间分布情况。文章五颜六色，看起来漂亮，更令人激动！相关技术会推动肠道菌群的研究变得可视化，进而更深入。

空间分布 Wentao Jiao Xin Jiang Mao Ye