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Colin Hill
文章数:18篇
肠道微生物组
如何分离和鉴定人类肠道微生物组中的噬菌体?
Gut Microbes近期发表的文章,详细介绍了如何从人粪菌群落中分离和鉴定感染狄氏副拟杆菌的裂解性噬菌体ΦPDS1,或为分离噬菌体提供新的方法和思路。
肠道微生物组
噬菌体
狄氏副拟杆菌
炎症性肠病(IBD)
感染瘤胃球菌的温和噬菌体
瘤胃球菌是一种常见的肠道微生物,在炎症性肠病(IBD)患者中丰度更高。Gut Microbes近期发表的文章,鉴定出感染瘤胃球菌的温和噬菌体,该噬菌体可与肠道细菌共存,在IBD患者肠道丰度也更高。
炎症性肠病(IBD)
瘤胃球菌
噬菌体
后生元
后生元在临床治疗中的应用(综述)
2021年,国际益生菌与益生元科学协会建议将灭活的菌体和/或菌体成分与人体健康有益的制剂统称为后生元。临床试验是研究后生元健康作用的有效途径,但目前关于后生元临床研究相对较少。近日,科克大学研究人员在Gut Microbes发表最新综述,系统的论述了后生元在临床治疗中的应用。目前的证据表明,后生元在改善急/慢性腹泻、免疫功能、过敏反应、神经退行性疾病具有较明显的效果,且稳定性和安全性较好。但后生元健康作用也需经过大量的科学循证,未来可以借鉴益生菌健康作用的研究方法,构建更科学、更合理、更完善的量效关系评价方法,为后生元制剂健康持续发展提供更有力的支撑。
后生元
临床应用
综述
基础研究
微生物制剂
病毒组
Nature子刊:绘制哺乳动物肠道和实质器官的病毒生物地理图谱
哺乳动物病毒组与健康和疾病有关,但目前关于其沿哺乳动物胃肠道和其他器官的横纵轴结构如何分布,这方面的研究知之甚少。近日发表在Nature Microbiology上的这篇文章,通过宏基因组对家猪和恒河猴这两种代表性哺乳动物的胃肠道、实质器官的病毒进行了全面的生物地理分析,绘制出详尽的哺乳动物肠道和实质器官的病毒生物地理图谱,并发现胃肠道病毒组具有高度的空间和物种特异性,为未来研究哺乳动物肠道病毒组提供了重要的资源。
病毒组
噬菌体-细菌互作
Nature Reviews:噬菌体和细菌在人体肠道中的互作(综述)
噬菌体依赖细菌进行复制和存活,两者间的互作可能是生物圈中最频繁的生物事件。传统观点认为噬菌体是细菌的捕食者,最近发表在Nature Reviews Microbiology的综述,认为噬菌体与细菌在群体水平上可能不再是简单的捕食者与猎物关系,而是互利共存伙伴,它们会共同进化从中受益。此外,噬菌体还会显著地影响细菌基因型和表型多样化、作为对抗外源细菌入侵的武器、还可协助细菌间发生水平基因转移,促进菌落适应性进化等。总之,该综述促进了人们对噬菌体和细菌关系的重新思考,也为未来利用噬菌体操纵微生物群提供了新思路。
噬菌体-细菌互作
肠道
综述
基础研究
肠道病毒组
Cell子刊:人肠道病毒组的稳定性和无麸质饮食的影响
Cell Reports近期发表的研究聚焦人肠道病毒组,分析了其组成、动态变化、个体差异和稳定性,特别探索了无麸质饮食对肠道病毒组的影响,并对研究方法进行了探讨。
肠道病毒组
饮食干预
后生元
Nature Reviews:后生元的定义和范围(ISAPP共识声明)
后生元(postbiotics)这一术语在科学文献和商业产品中越来越多地出现,但目前仍缺乏明确统一的定义。2019年,国际益生菌和益生元科学协会(ISAPP)召集了专家小组,对后生元的定义和范围进行了审议,并以共识声明的形式于近期在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上发表,为相关领域的科研、临床、产业和监管从业人员以及消费者,提供了一个“官方”的后生元概念,推荐专业人士仔细阅读。
后生元
crAss-like phages
人体肠道中ΦcrAss002噬菌体的分离和特征分析
肠道crass样噬菌体有4个亚科。迄今为止,在纯培养中分离到的具有代表性的噬菌体只有3种:ΦcrAss001和两种密切相关的噬菌体DAC15和DAC17。Microbiome近期发表的文章,首次从人类肠道中分离出ΦcrAss002,该噬菌体可以跟肠道木聚糖溶菌拟杆菌高水平共存。肠道噬菌体的研究有助于了解噬菌体在细菌-肠道稳态中的作用。
crAss-like phages
发酵食品
Nature Reviews:正式定义“发酵食品”,ISAPP发布重磅共识
