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Protein variants
文章数:2篇
Phage mutants
天津科技大学:噬菌体或通过假定基底楔形蛋白突变以扩大宿主谱
这是发表在Microbiome上的一份工作,由天津科技大学杨洪江教授及其团队完成。他们通过铜绿假单胞菌O特异性抗原缺陷菌株筛选获得了不依赖于O抗原的K8突变体K8-T239A,该突变体可实现同时以O抗原和核心寡糖作为受体侵染细菌,达到更强的杀菌效率。通过分析发现,这种突变体发生在假定基底楔形蛋白GP075上,突变后的GP075m改变了噬菌体蛋白间的互作方式,使其可结合核心寡糖,但不能结合GP076,同时该突变体病毒粒子在环境中的稳定性降低。发生在GP075上的K8突变体较多,表现出该假定底板楔形蛋白在宿主范围变化中的重要性,但值得注意的是本研究筛选出了另外一株可感染O特异性抗原缺陷菌株且并非在GP075上发生突变的K8突变体K8-X,该突变体的突变发生在GP011和GP076,暗示着可能存在不同的宿主范围改变机制。
Phage mutants
Protein variants
Wedge protein
Viral gene reservoir
BRAF基因突变
孔乙己说:BRAF基因有三种”写法“
① BRAF是一种丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶,参与高度致癌性的RAS/RAF/MEK/ERK信号通路;② BRAF在肿瘤发展中起重要作用,约7%肿瘤都携带有BRAF突变,最常见突变为V600E,但对BRAF基因的表达调控机制还不清楚;③ 本文对9种癌症类型超过4800位病人的RNA-seq数据进行分析,发现BRAF mRNA有三种亚型,它们在编码序列最后一部分,长度及 3'UTR序列上有所不同;④ 三种亚型的蛋白表达丰度在不同类型肿瘤中是不一样的,可根据其表达情况针对性治疗。
BRAF基因突变
RNA测序
转录组分析
BRAF
Exon-spanning reads