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Roman Stocker
文章数:4篇
微流控平台
Nature:对“食物”的趋化作用塑造了海洋菌群的微观组织
浮游海洋微生物积极寻找和利用微尺度化学热点的能力已被广泛理论化,以影响海洋-盆地尺度的生物地球化学, 但从未在天然菌群中进行过全面的原位检查。本研究,作者使用一个基于现场的微流控平台来量化海洋细菌和古生菌的行为反应,经过几个月,在多个部署的沿海现场站点,作者观察到对浮游植物衍生的溶解有机物 (DOM) 微尺度热点的显著趋化性。研究结果表明,天然原核微生物组合的游动行为受特定化学引诱剂的控制,这决定了重要的生物地球化学转化过程和构成海洋食物网基础的生态相互作用的建立。
微流控平台
海洋原核生物
溶解有机物
生物地球化学转化
海洋食物网
趋化性
Nature Reviews:细菌趋化性的生态作用(综述)
一般来讲,趋化性被认为是一种觅食策略,通过这种策略,细菌可以加强对营养物质和能量的摄取,然而,我们仍然不明白为什么某些营养较差的化合物会成为强有力的化学吸引物,反之亦然。Nature Reviews Microbiology近期发表的综述文章,强调了细菌密度、空间和时间结构是如何影响细菌为什么以及在何种情况下采取运动的生活方式的。通过系统地绘制细菌的运动时间和地点,将为理解代谢和生长之间丰富的相互作用提供新的见解。
趋化性
拉曼光谱
Nature Reviews:拉曼光谱助力微生物学研究 (综述)
拉曼光谱是一种无损检测技术。本综述重点关注了拉曼光谱用于检测微生物代谢物、微生物与机体、细胞与细胞、细胞与环境之间的分子交换以及不同环境下微生物的多样性等,为相关人士提供参考。
拉曼光谱
综述
拉曼光谱
Nature子刊:助力研究“谁干了啥”的微生物细胞分选平台
本研究开发了一个基于拉曼光谱对来自微生物群落中的感兴趣的单个细胞进行自动分选的平台。这种细胞的分类及其下游DNA分析(例如通过微型宏基因组学或单细胞基因组学或培养)允许在复杂微生物群落中的微生物细胞的代谢作用和基因组之间建立直接联系,并有针对性地分离具有特定生理功能的新型微生物。作者预计,该方法将为特定环境和宿主相关微生物组研究提供多一种通用工具,以阐明微生物类群在其复杂群落中的代谢贡献。
拉曼光谱
自动分选
微流控技术
单细胞基因组学
微型宏基因组学