Marie-Agnès Petit

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Marie-Agnès Petit

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Nature子刊：婴儿肠道中烈性大肠杆菌噬菌体的数量少，但感染性强

噬菌体是人类肠道微生物的重要组成部分，但对肠道菌群的影响，我们知之甚少。Nature Communications最近发表的研究，从一岁大的婴儿粪便样本分离出的大肠杆菌中，有60%以上会自发释放温和噬菌体，但这些温和的噬菌体在大肠杆菌上的宿主范围很窄。从粪便样本中也分离出了烈性噬菌体，这些噬菌体的宿主范围要大得多，这或许有助于它们在本生态系统中的存活，并在肠道菌群动态中发挥作用。本研究强调了开发培养学方法以更好地了解噬菌体在肠道菌群中的生物学作用的重要性。

婴儿菌群噬菌体大肠杆菌温和噬菌体烈性噬菌体

肠道菌中的原噬菌体如何影响细菌-噬菌体的的协同进化？

环境因素，如食物或抗生素的使用，会改变肠道菌群的组成，但它们的总体影响仍然相对较低，而噬菌体可能是解释物种丰度随时间变化的重要因素。肠道细菌内藏有大量的原噬菌体或休眠病毒，这些病毒可进化为极具毒性的噬菌体突变体，可能导致重要的细菌死亡。这种现象是否会在哺乳动物的微生物群中发生尚不清楚。ISME Journal发表的一篇文章，研究了温和噬菌体在定殖了Roseburia intestinalis L1-82和大肠杆菌小鼠中的协同进化。结果表明，Roseburia intestinalis L1-82超毒性突变噬菌体Shimadzu侵入了这个简化的肠道生态系统，并溶解绝大多数易感细菌，且噬菌体介导的细菌死亡驱动了细菌噬菌体抗性的快速进化。本研究表明，原噬菌体并不总是处于休眠状态，且在微生物群组成的短期时间变化中发挥重要作用。

噬菌体罗斯拜瑞氏菌进化肠道菌群 Haitao Chen

柔嫩梭菌群

Microbiome：肠道中的柔嫩梭菌群噬菌体或与IBD相关

Microbiome发表的一项最新研究，在柔嫩梭菌群的基因组中鉴定出了18种前噬菌体，其中有4种在IBD患者丰度增加，可能与IBD患者的柔嫩梭菌群减少相关。

柔嫩梭菌群噬菌体 Geoffrey D Hannigan Patrick D Schlossa