肿瘤内异质性

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肿瘤内异质性

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Nature：瘤内菌群的空间分布，如何影响肿瘤异质性

肿瘤相关微生物群是肿瘤微环境的重要组成部分。然而，瘤内菌群的研究此前主要依赖于对整块（bulk）组织的分析，这掩盖了瘤内菌群的空间分布和对局部的影响。Nature最新发表的这项研究，通过空间转录组学和单细胞RNA测序方法，分析了口腔鳞癌和结直肠癌患者的肿瘤样本，并结合功能研究，发现瘤内菌群的空间分布不是随机的，其在肿瘤内的分布模式与肿瘤微环境的异质性密切相关。特定细菌对瘤内细胞的感染/黏附可以在单细胞层面改变细胞特征，并可能通过影响抗肿瘤免疫和癌细胞转移，促进癌症进展。

肿瘤菌群空间分布空间转录组学单细胞RNA测序宿主-菌群互作

胶质母细胞瘤

Nature：绘制GBM干细胞演化图谱！

① GBM具有肿瘤内遗传学异质性，GBM携带GBM干细胞（GSCs）亚群，驱动肿瘤发生；② 在一系列异种移植瘤模型中采用非偏倚方法，研究条形码编码的GBM细胞的克隆进化，体内GBM克隆的生长与中和过程一致，包括植根于GBM干细胞的保守的增殖等级递阶；③ 缓慢细胞周期干细胞样细胞引起祖细胞群体的细胞周期更新加快，自我维持能力增强，反过来产生非增殖细胞；④ 鉴定出偏离这些动力学的少见的“外层”克隆，化疗促进既存耐药GBM干细胞的扩展。

胶质母细胞瘤干细胞增殖靶向治疗细胞周期动力学

CML干细胞的分子特征：单细胞转录组

① 开发对相同的单一细胞进行联合高敏感性突变检测和全转录组的分析方法；② 对来自慢性粒细胞白血病（CML）患者疾病全程样本，分析超过2,000 SCs，揭示CML-SCs的异质性，包括鉴定出在长期治疗过程中选择性持续存在的具有不同分子特征的CML-SCs亚群；③ 鉴定出白血病急性发作特异性SC群，在患者慢性期存在的CML-SCs亚克隆，这些患者最终发展为白血病急性发作；④ 该方法，可应用于任何的恶性肿瘤，阐明单细胞分析如何鉴定治疗耐药SC的亚群。

转录组学肿瘤内异质性肿瘤干细胞(SC) 白血病急性发作