首页
热心肠日报
文献库
产业库
榜单
关于日报
《肠·道》演讲
往期精彩
《肠·道》2024
《肠·道》2023
《肠·道》2022
《肠·道》2021
《肠·道》2020
《肠·道》2019
《肠·道》2018
《肠·道》2017
关于《肠·道》
肠道大会
热心肠大会
热心肠智库
智库专家
专家动态
智库新闻
关于智库
奖学金
年度人物奖
更多
HOPE
会议信息
科学与艺术
学术专刊
R·AI
周刊
热心肠先生
研究院动态
关于我们
搜索
登录
关闭
手机邮箱登录
扫码登录
微信扫描二维码快捷登录
验证成功,将在
3
秒钟后跳转
已超时,请
重试
关闭
二维码登录
手机登录
邮箱登录
+86
+1
+852
+886
+81
+65
+61
+44
获取验证码
登录 / 注册
关闭
二维码登录
手机登录
邮箱登录
获取验证码
登录 / 注册
微生物组与表型
文章数:2篇
宏基因组数据库
中山大学:人类肠道宏基因组数据库gutMEGA
为了方便科学家查询和检索已发布的肠道菌群宏基因组测序数据,在这项研究中,中山大学第一附属医院的Xiaoxing Li和中山大学附属肿瘤医院的Ze-Xian Liu与团队,开发了肠道宏基因组图谱(gutMEGA),这是一个注释齐全的综合数据库,用于管理和托管来自人类已发表的肠道菌群定量数据集。通过仔细整理肠道菌群的组成,表型和实验信息,gutMEGA最终在776个条件下整合了7种不同水平(界,门,纲,目,科,属和种)的6457类群的59132个定量信息。此外,通过各种浏览和搜索功能,gutMEGA为用户提供了一种快速简便的方法来获取表型之间肠道微生物的相对丰度。总体而言,gutMEGA是用于肠道宏基因组研究的便捷而全面的资源,可以从 http://gutmega.omicsbio.info 免费访问。
宏基因组数据库
Gut microbiota
human health
metagenomics
database
微生物组分析工具
新算法改进稀疏型微生物组数据与表型的关联分析
探索微生物组与宿主表型的关联,以及揭示微生物与宿主的互作机制是整个领域关注的重大科学问题。然而由于微生物组数据通常稀疏性较强,现在关联分析工具一般无法得到理想的结果。本文提出了一种新型算法MiHC有效改善微生物组数据与表型的关联结果,该软件采用R语言编写,可访问 https://github.com/hk1785/MiHC 安装,使用方便;相信该软件的应用可对本领域有一定推动作用。
微生物组分析工具
Microbiome association studies
microbial ecology
Adaptive association analysis
Higher criticism