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Haokui Zhou
文章数:3篇
微生物组分析工具
中科院深圳先进院:群体规模的微生物组分层和关联分析的新工具
Genome Biology近期发表了来自中科院深圳先进院周豪魁和赵国屏院士与团队的研究,介绍了他们团队开发的一个微生物组数据分析工具——tmap,可用于分析群体规模的微生物组变化及其与宿主或环境因素的关联性。
微生物组分析工具
Microbiome-wide association analysis
Topological data analysis
Population-scale microbiome
Microbiome stratification
结直肠癌
于君等:肠道病毒组特征或可用于大肠癌诊断和预后评估
Gastroenterology近期发表了香港中文大学于君团队主导的研究,鉴定出与结直肠癌相关的肠道病毒组特征,或可用于结直肠癌的诊断和预后预测。
结直肠癌
肠道病毒组
噬菌体
诊断
预后
结肠直肠癌
NC:大肠癌的不同阶段,菌群结构不同
① 收集47个结直肠腺瘤及腺瘤旁粘膜配对样本、52个浸润性腺癌及癌旁粘膜配对标本和61个健康对照的肠道粘膜样本,对粘膜菌群进行分析;② 肠道粘膜中的口腔菌群成员为主的亚群落与结直肠癌(CRC)的发生相关;③ 肠道粘膜病变部位与病变邻近部位的菌群结构存在差异;④ 细菌分类群的相关性分析显示腺瘤中有早期生态失调迹象,而共同排他性关系随后在癌症中更为常见;⑤ 与之前发表的2个数据集进行比较,验证了CRC相关的粘膜菌群的变化。
结肠直肠癌
肠道粘膜菌群
口腔菌群
Yanjie Guo
Li Tang