Eric JC Gálvez

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Eric JC Gálvez

文章数：3篇

急性肝脏损伤

急性肝损伤与肠道菌群失调什么关系？

肠道生态失调与肝病的发生发展密切相关，但很少有研究探讨肠-肝互作在急性肝损伤中所起的作用。CMGH Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology近期发表的文章，探讨了肠道菌群失调在急性肝损伤中的作用。研究首先评估了摄入质子泵抑制剂（PPI）或长期抗生素治疗（PPI或抗生素治疗是肠道菌群失调和屏障损伤的诱因）与急性肝损伤的风险。又利用Nlrp6-/-小鼠模型，发现亚致死剂量的乙酰氨基酚可导致小鼠肠道菌群失调、屏障损伤和细菌易位。Nlrp6-/-小鼠的共生菌群诱导肝脏单核细胞来源的巨噬细胞出现Ly6Chi表型，并加剧急性肝损伤，且该表型可通过粪便菌群转移至WT小鼠。本研究结果提示肠道菌群或可作为急性肝损伤的潜在治疗靶点。

急性肝脏损伤肠道菌群 Nlrp6

普雷沃氏菌

Cell子刊：未知肠道普氏菌种的发现与解密——多糖利用能力越高，竞争力越强？

普雷沃特氏菌(Prevotella)具有菌种多样性，是人类肠道中的优势菌属，特别是在饮食富含蔬菜的人群中。Cell Host & Microbe发表文章揭示了小鼠肠道菌群中尚未定义的Prevotella菌种，并阐述了它们是如何‘干掉’同属其它菌株，最大化竞争优势。其中至少三个关键菌株被成功分离、复活，基因测序纳入数据库，为后续研究提供更多可能性。

普雷沃氏菌多糖利用位点 Prevotella spp . diet competition

小鼠肠道菌群

Cell子刊：小鼠肠道宏基因组包含460万个基因和660个基因组的基因集

通常，参考基因目录的生成涉及特定于样品的组装，基因预测以及基因条目的全数据集聚类，以减少冗余。但是，这种方法导致基因条目的物种分类学分辨率降低。这是由于高度相关但截然不同的基因的聚类以及缺乏高分辨率的分类学信息所致。大规模宏基因组学方法面临的一个具体挑战是将特定的16S rRNA基因序列与MAGs连接起来，这通常导致连接率较低。在这里，作者提出了一种综合的方法和相应的计算流程来构建整合的基因目录，从而显著改善了基因条目的物种分类学分辨率，并将基因链接到MAGs(宏基因组装配的基因组）和重建的全长16S rRNA基因。整合的小鼠肠道宏基因组目录（iMGMC）由298个可公开获得的新测序的宏基因组样本构建而成。此外，本文提出了一组另外的MAGs，它们是从898个宏基因组测序样品的单独单样品组装中获得的，与整合到iMGMC中的MAGs一起组成了1,296种细菌水平的细菌基因组。

小鼠肠道菌群基因目录微生物组宏基因组装配基因组 Mouse gut microbiota