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Jordan E Bisanz
文章数:11篇
菌群编辑
Cell子刊:基于噬菌体的菌群编辑新工具
菌群的精准编辑是一个重要的研究方向,Cell Reports近期发表的一项研究表明,丝状噬菌体M13可作为向肠道定植的细菌进行基因递送的媒介。使用M13递送CRISPR-Cas9系统,可在肠道中靶向携带特定靶基因的菌株,并能诱导靶细菌的基因组缺失。
菌群编辑
噬菌体
种族差异
肠道菌群的种族差异:东亚人PK白人
东亚人与白人有不同的体质特征,比如东亚人BMI较低,白人BMI较高。eLife近期发表的一项研究,分析了IDEO队列中生活在美国旧金山湾区的46名东亚人和白人受试者,揭示了不同种族间的菌群差异,及其与代谢健康的潜在关系。
种族差异
肠道菌群
代谢
饮食-菌群-宿主互作
Nature:节食减肥,与菌群的定植抗性降低有关?
热量限制能有效减肥和改变肠道菌群,Nature发表的一项最新研究通过人体干预研究和小鼠实验表明,极低热量限制饮食干预(每天摄入800kcal)会引起肠道菌群发生可逆的变化,从而促进饮食干预引起的减重。而这种作用不仅与菌群对热量吸收的调控有关,还与节食后菌群对艰难梭菌的定植抗性降低有关,而艰难梭菌的富集竟然在一定程度上介导了菌群促进减重的作用。该研究为节食减肥提供了一种新的菌群机制,揭示了饮食-菌群互作对宿主能量平衡的影响,以及饮食对致病共生菌和有益共生菌的互作平衡的调控作用。
饮食-菌群-宿主互作
热量限制
肠道菌群
定植抵抗
艰难梭菌
肠道疾病
热平衡有助于小鼠对肠道疾病的耐受性
疾病耐受性是指组织在不降低宿主适应性的情况下,抵抗刺激所造成损伤的能力,与组织、环境条件和生理状态有关。疾病耐受性是一种已知的宿主防御策略,保护组织免受病原体或免疫系统导致的损伤,但其在非感染性疾病中的作用尚不清楚。PNAS近期发表的文章,发现处于热平衡的小鼠具有对肠道疾病的耐受性。肠损伤中,产热脂肪的肾上腺素信号调控结肠细胞基因表达,从而预防菌群失调和组织损伤,产生肠道疾病的耐受性。同时表明疾病的耐受性对代谢的要求较高,依赖于宿主的能量状态。
肠道疾病
热平衡
代谢
肠道菌群
神经免疫
Science子刊:靶向肠菌的B细胞在多发性硬化发病时入脑,或起保护作用
多发性硬化(MS)是一种中枢神经系统(CNS)的自身免疫性疾病,肠道菌群和B细胞可能影响MS的发生发展。Science Immunology近期发表研究,通过分析MS患者的样本表明,在MS发病期间,源于肠道的IgA+ B细胞会跨越血脑屏障,迁移至大脑病灶处释放IgA抗体,这些抗体主要与包括MS相关细菌在内的多样化细菌发生反应,而不会攻击自身脑组织,可能起到减轻神经炎症的保护性作用。这些发现为MS等神经炎症疾病的诊治,提供了潜在的生物标志物和干预策略。
神经免疫
肠-脑轴
IgA
B细胞
肠道菌群
木脂素
Nature子刊:解析4种肠道菌如何协同将木脂素转化为肠道木脂素
木脂素存在于一些植物性食物(亚麻籽、芝麻、谷物、大豆、十字花科植物和一些水果等)中,是一种植物雌激素,有抗氧化作用,被认为有潜在的抗癌和防治其它疾病的功效。但木脂素在体内要发挥作用,需要先由肠道细菌将其转化为有生物活性的肠道木脂素。Nature Microbiology近期发表的一项研究,详细解析了含4种肠道菌的菌群,如何通过5步反应将木脂素转化为肠道木脂素,并鉴定出每个步骤中编码潜在关键酶的基因。该研究为进一步解析木脂素的潜在药用功效以及肠道菌群在其中的作用,打下基础;也提示进行相关研究时,需考虑菌株水平的基因差异,以及不同细菌的共现和协作情况。
木脂素
肠道菌群
代谢
细菌酶
肠内酯
烹饪
Nature子刊:烹饪塑造肠道菌群
饮食是肠道菌群结构和功能的关键性决定因素,很多研究都着重分析不同饮食成分对菌群的影响,Nature Microbiology近期发表的一项研究则着重阐释了食物烹饪对菌群的塑造作用。该研究发现,植物性食物的生吃和熟吃,对小鼠和人类的肠道菌群均有不同的塑造作用,与食物中的淀粉是否易于消化以及植物自身的抗菌物质有关。这说明在饮食对菌群的塑造作用尚,除了食物的种类,食物的形式(生vs熟)也是重要的影响因素。人类是自然界中唯一吃熟食的物种,因此,在人与菌群的共进化过程中,烹饪可能是一种重要的进化选择压力。
烹饪
metabolomics
Microbiome
食物加工
生食
噬菌体-细菌相互作用
Cell子刊:揭秘人肠道细菌的CRISPR-Cas系统
噬菌体大量存在于人类肠道,但其与肠道细菌的相互作用有待探究,尤其是在细菌的“免疫系统”CRISPR-Cas系统层面。Cell Host and Microbe近期发表一项研究,对一种常见人肠道细菌——迟缓埃格特菌的CRISPR-Cas系统进行了深入分析,并构建了一个人类病毒组数据库,可用于搜索CRISPR的靶标噬菌体,有助于深入分析肠道细菌与噬菌体的互作机制。
噬菌体-细菌相互作用
CRISPR-Cas系统
人体微生物组
肠道细菌
噬菌体
饮食-菌群互作
Cell子刊:高脂饮食如何影响肠道菌群结构
饮食可影响肠道菌群,但由于不同研究之间在实验设计和分析方面存在差异,很难从不同研究中提取共性信息评估某种饮食对菌群的影响。《Cell Host and Microbe》发表的一项最新研究,对此前发表的关于高脂饮食对肠道菌群影响的研究进行荟萃分析,鉴定出不同研究间的可重复性结果,揭示出高脂饮食导致的乳球菌属富集,其实是源于饲料中的细菌DNA污染。这些发现对于研究饮食-菌群互作,以及微生物组研究的荟萃分析,都具有参考意义。
饮食-菌群互作
Microbiome
META-ANALYSIS
high-fat diet
Murine
药物代谢
Science:肠道菌群如何代谢帕金森病药物
前不久《Nature》刚发表了关于肠道菌群对药物的代谢作用的系统性研究,《Science》上线的一项最新研究再次聚焦肠道菌群如何代谢药物从而影响疗效这一问题。左旋多巴是治疗帕金森病的主要药物,这项最新研究揭示了肠道菌群代谢左旋多巴的分子机制,鉴定出参与其代谢途径的肠道细菌和细菌基因,并研发了一种可抑制菌群代谢左旋多巴的潜在药物,有望改善左旋多巴治疗帕金森的效果。
药物代谢
肠道菌群
帕金森病
左旋多巴
地高辛
人体肠道菌群中的一种还原酶可使地高辛失活
地高辛是一种植物中存在的天然毒素。eLife上发表的最新研究发现,在人体肠道菌群中普遍存在一种强心苷还原酶,可使地高辛失活。
地高辛
强心苷还原酶