徐健
中国科学院青岛生物能源与过程所单细胞中心主任、山东省能源生物遗传资源重点实验室主任
2008年入选中科院“百人计划”并全 职加入中科院青岛生物能源与过程所。自2008年来主持国家自然科学基金委科学仪器基础研究专项、重大研究计划重点支持项目、重大国际合作、科技部创新方法工作专项、973课题、中科院重大科研装备研制等项目。论文发表于Science、Plant Cell、PLoS Biology、PLoS Genetics、PNAS、Biotechnology Advances、ISME J、Plant J、Analytical Chemistry、Biotechnology for Biofuels、Bioinformatics等50余篇,专利或专利申请19项。基于“单细胞拉曼分选仪”、“单细胞遗传分析仪”等创新科研仪器体系,其主持的单细胞和元基因组特色技术平台正支撑着产学研合作团队在能源、环境、海洋、健康、农业、地质等领域的微生物群落研究。
徐健、苏晓泉等:用大数据引擎绘制全球菌群转化网络
青岛大学苏晓泉与中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心徐健与团队在mSystems发表研究,提出了一种基于大数据搜索的理论模型,从多个尺度探索不同生态系统之间微生物组的内在关联与演化规律。基于该模型,他们运用前期开发的菌群搜索引擎 MSE和超过17万例样本,计算和绘制了首个全球性的“菌群相互转化网络”,从而刻画出不同生态系统中菌群最可能的演化途径,对于重构历史上曾经存在过的菌群,或设计全新的
07-21
重磅:《肠道产业》2020-2021年度榜单
2021中国肠道大会上,热心肠研究院正式公布了《肠道产业》2021-2021年年度榜单。
07-08
徐健+黄适:菌群和多组学分析揭示何为“牙龈亚健康”
中科院青岛能源所徐健、黄适与研究团队,近期在mBio发表研究,通过对志愿者牙龈健康恶化过程中的牙菌斑菌群、牙菌斑代谢组和唾液细胞因子进行综合分析,首次提出“牙龈亚健康”这一概念,并揭示了牙菌斑菌群在其中的驱动作用和机制,强调了日常口腔清洁以及牙龈亚健康阶段干预的重要性。
03-19
苏晓泉+徐健:在整个菌群水平上对全球菌群进行物种分类和功能搜索的平台
青岛大学苏晓泉和中科院青岛能源所徐健研究团队,近期在mSystems发表文章,介绍了微生物组搜索引擎2 (Microbiome Search Engine 2, MSE 2),这是一个微生物组数据库平台,基于菌群与数据库中菌群的分类或功能相似性,在全球宏基因组数据中搜索和查询菌群。
01-22
徐健团队:牙菌斑菌群,或可帮助理解牙龈炎发生和治疗
① 菌斑性牙龈炎可以通过多种治疗方式得到缓解;② 本研究基于对三种抗牙龈炎的治疗方式进行随机对照实验;③ 考察对牙菌斑中菌群的影响;④ 发现在牙龈炎缓解过程中,不同治疗方式导致菌群指标的变化情况不同;⑤ 这说明菌群指标可能可以帮助理解和比较不同治疗方式的作用机制。
2016-04-20
张和平团队:肠道菌群为预测痛风提供可靠参考
现行痛风临床诊断标准灵敏度低且滞后。①痛风患者与健康人肠道菌群构成差异显著,且缺乏F.prausnitzii并富含B.caccae和B.xylanisolvens。②编码黄嘌呤脱氢酶基因在痛风患者肠道内显著富集,而尿囊素酶却大幅减少。③痛风微生物指数模型诊断准确率高达88.9%。
2016-02-08
Cell子刊:利用口腔微生物来预测龋齿
这是中科院青岛生物能源与过程研究所徐健和团队做的重磅工作:① 对50个四岁儿童的口腔微生物进行了2年的跟踪;② 依年龄的微生物发育会受到幼儿龋齿发生的干扰;③ 微生物的变化早于幼儿龋齿临床症状的发生;④ 除去年龄因素,特异性微生物,可以预测龋齿的发生。
2015-09-09
注:FA表示第一作者;CA表示通讯作者;SA表示高级作者
专利名称:快速筛选嗜热厌氧产乙醇微生物高产乙醇菌株的方法,申请号:CN201010149123.3,状态:(授权)
专利名称:一种生产纤维素乙醇的方法,申请号:CN201010149120.X,状态:(授权)
专利名称:一种超声波介导的微生物遗传转化方法及其应用,申请号:CN201010186403.1,状态:(授权)
专利名称:一种向微拟球藻叶绿体中导入外源DNA的方法及相关的叶绿体基因组序列,申请号:CN201210494514.8,状态:(授权)
专利名称:单细胞表现型数据库系统和搜索引擎,申请号: CN201310105207.0,状态:(授权)
专利名称:一种基于自供能真空微泵的便携式微液滴发生器,申请号:CN201310382774.0,状态:(授权)
专利名称:一种快速区分环境中刺激(污染)物质的方法,申请号:CN201310456140.5,状态:(审中-实审)
专利名称:一种捕获采集细胞/颗粒拉曼光谱的微流控芯片及方法,申请号:CN201310613921.0,状态:(授权)
专利名称:一种快速检测微藻产能过程的方法,申请号:CN201310595881.1,状态:(授权)
中国科学院青岛生物能源与过程所单细胞中心主任
山东省能源生物遗传资源重点实验室主任
2008年入选中科院“百人计划”并全 职加入中科院青岛生物能源与过程所。自2008年来主持国家自然科学基金委科学仪器基础研究专项、重大研究计划重点支持项目、重大国际合作、科技部创新方法工作专项、973课题、中科院重大科研装备研制等项目。论文发表于Science、Plant Cell、PLoS Biology、PLoS Genetics、PNAS、Biotechnology Advances、ISME J、Plant J、Analytical Chemistry、Biotechnology for Biofuels、Bioinformatics等50余篇,专利或专利申请19项。基于“单细胞拉曼分选仪”、“单细胞遗传分析仪”等创新科研仪器体系,其主持的单细胞和元基因组特色技术平台正支撑着产学研合作团队在能源、环境、海洋、健康、农业、地质等领域的微生物群落研究。
1993-1997,北京大学,获学士学位
2000-2003,华盛顿大学,获博士学位
2004 -2008,华盛顿大学,团队负责人
2008 –今,中科院青岛生物能源与过程所,研究员
单细胞水平的功能基因组学
系统生物学和合成生物学
围绕微生物高效整合生物加工(CBP)的原理和机制
Algal Research、Applied and Environmental Microbiology等编委
中国微生物学会国际合作委员会委员
首届中组部万人计划青年拔尖人才计划(2012)
科技部中青年科技创新领军人才推进计划(2013)
基金委杰出青年基金(2014)