陈义华
中国科学院微生物研究所研究员、中国微生物学会常务理事
陈义华,中国科学院微生物研究所研究员,博士生导师,微生物资源前期开发国家重点实验室常务副主任,中国科学院大学岗位教授。中国微生物学会常务理事、编辑出版工作委员会主任委员、中国遗传学会微生物遗传专业委员会委员。现担任微生物学报副主编,及微生物学通报、mLife等学术刊物的编委。
陈义华+唐啸宇等:人类相关细菌为适应环境会采用不寻常途径合成3-乙酰化的四聚物
① 利用天然感受态的大片段克隆技术对含muc生物合成基因簇(BGC)的变形链球菌UA140异源表达,成功获得高产菌株;② 对关键基因mucD和mucE构建突变株,发现MucD负责产生MUC合成的中间产物M-283;③ 具有mucF基因的BGC通过合成muc可减轻免疫攻击,许多细菌缺乏BGC,但具有将RTC“解毒”为muc的功能性MucF同源物;④ 在63株含muc BGC基因mucA-E的菌株中,超90%分离自人体或与人类密切相关的环境;⑤ TAS1是一类与MUC生物合成机制不同的3-乙酰化TAC。
2023-05-05
王军+陈义华NBT突破:用人工智能大规模挖掘人肠道菌群中的抗菌肽
① 结合3种自然语言处理神经网络模型(LSTM、Attention和BERT),建立一个从序列数据中挖掘抗微生物肽(AMP)的流程,准确率>90%;② 将该方法用于人肠道宏基因组数据,结合宏蛋白质组数据过滤,以及与肠菌的相关性网络分析,鉴定出241个候选AMP;③ 通过化学合成得到216个新型肽,证实其中181个(83.8%)有抗菌作用,这些AMP与已知AMP同源性低;④ 进一步筛选出其中的强效AMP,能通过不同机制有效抑制多重耐药革兰氏阴性致病菌,并在细菌性肺感染小鼠模型中验证了3种AMP的有效性。
2022-03-03
中国科学院微生物研究所研究员
中国微生物学会常务理事
陈义华,中国科学院微生物研究所研究员,博士生导师,微生物资源前期开发国家重点实验室常务副主任,中国科学院大学岗位教授。中国微生物学会常务理事、编辑出版工作委员会主任委员、中国遗传学会微生物遗传专业委员会委员。现担任微生物学报副主编,及微生物学通报、mLife等学术刊物的编委。
2001年9月~2005年7月:中国科学院微生物研究所,博士
1998年9月~2001年6月:南京农业大学,硕士
1994年9月~1998年6月:南京农业大学,学士
2011年4月~至今:中国科学院微生物研究所,研究员
2006年7月~2011年4月:美国威斯康星大学—麦迪逊分校,研究助理
主要从事微生物天然产物药物生物合成机理和人体微生物活性代谢产物的研究,并在此基础上通过基因组挖掘和合成生物学等手段解析与重构新颖的代谢机制,研发新结构的小分子药物。