空间代谢组学

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空间代谢组学

文章数：2篇

研究方法与技术

Nature Reviews：原位研究宿主-共生菌相互作用的新技术（评述）

对宿主-微生物相互作用的充分理解有助于对有益和有害相互作用的区分，以及它们对进化和致病机制的理解。但多数共生微生物具有不可体外培养的特性，因此迫切需要使用新的技术来研究宿主和微生物的原位相互作用。发表在《Nature Reviews Microbiology》上的一项“聚焦”文章评述了空间代谢组学和光学显微镜在宿主-微生物相互作用的生物地理学成像方面的最新进展，介绍了大气压基质辅助激光解析电离质谱成像（AP-MALDI-MSI）、荧光原位杂交（FISH）技术和3D光片荧光显微镜（3D-LSFM）技术在宿主-微生物原位相互作用中的成功应用，并指出三种技术的优势结合可为检测微生物感染和生长状态、区分宿主和微生物代谢及相互作用提供更有效途径。

研究方法与技术微生物-宿主互作荧光原位杂交内共生空间代谢组学

空间代谢组学

Nature子刊：微米尺度下的宿主-微生物原位互作空间代谢组学

为共同维护代谢物交换的空间秩序，宿主和微生物会生产相应的代谢物，如细胞膜、抗菌物质或识别分子，因而，视化代谢物的分布对了解微生物与外界生物间的作用十分重要。很多代谢组学的检测技术只关注了代谢物种类和量而忽略了代谢物的空间分布。本文结合使用大气压基质辅助激光解吸电离质谱成像（AP-MALDI-MSI）和荧光原位杂交显微术（FISH），建立空间代谢物成像法（metaFISH），在3微米像素点的水平上分析单个真核细胞和细菌群落的空间代谢组。作者将metaFISH技术用于一种无法人工培养的深海贻贝及其共生菌，证明metaFISH可清晰区分不同代谢物的空间分布。该技术可用于宿主-病原体反应，同时视化病原菌表型和宿主的代谢免疫反应，帮助解开微生物的化学密码。

空间代谢组学宿主-微生物互作 Marco Fabbrini Riccardo Masetti