差异裂解法

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差异裂解法

差异裂解法可为肠道宏蛋白质组学选择性提取种类特定的蛋白

菌群的宏蛋白质组检测是对菌群的功能性检测，而目前，针对丰度较低的菌群及其功能产物的研究常被忽略，Analytical Chemistry的这篇文章通过差速离心增加人体粪便细菌的提取量，然后使用两种五步差异裂解法DL1和 DL2。DL1和DL2的五步里均有逐步增加的SDS浓度（0，0，1%，2%，4%），但DL1前4步均有1分钟超音波，而DL2没有，二者的第五步均有一个10分钟的超音波。发现细胞壁较厚的革兰氏阳性菌提取量随SDS的增加而增加，而细胞壁较薄的革兰氏阴性菌的提取量则随SDS的增加而减少，相应的，蛋白种类和数量也因为提取方法的不同而不同。作者在这里给我们提供了一个可供参考的粪便蛋白提取方案，可根据我们的不同需求调整。

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