马迎飞
中国科学院深圳先进技术研究院研究员
2009年毕业于中科院微生物研究所,并于同年进入加利福尼亚大学Scripps海洋研究所进行博士后研究,曾任纽约大学医学院人类微生物基因组课题组成员之一。现任中国科学院深圳先进技术研究院研究员。
中科院先进院:肠道噬菌体与2型糖尿病相关
① 对比2型糖尿病(T2D)和健康个体粪便样本的全群落宏基因组测序(WCMS)数据,用多种生物信息学方法分析其中的噬菌体;② 根据噬菌体种类及细菌宿主定义噬菌体OTU(pOTU),发现复杂的肠道噬菌体组中存在大量未知噬菌体,有丰富的基因多样性;③ T2D患者的肠道噬菌体显著增多,包括7个主要pOTU;④ 肠道中噬菌体与细菌宿主间存在复杂的相互作用,不是简单的“此消彼长”,可能还有其他调控机制;⑤ 肠道噬菌体或可用于疾病的诊断和治疗。
2018-02-01
JAMA子刊:特定口腔细菌或与头颈部鳞状细胞癌低风险相关
① 选取来自2项不同队列研究(CPS-II及PLCO)中的58及71例头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)病例,分析口腔微生物组的组成;② 年龄、性别和种族不影响HNSCC的风险;③ 病例患者大多吸烟,且饮酒量更高,口腔中乳头瘤病毒-16呈阳性;④ 口腔菌群的整体组成与HNSCC并无关系,但高丰度的棒状杆菌属及金氏菌属与HNSCC风险降低相关,这可能来源于上述细菌对致癌物的代谢能力;⑤ 两个队列研究结果一致并且稳定,喉癌的发生与吸烟关系很大。
2018-01-11
中国慢性HIV感染者的粪便菌群多样性
① 收集13名慢性HIV患者和4名非HIV病人的粪便样品,利用16S扩增子测序比较两组肠道菌群组成差异;② 相比于非HIV个体,HIV组粪便菌群alpha多样性降低,PCA分析显示两组个体菌群组成显著分离;③ 分析发现中国慢性HIV感染者的粪便样本中厚壁菌门和变形菌门的丰度相对于健康人显著增加;④ 嗜胆菌属只在未感染者的粪便样本中被检测到,而拟杆菌属和arabacteroides在慢性HIV感染者的粪便中丰度更高。
2016-04-06
中国科学院深圳先进技术研究院研究员
2009年毕业于中科院微生物研究所,并于同年进入加利福尼亚大学Scripps海洋研究所进行博士后研究,曾任纽约大学医学院人类微生物基因组课题组成员之一。现任中国科学院深圳先进技术研究院研究员。
1997.09—2001.07,山东农业大学,获得学士学位
2001.09—2004.07,山东农业大学,获得硕士学位
2005.09—2009.04,中国科学院微生物研究所,获得博士学位
2009.06—2011.04,加州大学圣迭戈分校,博士后
2011.05~2015.09,纽约大学医学院, 研究科学家
2015.09~现在, 中国科学院深圳先进技术研究院研究员
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