Richard M Leggett

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Richard M Leggett

文章数：3篇

纳米孔自适应采样：一种富集宏基因组样本中低丰度物种的方法

对于研究 DNA 分子长度对自适应采样效率和功效的影响，以确定其对宏基因组组装基因组（MAG）和诊断应用的有用性，在本文中，作者提出了一个数学模型，该模型可以在已知的相对丰度和读长长度分布的情况下预测宏基因组群落中可能的富集水平。使用合成落，作者证明模型的预测与观察到的行为密切相关，并量化了采用自适应采样对流动池产量造成的负面影响。

纳米孔自适应采样宏基因组学测序富集

Nature子刊：快速检测临床宏基因组样本和耐药致病菌

MinION测序平台可提供近乎实时的DNA测序分析，具有临床应用前景。Nature Microbiology发表的一项最新研究显示，MinION结合NanoOK RT软件，可在物种水平上快速分析临床宏基因组数据，鉴定肠道相关的潜在致病菌及其抗生素耐药性情况，从而及时为抗菌治疗决策提供关键参考信息。

临床检测抗生素耐药性肠道菌群早产儿 MinION纳米孔测序

宏基因组病原检测

Nature子刊：纳米孔宏基因组测序，6小时快速诊断下呼吸道感染病原体

下呼吸道感染年导致300万人死亡且病原体类型广泛，目前基于培养的诊断需2~3天且敏感性较差。2019年7月Nature Biotechnology以《纳米孔上的临床宏基因组学》（Clinical metagenomics on a nanopore）为封面，刊登了英国东安格利亚大学Justin O'Grady博士及合作者共同发布的首个使用纳米孔技术的快速、经济的宏基因组测序方法，直接从患者呼吸道样本中准确快速地识别细菌病原体，并在6小时内准确检测抗性基因的突破性研究。

宏基因组病原检测纳米孔测序技术 Tianshu Han Ying Li Changhao Sun