Pathogen detection

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宏基因组病原检测

宏基因组测序技术运用于病原检测（综述）

高通量测序有望提高感染性疾病的病原检测和诊断效率。《Annual Review of Pathology-Mechanisms of Disease》近期发表综述，系统性介绍了宏基因组病原检测的平台、流程、优势与局限性以及代表性临床案例，对于详细了解该技术有重要参考价值。

宏基因组病原检测 clinical diagnostics infectious disease metagenomics nanopore sequencing

宏基因组分析方法

一个新的宏基因组分类器KrakenUniq

KrakenUniq可被视为是在Kraken基础上附加了k-mer信息之后的一个改进型。

宏基因组分析方法生物信息学工具 Infectious disease diagnosis metagenomics Metagenomics classification

宏基因组和生物信息学进行病原检测的进展和未来

这是M3组织（Mid-Atlantic Microbiome Meet-up）的一份会谈（会议举办日为2018年1月10日）纪要，着重指出了宏基因组进行病原检测中生物信息学工具的关键作用，指出了面临的挑战和未来的发展方向。

宏基因组病原检测 Biodefense Bioinformatics Biothreats