基因组进化

搜索
登录

基因组进化

文章数：4篇

四川大学：大肠癌多器官转移的基因组进化研究

从结直肠癌原发部位到肝脏和肝外器官转移的系统进化相关研究很少，目前尚不清楚是否需要根据CRC全身转移的不同模型修改治疗策略。Gut近期发表的来自四川大学Zong-Guang Zhou和Heng Xu团队的研究，对6例结直肠癌(CRC)患者的匹配原发肿瘤、邻近非癌黏膜、肝转移和肺转移的多个区域(n=74)进行全外显子组测序。利用系统发育重建和进化分析研究了结直肠癌转移模式和克隆起源，对患者的复发驱动基因突变进行分析，并在独立队列中进行了验证。本研究结果为转移进化提供了基因组学证据，提示结直肠癌术后多器官或晚期转移患者可以考虑进行转移活检/测序。

结直肠癌基因组进化转移模型

Nature Reviews：噬菌体的多样性、基因组与进化（综述）

病毒宏基因组学的最新进展使人们能够在从人类肠道到深海的众多环境中迅速发现空前的噬菌体目录。尽管这些进展扩大了我们对噬菌体基因组多样性的理解，但也表明我们的研究相当初步。尽管噬菌体在核苷酸序列水平上具有非常高的多样性，但形成病毒颗粒的结构蛋白仍具有很强的相似性和保守性。从进化的角度来看，噬菌体具有独特的相互联系，并响应宿主的选择性压力而经历多种基因交换事件，从而驱动了它们的多样性。本篇Nature综述介绍了噬菌体在结构，基因组和群落水平上的多样性，以及噬菌体之间复杂的进化关系，这些噬菌体是由其基因组的镶嵌性塑造的。强烈推荐阅读，是噬菌体领域同行的必读入门教科书。

噬菌体 Bacteriophages biodiversity metagenomics Phage biology

PNAS：昆虫内共生菌在进化中分裂为多个谱系

这是发表在PNAS[IF：9.661]上关于某种蝉科昆虫的内共生菌复合体起源的研究。该研究表明，多个Hodgkinia cicadicola菌株是从共同的始祖菌株“分裂”而来，形成共生菌复合体，彼此间通过基因组互补以行使完整的功能；与此相似的是线粒体基因组，在不少真核生物中，线粒体基因组并非是完整的环状结构，而是以多个“碎片”的形式存在。有趣的研究，推荐专业人士阅读。

蝉科基因组进化线粒体细胞器内共生菌

全基因组测序

Nature综述：病原细菌在体内到底是怎么变异的？

① 细菌单基因组变异速率可能超过RNA病毒；② 全基因组测序可跟踪病原菌从定植到感染间进化的全过程；③ 特别适用于研究趋同进化模式：条件致病菌如何让宿主慢性感染，及产生耐药性的进化过程；④ 宿主内病原菌进化的研究，可预测细菌感染的临床进展，并选择最佳治疗方案。

全基因组测序基因组进化病原体