病毒宏基因组数据

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用于病毒宏基因组数据分析的新工具ViroProfiler

噬菌体通过调节细菌群落，在大多数生态系统的维持和功能中发挥着核心作用。然而，由于缺乏健全的生物信息学标准，目前对其多样性的理解仍然有限。近日，德国亥姆霍兹慕尼黑中心病毒所Li Deng及团队在Gut Microbes发表最新研究，开发了一种用于病毒宏基因组数据分析的新工具ViroProfiler（https://github.com/deng-lab/viroprofiler），可对病毒组数据进行灵活且可重复的分析，并显著缩短处理时间。此外，ViroProfiler可以大大提高病毒组研究中的数据分析质量，并为更标准化地描述复杂生态系统中的病毒群落奠定新基础，值得关注。

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香港城市大学发表有尾噬菌体的科级分类：使用最新的ICTV分类标准评估当前分类工具

国际病毒分类委员会（ICTV）在2022年8月更新了噬菌体分类系统，删除了有尾噬菌体目中多个主要的科，因此，需要对新标准下的分类工具进行全面的审查和比较，以建立最先进的方法。本研究在新标记的数据库上重新训练和测试了四个最近发布的工具并展示了它们的实用性并在多个数据集上进行了测试。该文全面回顾了不同情况下的噬菌体科的分类，并为选择合适的分类学分类流程提供了实用指导。这是在新的 ICTV 分类框架下进行的第一次评估。结果表明，新的科分类框架总体上会产生更好的保守群体，从而使科级分类更加容易。

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