赵立平
美国罗格斯大学应用微生物学冠名讲席教授、上海交通大学微生物学特聘教授
在国内最早系统开展微生物分子生态学研究,在复杂微生物群落结构分析技术和统计计算方法等方面做了很多创新性工作。对人和动物的肠道、处理工业废水的生化池、土壤、油藏等环境中的微生物群落结构与功能的关系做了大量的研究工作,取得了有意义的结果。在美国科学院院报(PNAS), 国际微生物生态学会会刊(ISME Journal)、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology, EBioMedicine等刊物发表论文四十余篇,2012年6月,美国《科学》周刊曾对他的研究工作做过专题报道(Science 336: 1248)。
赵立平团队等:过度生长的产内毒素肠菌,可诱导脂肪肝
① 从肥胖脂肪肝患者中分离出阴沟肠杆菌B29等3株在肠道内过度生长的产内毒素致病共生菌;② 用这些菌对高脂喂养的无菌小鼠进行单菌株定植,可诱发非酒精性脂肪性肝病(NAFLD),而定植内毒素活性明显较低的共生菌多形拟杆菌则不会引起NAFLD;③ 敲除细菌内毒素合成通路中的waaG基因,以及敲除小鼠TLR4,均导致阴沟肠杆菌B29无法引发炎症和NAFLD,提示LPS-TLR4互作是NAFLD最上游和重要的分子事件。
02-04
上海交大张晨虹团队:节食时间影响小鼠肠道菌群和代谢表型
① 不论白天或夜间(活动期)进食,节食都能改善小鼠代谢,但与夜间进食(CRD)相比,白天进食(CRL)的小鼠表现出肌肉减少等代谢表型差异,及菌群结构和组成的差异;② 恢复自由取食后,CRL小鼠出现大量进食行为,而CRD小鼠更能保持节食对脂肪积累、糖代谢、肠屏障和炎症指标的改善效果;③ 进食时间影响肠道菌群,被节食富集的乳杆菌属OTU在CRD小鼠里丰度更高;④ 恢复自由取食后,CRD小鼠菌群变得接近未节食的小鼠,而CRL小鼠菌群仍有差异。
2019-12-03
赵立平:微生物组大数据分析中的生态学原理分析
① 菌群研究应当纳入生态学研究原理,重视物种间互作;② 属于同一种的微生物基因差异性大,核心基因数量远少于菌株特异性基因,菌群研究应当重视菌株水平差异;③ 肠道菌群是反映健康状态的窗口,即是受宿主状态影响,也会影响宿主健康;④ 来自大规模人群研究的微生态组学数据,更有利于研究菌群-宿主健康互作关系;⑤ 应当考虑用微生物功能群来进行微生态分析,而不是单纯依赖现有的细菌分类学数据来进行菌群聚类。
2019-05-04
张晨虹+袁慧娟等:限制饮食或可缓解化疗药物副作用
① 相比于自由采食的对照组,热量受限(CR)小鼠的饮食摄入减少30%,由化疗药物环磷酰胺(CTX)引起的粘膜炎症状减少,包括肠屏障通透性降低、细菌易位减少、表皮干细胞增加和表皮损伤减小;② CTX会显著改变对照组小鼠的肠道菌群,但对CR小鼠的肠道菌群无显著影响;③ CR小鼠肠道中乳杆菌属和毛螺菌科较多,这两个细菌类群可缓解炎症、改善肠屏障功能;④ 限制膳食热量摄入可使小鼠肠道菌群更健康,可能有助于缓解化疗药物的副作用。
2019-03-12
赵立平团队:绿茶多酚改善糖尿病小鼠血糖
① 雌性糖尿病小鼠模型补充绿茶多酚——多酚E(PPE)7周,空腹血糖和肠系膜脂肪降低,血清胰岛素升高,PPE可能抑制了β细胞的损伤;② 茶黄素(TF)的降糖降脂效果低下或无效;③ PPE和TF显著改变盲肠和结肠的菌群结构,对回肠无影响;④ 响应干预的关键细菌可聚类成11个共丰度集(CAG),PPE(而非TF)显著增加CAG 6和CAG 7,后两者与血糖水平负相关,这些CAG中的OTU来自厚壁菌门和拟杆菌门;⑤ PPE和TF可引起CAG 10降低,后者与血糖水平正相关。
2019-01-22
赵立平等:如何解析肠道菌群在饮食与健康中的作用
