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Chao Nie
文章数:6篇
衰老
国内团队:肠道菌群-代谢物互作如何影响衰老和肾功能的新见解
人类衰老总是伴随着肾功能的下降,这一过程可能会因肠道微生物产生的尿毒素而加剧。近期北京医院国家卫生健康委北京老年医学研究所的孙亮和杨泽、深圳华大生命科学研究院的Karsten Kristiansen和聂超作为共同通讯作者在Aging Cell发表了一项研究成果,基于登记的中国广西家庭长寿队列(n = 151),对22至111岁的个体进行了肠道微生物群和血清代谢组的综合分析,并在两个独立的东亚老龄化队列(日本、云南)中验证。本研究揭示了衰老过程中肠道微生物群和血清代谢组的重要特征,以及肠道微生物群与年龄相关的变化如何与血液中肾功能受损的不同标志物的积累相关。特别是,肾功能受损标志物的积累和肾功能下降可能加速衰老过程,强调了肠道微生物群改变和肾功能受损标志物在健康衰老中的重要性。
衰老
肠道菌群
肾功能
代谢组
皮肤细菌基因组
聂超+郭锐进:揭开人体皮肤微生物组的神秘世界面纱
皮肤表面的各种皮肤环境构成了复杂的生态系统。皮肤微生态系统的特点之一是生物量低,这大大限制了通过测序对微生物物种的全面识别。近期华大生命科学研究院聂超、郭锐进与团队在Advanced Science发表研究,构建了包含813个原核生物物种和5,779个微生物组装基因组的人体皮肤基因组目录,为研究皮肤微生物组及其在皮肤健康中的作用提供了重要的参考数据库。
皮肤细菌基因组
微生物多样性
Metagenomic shotgun sequencing
次级代谢物
单核苷酸变异
多组学
国内团队Cell子刊:基于多组学大数据的模型,可精准评估个体的健康状况
多组学和生物信息学的最新技术进步为开发精确的健康评估提供了机会,这需要大数据和相关的生物信息学方法。深圳华大基因的Nie Chao团队在Cell Reports Medicine发表文章,利用大样本的多组学数据构建了一个可评估个体健康状况的模型——BFM-ash。使用该模型可确定慢性病患者的异常健康区域,并评估饮食干预对健康的影响。
多组学
多组学数据
模型
精准医学
BFM-ash
双向情感障碍
胡少华+宋学勤+聂超等:双相情感障碍中“菌群-肠-脑轴”新机制
双相情感障碍(也称躁郁症;BD)是一种常见的、高自残的精神疾病,伴有睡眠、思维和行为改变。BD为间断性病程,有躁狂发作、轻躁狂发作及抑郁发作方式,因病因复杂,BD的临床诊治面临极大挑战。近年来,多项研究发现脑-肠-微生物轴和BD等精神疾病密切相关,但确切的参与机制不明。近日,浙大一院胡少华、华大基因聂超、郑大一院宋学勤、联合丹麦的团队在Molecular Psychiatry发表研究,发现BD患者肠道菌群失调,血清代谢物水平发生明显变化,Akk菌和柔嫩梭菌等与B族维生素、短链脂肪酸衍生物、犬尿氨酸及GABA等神经活性代谢物显著相关。血清非靶向代谢组学、粪便宏基因组学以及脑部磁共振联合分析,发现BD患者血清代谢物对大脑功能活动的影响大于肠道菌群。总之,该研究为构建以肠道菌群为靶点,实现临床BD的精准诊疗提供了新的线索。
双向情感障碍
多组学分析
研究论文
医学研究
临床对照实验
皮肤菌群
复旦+华大:迄今最大规模的中国汉族人皮肤菌群宏基因组研究
近年来,越来越多的微生物组研究将目光从肠道转向了肠外。其中,皮肤菌群备受关注。此前的研究已表明皮肤菌群对皮肤外观和皮肤健康具有重要作用。但是由于皮肤菌群的生物量较低,已发表的大多研究均采用了16S rRNA测序法。近期,复旦大学生命科学学院王久存团队与深圳华大生命科学研究院发表于Microbiome的这篇文章,采用宏基因组测序法检测了超过800个来自健康中国汉族人群面部皮肤菌群样本,分析了皮肤菌群的组成和功能特点,并提出了两种不同的皮肤亚型,加深了我们对皮肤菌群的理解。这些结果将有助于我们后续进一步探究皮肤菌群与皮肤疾病之间的关系。
皮肤菌群
复旦+华大:迄今最大规模的中国汉族人皮肤菌群宏基因组研究
近年来,越来越多的微生物组研究将目光从肠道转向了肠外。其中,皮肤菌群备受关注。此前的研究已表明皮肤菌群对皮肤外观和皮肤健康具有重要作用。但是由于皮肤菌群的生物量较低,已发表的大多研究均采用了16S rRNA测序法。近期,复旦大学生命科学学院王久存团队与深圳华大生命科学研究院发表于Microbiome的这篇文章,采用宏基因组测序法检测了超过800个来自健康中国汉族人群面部皮肤菌群样本,分析了皮肤菌群的组成和功能特点,并提出了两种不同的皮肤亚型,加深了我们对皮肤菌群的理解。这些结果将有助于我们后续进一步探究皮肤菌群与皮肤疾病之间的关系。