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Rasa Elmentaite
文章数:4篇
肠道细胞
Nature:人肠道细胞的时空图谱
肠道是一个由非常多样的细胞组成的复杂器官,其中的不同细胞在人一生中呈现动态变化。为了全面地绘制人肠道细胞谱系,Nature近期发表研究,通过单细胞RNA测序和抗原受体分析,对来自人一生(胎儿、儿童、成年)多个肠道部位的约42.8万个细胞进行分析,涉及肠上皮、肠神经和免疫细胞,揭示了不同肠道细胞类型之间在时间和空间上的复杂互作。该数据集可通过https://gutcellatlas.org进行访问,是研究肠道发育、生理和疾病的重要资源。
肠道细胞
小儿克罗恩病
Cell子刊:单细胞测序揭示儿童克罗恩病的转录特征
Developmental Cell近期发表的文章,分别对受孕后6-10周人类早期胎儿肠道样本、体外组织和体外胎儿类器官、儿童克罗恩病和健康对照的上皮细胞进行单细胞转录组测序,鉴定出循环BEX5+上皮前体细胞,揭示出类器官的成熟过程,以及儿童克罗恩病的上皮细胞中胎儿期转录因子的再激活等,为研究肠道发育和儿童克罗恩病提供了丰富的资源。
小儿克罗恩病
单细胞测序
肠道发育
人肠内分泌细胞
Cell:描绘人肠内分泌细胞的mRNA和分泌蛋白质组的高分辨率图谱
肠内分泌细胞(EEC)可感知肠道内容物并释放激素,调节胃肠道活动、全身代谢和食物的摄入。但EEC总体数量少且没有相关体外模型,对EEC各亚型及其分泌产物的研究具有挑战。近期发表在《Cell》的文章,创建了体外类器官诱导产生肠段特异性EEC和基因编辑标记EEC分泌激素的技术,绘制出人EEC表达图谱和分泌蛋白质组图谱,为深入了解人EEC的发育和功能提供了宝贵资料。
人肠内分泌细胞
mRNA图谱
分泌蛋白质组图谱
enteroendocrine cell
Organoids
菌群-免疫互作
Nature子刊:人结肠菌群与免疫细胞图谱
Nature Immunology上发表的一项最新研究,对6名健康人结肠中的3个不同部位(盲肠、横结肠及乙状结肠)及肠系膜淋巴结中的免疫细胞进行了单细胞RNA测序,并对12名健康人的结肠菌群进行分析,详细描绘并对比了在结肠不同部位中的菌群及免疫细胞(包括B细胞、Th细胞、Treg等)组成,以及菌群与免疫细胞的互作。
菌群-免疫互作
生态位
菌群-免疫互作
单细胞RNA测序
肠系膜淋巴结