单细胞水平

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单细胞水平

文章数：2篇

菌群分析方法

拉曼结合原位杂交实现单细胞水平菌群代谢分析

这是发表在PNAS上的一份工作，作者结合受激拉曼散射的优势进行单细胞稳定同位素探测以及双光子FISH，以高通量方式识别细胞，同时实现对胞内直径约为1µm的低浓度代谢物检测。该技术相较传统自发拉曼技术，具备通量高、成像速度快的优势。在原位跟踪人体肠道微生物的黏膜糖觅食相关行为时，作者发现黏膜糖代谢通常由拟杆菌门主导，但在岩藻糖代谢方面梭菌表现优于拟杆菌门。

菌群分析方法菌群代谢功能肠道菌群拉曼光谱单细胞水平

Cell：绘制人体肠道发育的时空图谱

Cell近期发表的文章，利用单细胞RNA测序和空间转录组，绘制人体肠道形态发生的时间和空间的转录图谱，描述了隐窝绒毛轴形成的原则以及神经、血管、间充质的形态发生，发育中肠道的免疫细胞群。并且构建了一个公开的在线资源——胎儿肠道发育时空分析（STAR-FINDer），为进一步的研究工作提供便利。

肠道发育时空单细胞水平