《热心肠日报》2022-2023榜单 | 全球肠道菌群研究五大机构
热心肠小伙伴们 2023-05-19
本篇发布“全球肠道菌群研究五大机构”。

在过去的一年多时间里,全球肠道领域研究继续高歌猛进,取得了颇多令人瞩目的进展。

2023肠道大会来临之际,我们基于《热心肠日报》中收录的2022年5月以来一年期间(2022年5月1日至2023年4月30日)发表的肠道相关领域论文,进行了多维度评选,形成了《热心肠日报》2022-2023年度榜单。

2022年度榜单参评的文章共有3388篇,发表在420个不同的期刊上,累计影响因子达到了82902.36,平均影响因子24.48。其中来自CellNatureScience的文章133篇,来自NEJMLancetJAMA的文章54篇。

本榜单仅代表热心肠研究院基于自身数据所做的优选,可能存在主观因素干扰等不足,仅供参考。欢迎在文末留言提出批评、建议和意见。

 

本篇发布“全球肠道菌群研究五大机构”

 

提示:下述文章点击中文标题可直达热心肠日报,点击英文标题可访问论文官网。


 

图片

哈佛大学

 

2022年5月以来代表性论文(部分)

Nature:用新方法系统性挖掘IBD相关的菌群蛋白

Nature. 2022 Jun;606(7915):754-760.  doi: 10.1038/s41586-022-04648-7

Discovery of bioactive microbial gene products in inflammatory bowel disease

 

Science:微生物高通量单细胞测序,助力在菌株水平上解析肠道菌群

science. 2022 Jun 3;376(6597):eabm1483. doi: 10.1126/science.abm1483.

High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome

 

Nature:Akk菌如何调节免疫?锁定新的关键分子

Nature. 2022 Sep;609(7927):582-589. doi: 10.1038/s41586-022-05181-3. 

Akkermansia muciniphila phospholipid induces homeostatic immune responses

 

Nature:降解胰蛋白酶的肠菌,为肠道健康保驾护航

Nature. 2022 Sep;609(7927):582-589. doi: 10.1038/s41586-022-05181-3. 

Identification of trypsin-degrading commensals in the large intestine

 

杨大平等Cell突破:疼痛感受神经指挥杯状细胞分泌黏液,保护肠屏障

Nature. 2022 Mar;603(7903):907-912. doi: 10.1038/s41586-022-04480-z

Nociceptor neurons direct goblet cells via a CGRP-RAMP1 axis to drive mucus production and gut barrier protection

 

Cell:一个独特的长双歧杆菌分支,在孟加拉儿童断奶期间或有关键作用

Cell. 2022 Oct 27;185(22):4190-4205.e25. doi: 10.1016/j.cell.2022.09.024.

A distinct clade of Bifidobacterium longum in the gut of Bangladeshi children thrives during weaning

 

Cell:母亲菌群塑造孩子肠道菌群的新机制

Cell. 2022 Dec 22;185(26):4921-4936.e15. doi: 10.1016/j.cell.2022.11.023.

Mobile genetic elements from the maternal microbiome shape infant gut microbial assembly and metabolism

 

Cell:新技术助力大规模细菌单细胞RNA测序

Cell. 2023 Feb 16;186(4):877-891.e14. doi: 10.1016/j.cell.2023.01.002. 

Bacterial droplet-based single-cell RNA-seq reveals antibiotic-associated heterogeneous cellular states

 

Nature子刊:肠道菌群代谢5-ASA,降低其对炎症性肠病的疗效

Nat Med. 2023 Mar;29(3):700-709. doi: 10.1038/s41591-023-02217-7. 

Gut microbial metabolism of 5-ASA diminishes its clinical efficacy in inflammatory bowel disease

 

图片

康奈尔大学

 

2022年5月以来代表性论文(部分)

 

Nature:生命早期建立肠道免疫耐受,一类新型抗原呈递细胞很关键

Nature. 2022 Oct;610(7933):752-760. doi: 10.1038/s41586-022-05309-5. 

Novel antigen presenting cell imparts Treg-dependent tolerance to gut microbiota

 

吕梦泽等Nature:ILC3调控菌群特异性Treg建立肠道耐受

Nature. 2022 Oct;610(7933):744-751. doi: 10.1038/s41586-022-05141-x. 

ILC3s select microbiota-specific regulatory T cells to establish tolerance in the gut

 

Cell:胃肠道等癌症中的肿瘤真菌组

Cell. 2022 Sep 29;185(20):3807-3822.e12. doi: 10.1016/j.cell.2022.09.015.

