Amy D Willis

搜索
登录

Amy D Willis

文章数：3篇

口腔中不同株系的TM7的生态位分配

Genome Biology近期发表研究，得到了790个口腔微生物的宏基因组组装基因组，并通过泛基因组和系统发育基因组学方法，重点分析了43个口腔TM7菌株，发现不同的株系呈现鲜明的口腔位点特异性。

口腔菌群生态位

微生物组的转化之路（观点）

目前微生物领域的研究报道很多，但多终于模糊的关联性结果分析，无法进行下一步的实验验证和临床转化研究。本文提出，我们在进行关联性分析的时候需明确结果，鼓励写明具体菌株、菌种和代谢途径，而非像α多样性或基于多种菌群类别的相关多样性，因为后者无法进行下一步的验证实验（随机对照实验）。本文值得每一位想推动微生物组疗法的相关人士阅读。

微生物组转化应用 Microbiome Reproducibility translational science

寻找与CRC、IBD相关肠道菌群基因的新方法

分析共丰度基因群（ CAG）有助于简化从基因层面研究菌群的方法。近期《Microbiome》发表一种新的数据处理方法，将CAG作为基础单位进行基因水平的菌群分析，并用该方法验证了一系列结直肠癌、炎症性肠病人群研究中与疾病相关的CAG。该数据计算方法有助于在基因层面揭示肠道菌群与人体健康的关系。

丰度基因肠道菌群标志物方法学结直肠癌炎症性肠病(IBD)