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Matthias Zilbauer
文章数:5篇
肠道细胞
Nature Reviews:人肠道细胞图谱的研究路线图
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇综述,概述了首个完整的人肠道细胞图谱的要求,讨论了整合健康肠道图谱与相关疾病及肠道类器官的关键方法和重要性,介绍了可用于研究的计算工具,并为未来的研究方向及克服关键挑战提供了建议。
肠道细胞
综述
小儿克罗恩病
Cell子刊:单细胞测序揭示儿童克罗恩病的转录特征
Developmental Cell近期发表的文章,分别对受孕后6-10周人类早期胎儿肠道样本、体外组织和体外胎儿类器官、儿童克罗恩病和健康对照的上皮细胞进行单细胞转录组测序,鉴定出循环BEX5+上皮前体细胞,揭示出类器官的成熟过程,以及儿童克罗恩病的上皮细胞中胎儿期转录因子的再激活等,为研究肠道发育和儿童克罗恩病提供了丰富的资源。
小儿克罗恩病
单细胞测序
肠道发育
人肠内分泌细胞
Cell:描绘人肠内分泌细胞的mRNA和分泌蛋白质组的高分辨率图谱
肠内分泌细胞(EEC)可感知肠道内容物并释放激素,调节胃肠道活动、全身代谢和食物的摄入。但EEC总体数量少且没有相关体外模型,对EEC各亚型及其分泌产物的研究具有挑战。近期发表在《Cell》的文章,创建了体外类器官诱导产生肠段特异性EEC和基因编辑标记EEC分泌激素的技术,绘制出人EEC表达图谱和分泌蛋白质组图谱,为深入了解人EEC的发育和功能提供了宝贵资料。
人肠内分泌细胞
mRNA图谱
分泌蛋白质组图谱
enteroendocrine cell
Organoids
结直肠癌
Nature:结直肠癌变之前的体细胞突变
目前对结直肠腺瘤-癌的测序为理解连续性的体细胞遗传改变及致癌克隆扩增提供了一个较为全面的框架。然而,对于结直肠细胞以及其他组织细胞最初新生改变的理解还比较模糊,这些改变可能发生在形态正常的组织中。最新发表在Nature杂志的一项研究,从42名年龄在11-78岁参与者的正常上皮组织中分离出2035个结肠隐窝,并对其基因组测序。该发现揭示了多个突变过程的特征,其中一些是普遍存在且和连续的,而另一些只出现在某些个体的某些隐窝中或出现在生命的某个时期。在中年人中,大约1%正常结直肠隐窝中存在可能的肿瘤驱动突变,这表明腺瘤和癌是正常结直肠上皮中普遍存在的致瘤改变过程的罕见结果。与正常细胞相比,结直肠癌的突变负担明显增加。正常结直肠细胞测序为肿瘤的基因组和克隆进化提供了定量分析。
结直肠癌
结直肠腺瘤
基因组测序
突变特征
突变负担
肠道类器官
Nature子刊:IL-2可诱导人肠道类器官的体外成熟
用人多能干细胞衍生的肠道类器官(hIO),是研究肠道发育和疾病的模型,但此前尚缺乏在体外培育成熟的方法。Nature Communications发表的最新研究,发现与T细胞共培养可诱导hIO的体外成熟,并进一步解析了背后的分子机制。这项研究在很大程度上拓展了用人肠道类器官进行体外药物筛选、基因编辑、建立疾病模型等研究的可能性,值得专业人士关注。
肠道类器官
人多能干细胞
体外分化
白介素-2
STAT3信号