Peter J Campbell

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Peter J Campbell

文章数：5篇

胎盘基因组

Nature：人胎盘基因组学研究新进展

胎盘基因组改变可能是胎盘功能障碍的发病机制，这是所谓胎盘功能障碍（包括先兆子痫，胎儿生长限制和死产）的关键决定因素。本研究发现，基因组改变通常在胎盘内并不均匀分布，这可能解释了在存在镶嵌的情况下观察到的那些妊娠结果的可变性。

胎盘基因组研究论文胎盘固有镶嵌现象基因突变

炎症性肠病

Cell：慢性炎症改变了结肠细胞的演化

慢性炎症中存在反复发生的组织损伤和修复，这可能增加细胞基因突变，与癌症风险增加相关。体细胞突变促进癌症发展，但在癌症以外的疾病中，体细胞突变的模式、负担和功能后果尚未得到广泛研究。Cell上发表的一项新研究，通过对比炎症性肠病（IBD）患者与健康人的肠隐窝全基因组测序数据，揭示了受慢性炎症所累的结肠细胞的基因突变负担和特征，以及相关的克隆结构异常，表明结肠粘膜的体细胞演化可能引发、维持或延续IBD。这些发现有助于加深对IBD等炎症性疾病的理解，为这类疾病的治疗带来新启示。

炎症性肠病体细胞演化 INFLAMMATORY BOWEL DISEASE somatic mutations mutation rate

Nature：健康肝细胞如何向疾病状态转变

慢性肝病最常见的病因是过量饮酒、病毒性肝炎和非酒精性脂肪肝，临床范围包括肝脏炎症、肝硬化、肝功能衰竭和肝细胞癌（HCC）等。HCC基因组表现出不同的突变特征，导致30个以上癌症基因的反复突变。来自正常肝脏的干细胞突变负担低、多样性特征有限，这预示了健康肝细胞进展为慢性肝病以及随后的恶性转化过程变得更为复杂。最新发表在Nature杂志的研究，对来自5个健康肝脏和9个肝硬化肝脏的100-500个肝细胞的482个显微解剖进行全基因组测序，对比了健康肝脏和肝硬化肝脏的突变负担及活跃程度。该研究提供证据证明体细胞突变记录了肝脏组织从健康状态到疾病状态的暴露、毒性、再生和克隆结构。

肝癌肝硬化突变负担克隆扩张驱动突变

Nature：结直肠癌变之前的体细胞突变

目前对结直肠腺瘤-癌的测序为理解连续性的体细胞遗传改变及致癌克隆扩增提供了一个较为全面的框架。然而，对于结直肠细胞以及其他组织细胞最初新生改变的理解还比较模糊，这些改变可能发生在形态正常的组织中。最新发表在Nature杂志的一项研究，从42名年龄在11-78岁参与者的正常上皮组织中分离出2035个结肠隐窝，并对其基因组测序。该发现揭示了多个突变过程的特征，其中一些是普遍存在且和连续的，而另一些只出现在某些个体的某些隐窝中或出现在生命的某个时期。在中年人中，大约1%正常结直肠隐窝中存在可能的肿瘤驱动突变，这表明腺瘤和癌是正常结直肠上皮中普遍存在的致瘤改变过程的罕见结果。与正常细胞相比，结直肠癌的突变负担明显增加。正常结直肠细胞测序为肿瘤的基因组和克隆进化提供了定量分析。

结直肠癌结直肠腺瘤基因组测序突变特征突变负担

Nature：用类器官研究大肠癌的肿瘤内异质性

类器官在癌症研究中的重要性不断凸显，本周Nature再发一篇类器官用于结直肠癌的研究。研究者培养患者肿瘤的单细胞衍生类器官，并分析这些类器官的基因突变、DNA甲基化、转录组和药物反应情况，对肿瘤内部的异质性进行研究。使用单细胞衍生的类器官可以克服单细胞层面研究中“材料不足”的困难，有广阔的研究应用前景。

类器官结直肠癌(CRC) 单细胞肿瘤内异质性 Cancer genomics