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Naama Geva-Zatorsky
文章数:4篇
Nature子刊:实时监测肠道厌氧共生菌的新方法
人类肠道菌群调节生理功能和病理,然而由于缺乏监测专性厌氧细菌种群的合适方法,对微生物与宿主以及微生物与微生物相互作用的机制仍不清晰。源自绿色荧光蛋白的常见基因编码荧光蛋白报告基因需要氧化步骤才能发射荧光,因此不适合用于肠道内的厌氧微生物,荧光原位杂交是自然生态位中细菌群落可视化的有用替代方法,然而需要组织固定。近日,发表在Nature Protocols上的这篇文章,开发了一种实时检测和监测肠道厌氧共生菌活体群落的方法。
肠道共生菌
肠道共生菌长双歧杆菌的细胞外囊泡诱导免疫调节和抗炎作用
肠道微生物群会影响宿主的免疫系统,细菌与宿主细胞互作的一种方式是通过分泌小泡,即含有各种货物的小膜结构。NPJ Biofilms and Microbiomes近期发表的文章,对测序鉴定出来的新菌株——长双歧杆菌AO44的细胞外囊泡(EVs)进行研究,发现其具有抗炎功能,可调节免疫细胞激活。
肠道共生菌
细胞外囊泡
免疫调节
抗炎
生物钟
人类生物钟类型相关的肠道菌群特征
FASEB Journal发表的研究,评估了不同的生物钟类型(早起型-云雀型,晚睡型-猫头鹰型)是否与不同的肠道微生物组成相关。利用宏基因组测序分析,建立了一个与生物钟类型相关的独特菌群标记,同时还确定了与云雀型生物钟相关的三种代谢途径,并将不同的饮食模式与不同时型联系起来。本研究结果提示,肠道微生物组和生物钟类型之间的存在联系,在未来或可用于指导饮食干预。
生物钟
肠道菌群
I型R-M
脆弱拟杆菌的“套期保值”策略,帮助其逃离宿主防御提高竞争优势
I型R-M是一种普遍存在的可与外源入侵DNA对抗的防御系统,同时微生物也进化出一套抵抗I-R-M的逃逸机制,革兰氏阴性菌有很多特性,比如在其整个基因组中大量反转倒位DNA的功能,然而这些倒位是否能帮助菌群逃逸噬菌体的追捕,及其背后的作用机制仍不清楚。Nucleic Acids Research报道了一项研究,发现了脆弱拟杆菌在单个R-M基因座中四个不同反向重复序列处的可逆DNA倒位,产生了八个不同的特异性基因,所有这些基因均存在于细菌种群的表达基因座中,从而导致种群中广泛的甲基化多样性,不仅能帮助其避开宿主防御,同时增加其种群的菌株多样性,进一步增强其存活优势。
I型R-M
脆弱拟杆菌
基础研究
研究论文
细胞系实验