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数据库资源

KEGG: 基于分类的通路和基因组分析

KEGG数据库于1995年12月首次发布时，它只包含流感嗜血杆菌的一个完整基因组和其他少数物种的不完整基因组。它现在包含超过 8400 个基因组，涵盖广泛的分类群。现在可以使用新开发的 KEGG 基因组浏览器更好地分析染色体上基因的物理链接，然后可以使用分类树的 Brite 层次结构查看器检查这些链接。Nucleic Acids Research发表的这篇文章报告了这一点以及过去 2 年的其他进展，KEGG网站 (https://www.kegg.jp/kegg/docs/relnote.html) 的发行说明中也总结了这些进展。

数据库资源标识符层次结构查看器基因组浏览器分类树

生物信息学工具

更可靠的定位疾病相关物种类群

传统上，如果需要得到最低分类级别上物种类群，通常直接在对应分类级别上进行关联分析。这忽视了微生物之间在演化上存在的固有联系。massMap 通过整合分类树，分两步定位关键物种，优化了相应的分析结果。

生物信息学工具菌群-疾病关联性分类树进化树 Alexei Verkhratsky