Susannah G Tringe

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Susannah G Tringe

文章数：6篇

巨型噬菌体

Nature新发现：巨型噬菌体！

噬菌体基因组通常较小。但Nature近期发表的文章发现了不同样本，如人类、动物和环境微生物组中均存在巨型噬菌体，其中最大噬菌体的基因组拥有73.5万对碱基，比许多细菌宿主的基因组还要大的多，甚至具备CRISPR/Cas系统，颠覆了传统认知。

巨型噬菌体 CRISPR基因编辑系统 Bacteriophages environmental microbiology metagenomics

蜜蜂肠道菌群

中国农大郑浩团队：蜜蜂肠道菌群怎样分工消化花粉？

蜜蜂的食物包括花粉和花蜜，其中花粉含有多样化的多糖（如：纤维素、半纤维素和果胶），这些成分的降解和发酵需要肠道菌群参与。中国农业大学郑浩与团队在PNAS发表的一项最新研究，鉴定出蜜蜂肠道菌群中参与多糖降解的成员及其菌株差异，表明菌株组成决定了菌群的代谢能力，揭示出蜜蜂肠道微生态中不同细菌的生态位差异。

蜜蜂肠道菌群 amino acid Gut microbiota honey bee Polysaccharide

宏基因组分析方法

Nature子刊：从宏基因组中复原基因组的新方法

Nature Microbiology上发表的一篇方法学文章，介绍了一种新的宏基因组分箱工具——DAS Tool，可用于分析各类宏基因组样品，包括人体肠道、水体、土壤的宏基因组数据。

宏基因组分析方法宏基因组分箱宏基因组生物信息学 Jasenka Zubcevic

细菌基因组

Nature子刊：微生物如何适应植物的？

是什么使病原和共生菌都能与真核宿主保持密切联系呢? Nature Genetics于发表了美国北卡教堂山的Jeffery L. Dangl团队领衔，美国能源部JGI研究所的Tanja Woyke和Susannah G. Tringe共同通讯的文章"Genomic features of bacterial adaptation to plants"，揭示了微生物是如何在与植物的共生、竞争、致病中与植物基因组共进化的历史。同期还配发了Ryan A. Melnyk和Cara H. Haney两位大佬的news & views对文章的导读和重要性评价。重镑成果，值得细读。

细菌基因组植物宏基因组基因家族同源序列

Microbiome：植物根围菌群，也按生物钟昼夜变化

关于植物根围菌群昼夜节律的研究，很有意思，特别推荐。

拟南芥昼夜节律根围菌群 Arabidopsis Bacterial community structure

野生多年生植物

NC：植物基因型与年龄影响叶和根部微生物组

有一篇高水平的植物微生物组相关研究，对于林业农业种植业有启发不？

野生多年生植物宿主基因型年龄叶微生物组根微生物组