谭宇翔 | 热心肠智库

谭宇翔

中国科学院深圳先进技术研究院助理研究员

介绍成果

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注：FA表示第一作者；CA表示通讯作者；SA表示高级作者

2022

FAStrainPanDA: Linked reconstruction of strain composition and gene content profiles via pangenome-based decomposition of metagenomic data

iMeta, 10.1002/imt2.41

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2021

Establishment and resilience of transplanted gut microbiota in aged mice

iScience, 10.1016/j.isci.2021.103654

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FADPSN: standardizing the short names of amplicon-sequencing primers to avoid ambiguity

Wei Sheng Wu Xue Bao, 10.13343/j.cnki.wsxb.20200760

Drought stress and plant ecotype drive microbiome recruitment in switchgrass rhizosheath

JIPB, 10.1111/jipb.13154

2020

FA[Research progress and applications of strain analysis based on metagenomic data]

Sheng wu gong cheng xue bao, 10.13345/j.cjb.200380

Predominance of positive epistasis among drug resistance-associated mutations in HIV-1 protease

PLoS Genet, 10.1371/journal.pgen.1009009

2019

FAPreventive consumption of green tea modifies the gut microbiota and provides persistent protection from high-fat diet-induced obesity

J Funct Foods, 10.1016/j.jff.2019.103621

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2016

FAImproving drug safety: From adverse drug reaction knowledge discovery to clinical implementation

Methods, 10.1016/j.ymeth.2016.07.023

Diffuse large B-cell lymphoma patient-derived xenograft models capture the molecular and biological heterogeneity of the disease

Blood, 10.1182/blood-2015-09-672352

Targetable genetic features of primary testicular and primary central nervous system lymphomas

Blood, 10.1182/blood-2015-10-673236

发明专利

谭宇翔; 钟竞辉; 杨恒文; 尹芝南。一种用于评估婴幼儿肠道菌群发育年龄的预测方法。（受理） 2019年

谭宇翔；张宇；尹芝南。优化基因组测序结果的分类方法。（受理） 2018年

Tan, Y. Computational Approaches for Transcriptome Cancer Analysis by RNA-Seq. LAP LAMBERT Academic 2016年

头衔

中国科学院深圳先进技术研究院助理研究员

教育经历

2010年8月~2016年1月：波士顿大学医学院，哲学博士

2008年8月~2010年7月：伊利诺州理工大学，理学硕士

2004年9月~2008年6月：中山大学，理学学士

工作经历

2019年6月~现今：中国科学院深圳先进技术研究院，助理研究员

2016年6月~2019年5月：暨南大学，博士后

主要研究领域与方向

生物信息学：深耕算法和数据库开发12年，自主研发算法4个，数据模拟体系2个，数据库4个；建立微生物组和转录组两大组学数据分析平台；5年服务器管理和3年生信团队管理经验。

肠道微生物组学：多角度分析肠道微生物群落的组成和功能变化对人体健康的影响，并致力于挖掘新型益生菌及靶向致病微生物的药物。已建立可用于衡量菌群失调程度的婴幼儿肠道菌群发育评估模型并申请专利。建立人肠道微生物资源库包含细菌、古菌、病毒等1770株，并进行了细致的单基因组分析。

所获荣誉

深圳市海外高层次人才“孔雀计划”获得者

广东省“珠江人才计划”海外青年引进计划获得者

首届全国大学生基因应用创意大赛优秀导师

2014中国创新创业大赛优秀团队（团队负责人）

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中国科学院过程工程研究所生化工程国家重点实验室副研究员