Hi-C测序

搜索
登录

Hi-C测序

文章数：1篇

Nature子刊：助力从Hi-C数据中识别高质量病毒基因组新工具—ViralCC

将高通量染色体构象捕获（Hi-C）技术引入宏基因组学，可以从微生物群落中重建高质量的宏基因组组装基因组（MAGs）。尽管最近利用Hi-C测序恢复了多种真核生物、细菌和古细菌基因组，但很少有基于Hi-C数据的工具被设计用于检索病毒基因组。近日，美国南加州大学研究人员在Nature Communications发表最细研究，开发了一种新的基于宏基因组Hi-C数据的开源分箱工具ViralCC（https://github.com/dyxstat/ViralCC），用于恢复高质量病毒基因组及检测病毒-宿主对，并在多种真实和模拟数据中应用，发现其分箱性能较好，值得进一步测试。

病毒组 ViralCC 研究论文基础研究 Hi-C测序