发酵食品有着悠久的历史,伴随着近年对肠道菌群的研究开展,人们对发酵食品的关注也逐渐增加。国际益生菌和益生元科学协会(ISAPP)于2019年召开专家会议,明确了发酵食品的准确定义和类型以及与益生菌的区别,探讨了其安全性、风险和健康益处(包括其营养属性和潜在的改善健康的机制),并回顾了发酵食品的监管和在膳食指南中的现状。这些内容形成的共识声明文章已于近期发表在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上,内容非常丰富,推荐专业人士仔细参考。
发酵食品
共识声明
未来食品
全球食品供应链:如何革新?(综述)
该文章由Annual Review of Food Science and Technology编辑委员会主刀撰写。针对COVID-19疫情暴露的全球食品供应相关问题,比如供应链的弹性和稳固、食物的持续性生产与供应、食物与健康、食品安全等,文章分别给出了相应的革新和技术改革方案。其技术革新方案涉及农业生产、生物技术、生命科学、大数据、人工智能等各方面,值得相关人士阅读参考。
未来食品
食品生产
环境影响
纳米技术
基因编辑
益生菌定植
翟齐啸、陈卫等:益生菌定植的模式、机制与预测(综述)
乳酸杆菌和双歧杆菌是迄今为止研究最多、应用最广的益生菌。近期,江南大学食品学院Yue Xiao、翟齐啸、张灏、陈卫和爱尔兰科克大学Colin Hill合作,在Annual Review of Food Science and Technology发表综述,通过对乳酸杆菌和双歧杆菌肠道定植模式、机理及相应的调节手段的总结分析,提供了一个在菌株层面对于肠道生物地理的追踪和了解的范例。文章也提出了采用算法模型和机器学习对益生菌定植进行预测。值得一提的是,对于益生菌发挥作用,菌株是否必须定植,持留多久仍是个见仁见智的议题。
益生菌定植
机理与模型
综述
粪便病毒移植
自体粪便病毒移植帮助抗生素后的菌群恢复
BMC Biology上发表的一项最新研究,发现移植抗生素处理前的自体粪便病毒(通过离心及过滤去除细菌及真菌等),可使抗生素处理后的小鼠粪便细菌组成更好地恢复至抗生素处理前。该研究结果提示,粪便病毒移植或可用于恢复抗生素相关菌群失调,从而抑制抗生素使用造成的感染。
粪便病毒移植
研究论文
基础研究
啮齿动物(小鼠)
抗生素
益生菌
每日摄入活菌对健康有益吗?(观点)
针对特定细菌的RCT、摄入发酵食品的相关性研究等证据表明,日常摄入安全的活菌可能对健康有益。近期The Journal of Nutrition杂志上发表了一篇评论文章,详细讨论了应该通过哪些方式,验证“摄入活菌对健康有益”的假说。
益生菌
其他
益生菌
食品和补充剂中的“益生菌”需满足4个条件(综述)
尽管益生菌有着明确的定义(一种活的微生物,当给予足量时,对宿主健康有益),但在食品和补充剂中,益生菌一词常被误用和滥用。Frontiers in Microbiology近期发表的综述,根据2001年世界卫生组织和联合国粮农组织提出的益生菌定义,对益生菌所需满足的“资质”提出了4个原则,以期减少对“益生菌”一词的滥用。
益生菌
probiotic definition
criterion
live microbes
Lactobacillus
人肠道宏基因组
印度中部人群的肠道细菌和病毒组成和功能
Gut Microbes上发表的一项研究,分析了印度中部城市和农村人群的肠道细菌和病毒的组成、功能和耐药组,以及地理、腹泻等因素对菌群的影响。
人肠道宏基因组
gut microbiome
antibiotic resistome
Virome
diarrhea
可移动遗传元件
怎样分析微生物组的可移动基因组(综述)
可移动遗传元件(MGE)主要包括质粒、转座因子和噬菌体等,可影响由选择压力驱动的微生物群落组成及其与宿主的关系,参与耐药基因和毒力因子的传播。MGE在微生物组研究中正在受到越来越多的关注。《Trends in Microbiology》近期发表的综述文章,重点阐述了不同宏基因组学方法在MGE研究中的优势和局限性,探讨了其中的测序和生信分析方法的应用,值得专业人士参考。
可移动遗传元件
宏基因组学
生物信息学
益生菌框架
Nature Reviews:益生菌名词解释和框架(ISAPP共识声明)
随着微生物组研究的飞速发展,益生菌领域在科研和市场都取得了长足进步。国际益生菌和益生元科学协会(ISAPP)在Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology发表关于益生菌一词的范围和合理使用的共识声明。旨在促进该领域的持续发展、研究进步,并确保科学、合理地向消费者和患者传达益生菌的效用。
益生菌框架
核心益处
其他
衰老
Nature:饮食和健康状况,影响老年人的肠道菌群
这是Nature在2012年发表的衰老(老年人)肠道菌群研究,我们今天特别重温。
衰老