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文章数：2篇

用于微生物群落宏转录组学研究的新工具—MetaPro

宏转录组学已经成为解析微生物组数据的一种强大组学技术，但目前仍缺乏高性能的工具处理和滤掉低质量和潜在的污染物、对分类学和功能标签进行注释，整理并生成细菌基因表达谱。近日，加拿大多伦多大学研究人员及团队在MetaPro发表最新研究，开发了一种用于宏转录组学数据处理和分析的工具MetaPro（https://github.com/ParkinsonLab/MetaPro），该工具通过处理原始序列可快速实现分类、酶注释，并通过Cytoscape工具快速完成可视化，灵活度高、可扩展和可重复性强，值得关注。

MetaPro 宏转录组学研究论文基础研究生信工具

宏基因组学

使用PathoFact鉴定宏基因组中毒力因子和耐药基因

PathoFact是一个能够高度准确地（分别为0.921、0.832和0.979）和特异性（0.957、0.989和0.994）对毒力因子、细菌毒素和耐药基因进行预测的工具。该工具结合了这些致病因子的预测和可移动遗传元件的识别。通过考虑相关基因的基因组背景，这为分析提供了进一步的深度。此外，PathoFact的毒力因子，毒素和抗菌素耐药基因模块可以独立应用，从而使其成为一个灵活而通用的工具。在预测毒力因子和毒素基因方面，PathoFact优于所有现有的工作流程。在预测抗菌素耐药性方面，它的性能可与一套流程相媲美，而优于其他。PathoFact及其模型和数据库可在https://pathofact.lcsb.uni.lu上免费获得。

宏基因组学毒力因子耐药基因可移动遗传元件模块化