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文章数：11篇

环境污染物

城市污染或改变皮肤微生物群！

多环芳烃（PAHs）是环境和公共卫生关注的问题，能导致皮肤过早老化和色素紊乱等不良皮肤属性。Microbiome近期发表的文章，揭示出长期暴露于PAHs污染导致人体的皮肤的细菌-真菌微生物网络结构发生变化，且这种变化与人体的皮肤状况具有相关性。研究或有助于开发利用微生物群保护皮肤免受污染的策略。

环境污染物 polycyclic aromatic hydrocarbons sequencing Skin microbiota Urban pollution

子宫内膜菌群

妊娠期子宫内膜菌群或有大作用

本研究报告了仅一例个体，前后两次子宫内膜菌群的采样和测序比较结果。两次的妊娠结局分别为自发流产和活产。而孕早期的宫内菌群也显示出巨大的差异。该研究亟需更大的样本量进行验证。或许子宫内膜菌群结构是不良妊娠结局的敏感预测指标。

子宫内膜菌群 16S rRNA endometrial microbiota Lactobacillus crispatus Lactobacillus iners

呼吸道菌群

呼吸道菌群与牛呼吸道健康（综述）

呼吸道是一个动态复杂的生态系统。有证据表明，疾病易感因素常常破坏呼吸道微生物生态系统，引起呼吸道菌群失调。形成呼吸道菌群的生态因素，以及这些复杂群落对牛呼吸系统健康的影响，是一个值得研究探索的领域。发表在Trends in Microbiology上的一项综述回顾了对牛呼吸道菌群的现状、影响因素、作用及对健康和疾病的贡献等，以帮助我们更好地了解呼吸道菌群在家畜健康和生产中的作用。

呼吸道菌群牛 bovine respiratory disease Cattle microbiota

膳食-免疫互作

高蛋白饮食可能改变老年男性的免疫调控

高蛋白质饮食影响老年人的代谢状态和身体健康。《Molecular Nutrition and Food Research》近期发表研究，发现摄取推荐量两倍的高蛋白饮食后，免疫系统的转录后调节可能发生选择性改变，但miRNA的变化较小。该结果对于研究膳食对免疫系统调控的影响具有参考价值。

膳食-免疫互作 GENE EXPRESSION Inflammation microRNA peripheral blood mononuclear cells

真核微生物

异常妊娠结局与胎盘中的真核病原体无关

Microbiome上发表的一项研究，对比了异常妊娠结局及健康分娩者胎盘样本中3种真核病原体：恶性疟原虫、酿酒酵母及刚地弓形虫，发现所使用的方法无法检测到胎盘中的上述真核病原体。

真核微生物 18S rRNA gene Fetal growth restriction infection Placenta

益生元配合饮食干预可缓解自闭症症状

包括益生菌、益生元、无麸质和无酪蛋白饮食在内的多种干预手段被用于缓解自闭症患儿的肠道症状。本研究发现无麸质和无酪蛋白的限制型饮食对改善自闭患儿的肠道症状作用有限，而益生菌配合饮食干预后可显著改善自闭症患儿状况，强调了联合干预手段的有效性和优势，值得相关人士参考。

自闭症益生元饮食干预肠道症状 GOS

于君等：肠道病毒组特征或可用于大肠癌诊断和预后评估

Gastroenterology近期发表了香港中文大学于君团队主导的研究，鉴定出与结直肠癌相关的肠道病毒组特征，或可用于结直肠癌的诊断和预后预测。

结直肠癌肠道病毒组噬菌体诊断预后

STE：绿色及非绿色家庭的室内真菌菌群

这是一项有趣的家庭环境微生物研究，专门分析了绿色及非绿色家庭的室内真菌菌群，值得认真看看。

真菌菌群 Air sampling Dust sampling Mycobiome Occupancy

Gigascience：宏基因组学研究流程如何标准化？

宏基因组学的研究发展特别是成熟的时间并不长，为此很多方法学并不统一。这篇Gigascience上的文章，呼吁研究者采用更加一致的分析方法和工作流程，很有实际意义！PS，Gigascience是华大基因主办的开放期刊，很赞是不是？

宏基因组元数据可重复性采样测序

Nanopore测序仪

AJRCCM：Nanopore新技术，快速鉴定肺炎病原菌！

在临床实践中，快速检测并明确感染性疾病的病原体，对治疗意义重大。但传统的方法仍然主要依赖于19世纪末就有的培养技术，效率很低。临床上一直迫切需要能快速、准确且低成本的病原体检测技术，之前二代测序被寄予厚望，但一些固有短板还是阻碍了它的应用。现在，测序技术突飞猛进，其中英国的Nanopore公司势头很猛，所开发的测序仪甚至只比U盘大一点。这项研究正是介绍了利用这样的掌上测序仪，如何推动病原体的快速准确检测。虽然这离临床应用的距离还较远，但总归是个很重要的进步，特别推荐给大家！

Nanopore测序仪肺炎病原菌宏基因组临床宏基因组 pneumonia

PNAS：不同文库制备方法对微生物组测序影响巨大

去年发表在PNAS上的重要文献，对不同文库制备方法对基因组和功能属性影响做了详细研究分析，是很值得一读的方法学文献。

genomics Microbiome sequencing