A pan-cancer mycobiome analysis reveals fungal involvement in gastrointestinal and lung tumors

 

张雯等Cell突破:感受疼痛的神经如何调菌群、护肠道

Cell. 2022 Oct 27;185(22):4170-4189.e20. doi: 10.1016/j.cell.2022.09.008. 

Gut-innervating nociceptors regulate the intestinal microbiota to promote tissue protection

 

郭春君等Nature:菊粉如何通过菌群促进2型炎症?

Nature. 2022 Nov;611(7936):578-584. doi: 10.1038/s41586-022-05380-y. 

Inulin fibre promotes microbiota-derived bile acids and type 2 inflammation

 

耶鲁大学

 

2022年5月以来代表性论文(部分)

Nature:肠菌可在宿主内演化出致病的移位能力

Nature. 2022 Jul;607(7919):563-570. doi: 10.1038/s41586-022-04949-x.

Within-host evolution of a gut pathobiont facilitates liver translocation


Cell:胃肠道细菌抢夺膳食抗氧化剂的新机制

Cell. 2022 Nov 23;185(24):4526-4540.e18. doi: 10.1016/j.cell.2022.10.008. 

A microbial transporter of the dietary antioxidant ergothioneine

 

Science:共生菌适应宿主肠道的一种新分子机制

Science. 2023 Mar 17;379(6637):1149-1156. doi: 10.1126/science.abn7229. 

Bacteria require phase separation for fitness in the mammalian gut

 

曹议匀等Science突破:锁定表达新型基因毒素的促肠癌细菌

Science. 2022 Oct 28;378(6618):eabm3233. doi: 10.1126/science.abm3233.

Commensal microbiota from patients with inflammatory bowel disease produce genotoxic metabolites

 

Cell子刊:共生菌的种间互作对宿主免疫具有非线性影响

Cell Host Microbe. 2022 Jul 13;30(7):988-1002.e6. doi: 10.1016/j.chom.2022.05.004.

Interspecies commensal interactions have nonlinear impacts on host immunity

图片

加州大学系统

 

2022年5月以来代表性论文(部分)

Cell:大规模家庭内配对研究,助力揭示多发性硬化与肠道菌群的关系

Cell. 2022 Sep 15;185(19):3467-3486.e16. doi: 10.1016/j.cell.2022.08.021.

Gut microbiome of multiple sclerosis patients and paired household healthy controls reveal associations with disease risk and course

 

Cell:全方位分析癌症真菌组

Cell. 2022 Sep 29;185(20):3789-3806.e17. doi: 10.1016/j.cell.2022.09.005.

Pan-cancer analyses reveal cancer-type-specific fungal ecologies and bacteriome interactions

 

Cell:改造“原住”肠菌,实现对宿主生理的持久影响

Cell. 2022 Aug 18;185(17):3263-3277.e15. doi: 10.1016/j.cell.2022.06.050.

Intestinal transgene delivery with native E. coli chassis allows persistent physiological changes

 

Cell:一文读懂噬菌体疗法(综述)

Cell. 2023 Jan 5;186(1):17-31. doi: 10.1016/j.cell.2022.11.017.

Phage therapy: From biological mechanisms to future directions

 

Science:调控菌群稳态,肠道生理状态很重要(综述)

Science. 2022 Jul;377(6601):eabp9960. doi: 10.1126/science.abp9960. 

The microbiome and gut homeostasis

 

 

图片

斯坦福大学

 

2022年5月以来代表性论文(部分)

Cell:复杂且明确的合成人类肠道菌群模型

Cell. 2022 Sep 15;185(19):3617-3636.e19. doi: 10.1016/j.cell.2022.08.003. 

Design, construction, and in vivo augmentation of a complex gut microbiome

 

Science:巧妙改造皮肤菌,激活免疫助抗癌

Science. 2023 Apr 14;380(6641):203-210. doi: 10.1126/science.abp9563.

Engineered skin bacteria induce antitumor T cell responses against melanoma

 

Science:人类婴幼儿期的肠道菌群多样性

Science. 2022 Jun 10;376(6598):1220-1223. doi: 10.1126/science.abj2972. 

Robust variation in infant gut microbiome assembly across a spectrum of lifestyles

 

Nature子刊:微生物组检测中样本不同保存方式会引起较大偏差?

Nat Biotechnol. 2023 Apr 27. doi: 10.1038/s41587-023-01754-3. 

Quantifying bias introduced by sample collection in relative and absolute microbiome measurements

 

Nature子刊:gutSMASH助力评估肠道菌群特定代谢潜力

Nat Biotechnol. 2023 Feb 13. doi: 10.1038/s41587-023-01675-1. 

gutSMASH predicts specialized primary metabolic pathways from the human gut microbiota

 

相关推荐
评论
热门分类