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宏蛋白组学
文章数:10篇
限时进食
长期限时饲喂靶向乳酸菌、Akk菌功能?
npj biofilms and microbiomes最新发表的文章,通过宏蛋白组学分析,揭示禁食相关的饮食方式或可特异性促进益生菌阿克曼氏菌(Akk)、乳酸杆菌及其多种活性功能。
限时进食
研究论文
宏蛋白组学
肠道菌群
结直肠癌
国内团队:宏蛋白质组分析揭示大肠癌患者的肠道菌群功能变化
来自复旦大学附属口腔医院的Liang Qiao团队及长海医院的Qin Qin团队在NPJ Biofilms and Microbiomes上发表的一项最新研究,对比分析了结直肠癌患者与健康人的肠道菌群宏蛋白组,鉴定出了341个有显著差异的菌群蛋白,发现在结直肠癌患者中,铁摄入/转运、DNA复制/重组/修复相关的菌群蛋白显著富集。
结直肠癌
宏蛋白组学
结直肠癌
Jayne S Danska
Quin Yuhui Xie
2型糖尿病
国内团队:前驱糖尿病与未治疗2型糖尿病患者的肠道菌群变化
来自深圳华大基因研究院团队与苏州疾控中心团队合作在EBioMedicine上发表的一项最新研究,通过对未经治疗的2型糖尿病患者、前驱糖尿病患者及血糖正常的健康人的肠道宏基因组及宏蛋白组进行分析对比,鉴定出了2组患者在肠道菌群及功能上的变化。
2型糖尿病
metagenomics
Metaproteomics
prediabetes
Treatment-naïve type 2 diabetes
宏基因组
五氯酚暴露对真菌群落的影响
五氯酚是一种常用农药,可用于除草、防霉和木材防腐等。Microbiome 上的一项研究,关注了五氯酚对真菌群落结构、蛋白质表达和代谢的影响。
宏基因组
宏蛋白组学
五氯酚
真菌群落
环境科学
瘤胃微生物
Nature子刊:驼鹿瘤胃菌群通过互营养谱写碳代谢乐章
瘤胃菌群具有很强的植物多糖降解与利用能力。多组学分析发现,在驼鹿瘤胃菌群中,主要参与植物多糖碳代谢的物种来自于拟杆菌门,编码了 91% 的糖苷水解酶基因。特别是该门下所属的 RC9 肠道菌群体和普氏菌属微生物编码了一半以上的多聚糖利用位点。不同物种之间团结协作,最终完成了分解植物纤维的任务。
瘤胃微生物
瘤胃代谢
瘤胃病毒
宏基因组
宏蛋白组学
宏蛋白组学
Microbiome:全自动宏蛋白组数据分析平台MetaLab
这是一项重要的方法学研究,研究者开发了直接利用质谱原始数据快速进行微生物蛋白质鉴定和分类分析的全自动分析软件,多位中国年轻学者在美国参与研究和软件开发,他们未来的研究成果值得长期持续跟踪。
宏蛋白组学
Inés Martínez
Jens Walter
功能
Microbiome:宏蛋白质组学揭示健康人肠道菌群的功能
最近关于宏蛋白质组学的研究越来越多发出,Microbiome上的的这篇,又是其中的优秀作品,对健康人肠道菌群的功能进行了一定的研究,很值得深读。特别推荐!
功能
宏蛋白组学
Faecalibacterium
Gut microbiota
Metabolic pathway
肝硬化
BMC Gastroenterology:肝硬化患者的宏蛋白组学特点
分析3名肝硬化患者的宏蛋白组学,鉴定并注释5020种蛋白(88%来自细菌,12%来自人体),通过分析,肝硬化患者的宏蛋白组中包含了一个由119种蛋白组成的核心宏蛋白组。
肝硬化
粪便菌群
宏蛋白组学
Limin Zhang
Andrew D Patterson
微生态学
Nature子刊:研究微生物,只靠多组学根本不够!
Nature Microbiology新文章明确提出,要结合多组学、培养和生态学的研究,我们才能准确掌握微生物和微生态的规律,很值得一看的文章,强烈推荐。
微生态学
宏基因组学
宏转录组学
宏蛋白组学
宏代谢组学
宏蛋白组学
Microbiome:新的宏蛋白质组学定量定性分析工具
相比于宏基因组学研究,宏蛋白组学研究能更好解读肠道菌群的生物活性,那么有什么靠谱的分析工具呢?本文推荐一读。
宏蛋白组学
肠道菌群
定性
定量分析
Shahla Abdollahi-Roodsaz