① 临床试验和限菌动物研究表明,肠道菌群至少一定程度上影响健康;② 确定关键菌株是菌群因果性研究中的重要环节:首先鉴定出作为功能群的共现菌株,然后分离功能群成员,用动物模型确定特定菌株对宿主的影响;③ 解析关键菌株与宿主互作的生化机制,需组合应用体外培养、动物模型和临床试验;④ 饮食为肠道菌群施加选择压力,导致的优势功能群可改变肠道环境,进而影响菌群其它成员;⑤ 通过饮食影响菌群的“菌群营养学”,将是新型疗法的核心。
2018-08-01
上海交大张晨虹:肥胖肠道菌群引发小鼠脂肪肝
① 两组无菌小鼠分别移植遗传性肥胖儿童在饮食减肥前(PreM)/后(PostM)的肠道菌群;② 正常饮食下,两组小鼠的菌群组成和短链脂肪酸水平显著不同,分别与供体情况相似;③ PreM小鼠内毒素和系统性炎症增加,伴随肝脏脂质积累和脂肪肝,而PostM组无明显变化;④ 转录水平上,PreM小鼠在脂肪肝发生前,肝脏脂质β氧化已被明显抑制,同时激活脂质吸收和胆固醇摄取通路;⑤ PreM菌群可能通过抑制PPARα来抑制脂质分解相关基因,进而引起脂肪变性。
2018-07-20
注:FA表示第一作者;CA表示通讯作者;SA表示高级作者
2020
2019
2018
CAMicrobiome: from community metabolism to host diseases
Sci China Life Sci, 10.1007/s11427-018-9335-8
2017
一种中生菌素母药清洁生产方法 CN106865804A 2017.06.20
富勒烯作为调节微生物生长或代谢的调节剂的用途 CN103789251A 2014.05.14
平衡肠道菌群结构改善代谢综合症的全营养组合物及应用 CN102987383A 2013.03.27
悉生动物肥胖模型的构建方法及其应用 CN102792919A 2012.11.28
改善肠道菌群结构的方法及应用 CN102743420A 2012.10.24
美国罗格斯大学应用微生物学冠名讲席教授
上海交通大学微生物学特聘教授
在国内最早系统开展微生物分子生态学研究,在复杂微生物群落结构分析技术和统计计算方法等方面做了很多创新性工作。对人和动物的肠道、处理工业废水的生化池、土壤、油藏等环境中的微生物群落结构与功能的关系做了大量的研究工作,取得了有意义的结果。在美国科学院院报(PNAS), 国际微生物生态学会会刊(ISME Journal)、Nature Communications、Nature Reviews Microbiology, EBioMedicine等刊物发表论文四十余篇,2012年6月,美国《科学》周刊曾对他的研究工作做过专题报道(Science 336: 1248)。
1979-1983,山西农业大学植物保护专业,学士
1983-1989,南京农业大学分子植物病理学专业,博士
1989-1993,山西省农业科学院生物技术研究所副所长
1993-1995,康奈尔大学植物病理学系访问学者
1995-1997,山西大学生物技术研究所副教授
1997-2001,山西大学生物技术研究所教授,主任
2000.4-2000.7,南卡罗莱纳大学土木工程系客座教授
2001-2017,上海交通大学生命科学与生物技术学院微生物学教授
2005-2009,上海系统生物医学研究中心常务副主任
2012.9-2013.4,美国犹他州普罗沃杨百翰大学客座教授
开发分子和基因组工具,用于理解和预测操纵人类和动物肠道中复杂的微生物群落
了解饮食与肠道微生物群之间在慢性疾病如肥胖和糖尿病的发病和进展之间的相互作用
制定中药饮食与现代饮食相结合的干预措施,调节肠道微生物群落与人类的关系,实现预防保健
美国微生物科学院院士(2014年)
Journal of Molecular Medicine,FEMS Microbiology Ecology,Microbial Biotechnology等国际刊物编委;ISME Journal(国际微生物生态学会会刊,影响因子9.3)的资深编辑,Scientific Report编委。