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Matthias Scholz
文章数:5篇
低FODMAP饮食
Gastroenterology:低FODMAP饮食缓解IBS患者症状
① 104名肠应激综合征(IBS)患者随机分成4组:假饮食+安慰剂、假饮食+益生菌、低FODMAP+安慰剂、低FODMAP+益生菌;② 4周后,饮食干预与症状缓解及双歧杆菌均无显著关联;③ 与假饮食组相比,低FODMAP饮食组症状缓解比例较高、IBS严重性平均得分降低、粪便双歧杆菌属丰度降低,粪便菌群多样性无变化;④ 与安慰剂组相比,益生菌组IBS严重性平均得分无变化、粪便双歧杆菌属丰度升高;⑤ 低FODMAP饮食可适当缓解症状,联用益生菌有助双歧杆菌重建。
低FODMAP饮食
益生菌
双歧杆菌属
肠易激综合征
food sensitivity
尿路致病性大肠杆菌
Cell Reports:菌株水平研究的新方法
新方法,又可以在宏基因组数据中分析出新结果。
尿路致病性大肠杆菌
坏死性小肠结肠炎
早产婴儿
宏基因组测序
菌株水平
宏基因组
Nature子刊重磅:从宏基因组信息鉴别菌株信息!
① 本文介绍了一种利用宏基因组数据完成菌株鉴别的工具——PanPhlAn;② PanPhlAn根据一个物种的泛基因组,确定在一个物种的不同菌株中有无哪些基因,可得到菌株功能及其致病潜能;③ PanPhlAn能识别造成疾病爆发的菌株,且可对已知菌株和新菌株进行鉴定和比较;④ 结合转录组数据,PanPhlAn能分析相应菌株在复杂的群落中的转录活性;⑤ PanPhlAn克服了宏基因组组装相关的局限性,即使对于参考基因组很少的物种,也能很好地进行菌株鉴定。
宏基因组
菌株鉴定
双歧杆菌
SR:为什么双歧杆菌代谢糖类的能力更强?
对47个代表性的双歧杆菌进行基因组分析,发现双歧杆菌与糖代谢吸收有关的基因多于肠道其他菌群,双歧杆菌多糖代谢能力被认为可以反映哺乳动物肠道可用碳的水平,这或许也是双歧杆菌在人体肠道里行使重要作用的机理之一,这篇老文章,强烈推荐大家看一看。
双歧杆菌
糖代谢
碳源
宏基因组
Nature子刊:宏基因组物种分类和定量工具MetaPhlAn2
MetaPhlAn2是基于标记基因的快速物种分类和定量工具,由哈佛大学Curtis Huttenhower团队和意大利特轮托大学Nicola Segata(出自Curtis Huttenhower组)团队共同出品,是MetaPhlAn工具的升级版,截止19年9月4日软件两版累计引用1335(853+482)次。是肠道宏基因组研究中物种组成分析的首选工具。 日报之前报导过的相关工具还有《MGX框架——宏基因组分析的新方法》(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1075688938)、 想要专门分析病毒组,有《Nature子刊:分析病毒组的新工具》(https://www.mr-gut.cn/papers/read/1081676963)等。
宏基因组
宏基因组序列分类
宏基因组
物种分类
标记基因